Loading article…
| ハプログループ L1 | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 107,600～174,300年前[1] |
| 起源地の可能性 | 中央アフリカ |
| 祖先 | L1-6 |
| 子孫 | L1b、L1c |
| 突然変異の定義 | 3666、7055、7389、13789、14178、14560 [2] |
ハプログループL1は、ヒトのミトコンドリアDNA （mtDNA）ハプログループです。中央アフリカと西アフリカで最も一般的です。約14万年前にL1-6から分岐しました（140.6+33.7
−33.0 kya 95% CI）。[3]
その出現は、エミアン期の解剖学的に現代的な人類によるアフリカへの初期の定住と関連しており、現在では主に中央アフリカの狩猟採集民に見られる。
古代DNA
ヨーロッパの人口に見られるマクロハプログループLのサブグループの1%未満の中には、ハプログループL1bが含まれています。ヨーロッパのハプログループL1bは西アフリカでよく見られ、1万年前のものと推定されています。[4]
分布
ハプログループ L1 は、中央アフリカと西アフリカで最も一般的に見られます。最も頻度が高いのはムベンガ族です。以前はより広範囲に分布していたと思われますが、バンツー族の移動（主にハプログループL2と関連）により現在の地域に限定されました。 [5]ハプログループ L1 は、初期キリスト教時代（西暦 550～800 年）のスーダン、クルブナルティ 島の墓地の標本で確認されています。 [6]スペインのカミノ・デ・ラス・イェセラス（マドリード、サンフェルナンド・デ・エナーレス、[I4245 / RISE695] F）の古代ビーカー文化の個体も 、ミトコンドリアハプログループ L1b1a を持っていることが確認されています。[7]
サブクラス
L1c
L1cは約85kyaに出現した。西アフリカと中央アフリカ、特にムベンガ族の間で最も頻度が高い。[8] (地図を参照。[8] ) ムベンガ族では、バ・コラ族の100% 、バ・ベンゼレ族の97% 、ビアカ族の77%がこの遺伝子を持っている。[9] L1cが特に蔓延している他の集団としては、ベドザン（ティカール）族（100%）、ガボン（97%）とカメルーン（90%）のバカ族[10] 、バコヤ族（97%）、バ・ボンゴ族（82%）などがある。[8]サントメ（20%）とアンゴラ（16～24%）でもよく見られる。[11]
L1b
L1bはもっと新しいもので、約1万年前のものです。西アフリカでよく見られます。また、モザンビーク（1%）、エチオピア（2%）、エジプト（1%）、ナイル渓谷（4%）、クン（1%）、カーボベルデ（8%）、セネガル（17～20%）、ニジェール/ナイジェリア（15 %）、ギニアビサウ（11%）、モロッコ（4～5%）、アルジェリア（1～2%）でも発見されています。[12]
系統学
L1 には、L1c と L1b の 2 つのブランチがあります (以前のハプログループ L1d、L1k、L1a、L1f は[年が必要] にL0d、L0k、L0a、L0f としてハプログループ L0 に再分類され、L1e は L5 として再分類されました)。
L1cの系統発生: [2]
- L1c
- L1c1'2'4'6
- L1c1
- L1c1a
- L1c1a1
- L1c1a1a
- L1c1a1a1
- L1c1a1a1a
- L1c1a1a1b
- L1c1a1a1b1
- L1c1a1a2
- L1c1a1a1
- L1c1a1b
- L1c1a1a
- L1c1a2
- L1c1a2a
- L1c1a2a1
- L1c1a2a2
- L1c1a2b
- L1c1a2c
- L1c1a2a
- L1c1a1
- L1c1b'c'd
- L1c1b
- L1c1c'd
- L1c1c
- 1c1d ...
- L1c1a
- L1c2'4
- L1c2
- L1c2a
- L1c2a1
- L1c2a1a
- L1c2a1b
- L1c2a2
- L1c2a1
- L1c2b
- L1c2b1
- L1c2b2
- L1c2a
- L1c4
- L1c4a
- L1c4b
- L1c2
- L1c6
- L1c1
- L1c3
- L1c3a
- L1c3a1
- L1c3a1a
- L1c3b'c
- L1c3b
- L1c3b1
- L1c3b1a
- L1c3b1b
- L1c3b2
- L1c3b1
- L1c3c
- L1c3b
- L1c3a
- L1c1'2'4'6
L1bの系統発生: [2]
- L1b
- L1b1
- L1b1a
- L1b1a1'4
- L1b1a1
- L1b1a4
- L1b1a2
- L1b1a2a
- 189
- L1b1a3
- L1b1a3a
- L1b1a3a1
- L1b1a3a
- L1b1a3
- L1b1a5
- L1b1a6
- L1b1a7
- L1b1a1'4
- L1b1a
- L1b1
参照
ウィキメディア・コモンズには、ハプログループ L1 (mtDNA)に関連するメディアがあります。
参考文献
- ^ Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (2009 年 6 月 4 日)。「精製選択のための補足データ補正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。84 (6): 82–93。doi : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001。PMC 2694979。PMID 19500773。
- ^ abc van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008年10月13日). 「ヒトミトコンドリアDNAの変異に関する包括的系統樹の更新」. Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ 「浄化選択の修正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計補足資料」(PDF)。American Journal of Human Genetics : 82. 2009年。2009年12月29日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。
- ^ Borbély, Noémi (2024). 「カルパティア盆地のハンガリー語圏コミュニティの遺伝的遺産に関する系統学的洞察」(PDF) . Scientific Reports . 14 : 11480. Bibcode :2024NatSR..1411480B. doi :10.1038/s41598-024-61978-4. ISSN 2045-2322. OCLC 10243951083. PMC 11106325 . PMID 38769390. S2CID 269928158.
- ^ シルバ、マリーナ;ファリダ州アルシャマリ。シルバ、ポーラ。カリリョ、カルラ。マンドラテ、フラヴィオ。イエス・トロヴォアダ、マリア。チェルニー、ヴィクトル。ペレイラ、ルイーサ。ソアレス、ペドロ (2015)。 「アフリカの主要なミトコンドリア ハプログループ L2 によって記録された中央アフリカと東部アフリカの間の 60,000 年にわたる相互作用」。科学。議員5 : 12526。ビブコード:2015NatSR...512526S。土井：10.1038/srep12526。PMC 4515592。PMID 26211407。
- ^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). 「IUAES インターコングレス 2016 抄録集 - コミュニティは分裂しているのか? 次世代シーケンシングによる中世クルブナルティのコミュニティゲノムの解明」。IUAESインターコングレス 2016 抄録集。IUAES : 115。
- ^ イニゴ・オラルデ他「ビーカー現象と北西ヨーロッパのゲノム変化」2017年
- ^ abc Quintana-Murci; et al. (2008). 「ピグミー狩猟採集民とバンツー語圏農民の間の深い共通祖先の母方の痕跡と非対称遺伝子流動」。米国科学 アカデミー紀要。105 (5): 1596–601。Bibcode : 2008PNAS..105.1596Q。doi : 10.1073 / pnas.0711467105。PMC 2234190。PMID 18216239。
- ^ Sarah A. Tishkoff 他 2007、「mtDNA と Y 染色体の遺伝的変異から推定されるアフリカのクリック音話者集団の歴史」分子生物学と進化 2007 24(10):2180-2195
- ^ ルイス・キンタナ＝ムルシら。中央アフリカのMtDNAの多様性：狩猟採集から農耕まで。 CNRS-パスツール研究所、パリ
- ^ Batini, Chiara et al 2006、「ヒトミトコンドリア L1c ハプログループの系統地理学: 中央アフリカの先史時代の遺伝的特徴」
- ^ ローザ、アレクサンドラ;他。 （2004年）。 「西アフリカギニア人のMtDNAプロフィール: セネガンビア地域のより良い理解に向けて」(PDF)。人類遺伝学の年代記。68 (4): 340-52。土井：10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x。hdl : 10400.13/3044。PMID 15225159。S2CID 15391342 。 2017 年6 月 5 日に取得。
外部リンク
- PhyloTree.org - mtDNA サブツリー L、van Oven & Kayser M. 2009。
- ハプログループL1の広がり、ナショナルジオグラフィックより
- アフリカのハプログループLのmtDNA配列は時計のような進化の違反を示している
- イアン・ローガンのハプログループ L1b。
- イアン・ローガンのハプログループ L1c。
- L1 YFull MTree 1.02.00 (構築中)