ハルヴァリア

ハルヴァリア
	重要なハルヴァリアのグループ。左上から時計回りに、水カビ(卵菌類)、褐藻類(褐藻類) 、一部の珪藻類(珪藻類)、一部の渦鞭毛藻類(細虫類)、一部の繊毛虫類(繊毛虫類)、およびオパリニド類(ビギラ)。
科学的分類
ドメイン：	真核生物
クレード:	発汗抑制剤
クレード:	ロシア
クレード:	ハルヴァリア; キャバリエスミス 2010
上門と門
	ストラメノパイルス（＝ヘテロコンタ）; アルベオラータミオゾア; 繊毛虫; ;

ハルバリアは、アルベオラータとストラメノパイル類（異コンタ類）を含む原生生物の分類群である。^[2]

2007年と2008年の分析により、ストラメノパイル類とアルベオラータ類は関連があり、側系統群と見られていたクロマルベオラータ類の縮小系統群を形成していることが明らかになった。この2つの系統群は、リザリア類（もともと6つの主要な真核生物群の1つ）とともに、SARスーパーグループと呼ばれる系統群を形成している。^[3]^[4]^[5]

2016年の系統ゲノム解析ではハルバリアに疑問が投げかけられ、新たなリザリアの配列データによりアルベオラータがリザリアの姉妹群（R + A系統群を形成）である可能性が示唆され、ハルバリアを支持する根拠は低分類群のサンプリングと長い枝分かれの誘引によるものである可能性が示唆された。^[6]

しかし、2021年以降の分析では、ハルバリアが確固たる系統群であることが裏付けられています。^[7]

参考文献

^ Cavalier-Smith, Thomas (2017). 「クロミスタ界とその8つの門：ペリプラスチドタンパク質標的化、細胞骨格とペリプラスチドの進化、そして古代の分岐を強調した新たな統合」。プロトプラズマ。255 ( 1 ) : 297–35 7. doi : 10.1007/ s00709-017-1147-3。PMC 5756292。PMID 28875267。
^ Cavalier-Smith, Thomas (2010 年 6 月). 「原生動物界とクロミスタ界、そして真核生物樹のエオゾア根源」.生物学レター. 6 (3): 342–345. doi :10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978 .
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^ Burki, F.; Shalchian-Tabrizi; Pawlowski, J. (2008 年 8 月). 「系統ゲノム解析により、ほとんどの光合成真核生物を含む新しい「メガグループ」が判明」. Biology Letters . 4 (4) : 366–369. doi :10.1098/rsbl.2008.0224. PMC 2610160. PMID 18522922.
^ Kim, E.; Graham, LE (2008年7月). 「EEF2分析はArchaeplastidaとChromalveolataの単系統性に異議を唱える」. PLOS ONE . 3 (7): e2621. doi : 10.1371/journal.pone.0002621 . PMC 2440802. PMID 18612431 .
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[8phyla-1] Cavalier-Smith, Thomas (2017). 「クロミスタ界とその8つの門：ペリプラスチドタンパク質標的化、細胞骨格とペリプラスチドの進化、そして古代の分岐を強調した新たな統合」。プロトプラズマ。255 ( 1 ) : 297–35 7. doi : 10.1007/ s00709-017-1147-3。PMC 5756292。PMID 28875267。

[pmid20031978-2] Cavalier-Smith, Thomas (2010 年 6 月). 「原生動物界とクロミスタ界、そして真核生物樹のエオゾア根源」.生物学レター. 6 (3): 342–345. doi :10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978 .

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[KimGraham2008-5] Kim, E.; Graham, LE (2008年7月). 「EEF2分析はArchaeplastidaとChromalveolataの単系統性に異議を唱える」. PLOS ONE . 3 (7): e2621. doi : 10.1371/journal.pone.0002621 . PMC 2440802. PMID 18612431 .

[ReducingLongBranchAlveolataRhizaria-6] He, D.; Sierra, R.; Pawlowski, J.; Baldauf, SL (2016年8月). 「多タンパク質データにおける長枝効果の低減により、AlveolataとRhizariaの密接な関係が明らかになる」.分子系統学と進化. 101 : 1–7. doi : 10.1016/j.ympev.2016.04.033 . PMID 27132173.

[AMolecularTimescale-7] Strassert, JF; Irisarri, I.; Williams, TA; Burki, F. (2021年3月). 「真核生物の進化の分子タイムスケールと紅藻由来のプラスチドの起源への影響」. Nature Communications . 12 (1): 1879. doi :10.1038/s41467-021-22044-z. PMC 7994803. PMID 33767194 .