HLA-A33

HLA-A33
HLA-A33
（MHCクラスI、細胞表面抗原）
	HLA-A33
について
タンパク質	膜貫通受容体/リガンド
構造	αβヘテロダイマー
サブユニット	HLA-A *33--、β 2 -ミクログロブリン
サブタイプ
サブタイプ
サブタイプ	対立遺伝子
A33	*3301
A33.3	*3303
{{{cNick3}}}	*33{{{cアレル3}}}
{{{cNick4}}}	*33{{{cアレル4}}}
	EBIのIMGT/HLAデータベースへの対立遺伝子のリンク

HLA-A33 (A33) は、HLA-A血清型グループ内のヒト白血球抗原血清型です。血清型は、HLA-A α鎖のα33サブセットの抗体認識によって決定されます^。A33の場合、α「A」鎖はHLA-A *33アレルグループによってコード化され、β鎖はB2M遺伝子座によってコード化されます。^[1] A33とA *33は意味がほぼ同義です。A33は、広域抗原血清型A19の分割抗原です。A33は、 A29、 A30、 A31、 A32、および A74の姉妹血清型です。

A33 はサハラ以南のアフリカでより一般的です。

血清型

A33 の血清型判定率は低いです。

A33周波数

A33は、SSP-PCRのサブタイプ分類機能によって区別できる2つの異なる分布を示しています。

A*3301分布

最初の分布は、新石器時代以降の結果としてヨーロッパに導入された西方分布を持つようです。これは、 A*3301-Cw*0802-B*1402 ハプロタイプ内の連鎖不平衡でよく見られ、特定の例では DRB1 および DQB1 に拡張できます (以下を参照)。この一般的な拡張の源は、パレスチナ人の集団に見られるように、中東またはレバントであるようです。B14 は、B64 (B*1401) と B65 (B*1402) に分かれます。^{[引用が必要]}

A*3303分布

A*3303の分布は集団によって異なります。東アジアの集団のサンプルでは比較的低い頻度で発見されています（韓国人、16.49、ジャワ人、15.61%、ベトナム人、11.5%）。^{[32]これらの頻度は、}マハラシュトラなどの西インドの集団の研究では増加しています。^[33]

A33ハプロタイプ

A33-Cw8-B14-DR1-DQ5

ハプロタイプを扱う場合、連鎖不平衡がランダムであると仮定すると、ハプロタイプの大きさに基づいて平衡の時期を推定できます。AB-DR ハプロタイプは 200 万ヌクレオチド以上の長さです。この長さを考えると、新石器時代に広がった可能性は低いです。より可能性の高い推測は、地中海全域にフェニキア文化とミケーネ文化が広がった初期有史時代です。インド、特に北インドに存在することから、インダス川を渡ってインド・アーリア文化が移住する前に、黒海地域内でこのハプロタイプが広がった可能性があることが示唆されます。このタイプの具体的な命名法は次のとおりです。

A *3301 : C *0802 : B *1402 : DRB1 *0102 : DQA1 *0102 : DQB1 *0501

A33-B44

このハプロタイプはアジアではA33-B58に先行し、DR7-DQ2ハプロタイプを伴っているようです。このハプロタイプには2つのバージョンがあり、おそらく起源は異なります。これは、血清型分類だけに頼るべきではない理由です。最初のハプロタイプはA33-Cw14-B44-DR13-DQ6.4です^[36]

A *3303 : C *1403 : B *4403 : DRB1 *1302 : DQA1 *0102 : DQB1 *0604 : DPB1 *0401

このハプロタイプは日本と韓国で発見されており、韓国では最も一般的な 5 座位 HLA タイプで、4.2% と高く、中国の 25 倍に上ります。日本では 4.8% で、DPB1 の 3.6% まで拡大できます。スーパー B8 ハプロタイプの不均衡レベルは明らかに示していませんが、不均衡レベルは高く、最近の過去のある時期、おそらく日本の弥生時代以前の時期にこれらの地域への大規模な移住があったことを示しています。

A *3303 : C *0701 : B *4403 : DRB1 *0701 : DQA1 *0201? : DQB1 *0202

2番目のハプロタイプは、A33-B58と同様に韓国で発見されているが、日本では発見されていない。^[21]このハプロタイプは、他の一般的なDQ2ハプロタイプであるDQ2.2を持っている。Cw*0701はA*33-B58ハプロタイプに見られ、A33-Cw7と別のB44-DR7ハプロタイプとの組み換えの結果のようなものだ。これらのハプロタイプは、対立遺伝子または低解像度のハプロタイプ情報によって集団関係を解釈するとエラーが発生しやすいことを示し、高解像度のマルチ遺伝子ハプロタイプ研究の必要性を示唆している。

A33-Cw3-B58-DR3-DQ2

東アジアでは、A*3303 は特に 1 つのハプロタイプと連鎖不平衡にあり、特定の遺伝子構成は次のとおりです。

A *3303 : C *0302 : B *5801 : DRB1 *0301 : DQA1 *0501 : DQB1 *0201

パキスタン人の集団における Cw 対立遺伝子が東アジアの集団における C*0302 の対立遺伝子と同じであることは興味深い。バローチのパキスタン人における A33-B58 の 11.1% のうち 8.3% は DR3 およびおそらく DQ2.5 にリンクしている (アフリカ以外では例外はほとんどない)。これはインド亜大陸の周囲に半円を形成するハプロタイプを拡張し、実質的で比較的最近の遺伝的関係を示している。パキスタンのパールシー族は、パキスタンの西端のグループと同様に A33-B58 を欠いている。A33-B58-DR3-DQ2 ハプロタイプは、全体として西アフリカに起源を持つようであり、現在のところアフリカからの出口としてスーダンまたはエチオピア北部、およびインド洋を経由してインダス川西岸に移住した可能性がある。

A33-Cw7-B58-DR13-DQ6

東アジアでは、A*3303 は特に 1 つのハプロタイプと連鎖不平衡にあり、特定の遺伝子構成は次のとおりです。

A *3303 : C *0701 : B *5801 : DRB1 *1302 : DQA1 *0102 : DQB1 *0609

このハプロタイプは、西アフリカの一部で最も頻繁に見られる遺伝子で構成されています。これには、A*3303、B*5801、DRB1*1302、および DQB1*0609 が含まれます。DRB1*0609 ハプロタイプは、ウガンダ、ルワンダ、コンゴ、カメルーンの東/中央アフリカで節目にありますが、対立遺伝子は西ヨーロッパで低頻度であり、その分布は東アフリカからインダス川下流への直接的な移住とも一致しています。

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