HBP1

HBP1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2E6O、3QVE
識別子
エイリアス	HBP1、HMGボックス転写因子1
外部ID	オミム：616714; MGI : 894659;ホモロジーン: 8171;ジーンカード：HBP1; OMA :HBP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	7番染色体（ヒト）
終わり	107,202,522 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	12番染色体（マウス）
終わり	32,000,534 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	アキレス腱; ; 右肺; ; 脚の皮膚; ; 腹部の皮膚; ; 骨髄細胞; ; 脛骨動脈; ; 左精巣; ; 左卵巣; ; 胃粘膜; ; 右精巣;
	トップの表現
	心室中隔; ; 前庭感覚上皮; ; 水晶体上皮; ; 頸動脈小体; ; 吻側回遊流; ; 顆粒球; ; 原腸胚; ; 涙腺; ; 生殖腺隆起; ; 太ももの筋肉;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; タンパク質結合; RNA結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞成分	核; 核質; 核の粒;
生物学的プロセス	転写の調節、DNAテンプレート; Wntシグナル伝達経路; 転写、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIIによる転写の調節;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	26959
	73389
	ENSG00000105856 ; ENSG00000283847
	ENSMUSG00000002996
	O60381
	Q8R316
	NM_001244262 ; NM_012257
	NM_153198 ; NM_177993 ; NM_001361928
	NP_001231191 ; NP_036389
	NP_694878 ; NP_818774 ; NP_001348857
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

HMGボックス転写因子1はHBP1としても知られ、ヒトタンパク質である。^[5]

インタラクション

HBP1はSIN3A ^[6]および網膜芽細胞腫タンパク質^[7]と相互作用することが示されている。

参考文献

^ abc ENSG00000283847 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000105856、ENSG00000283847 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000002996 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「Entrez Gene: HBP1 HMGボックス転写因子1」。
^ Swanson KA、Knoepfler Paul S、Huang Kai、Kang Richard S、Cowley Shaun M、Laherty Carol D、Eisenman Robert N、Radhakrishnan Ishwar (2004 年 8 月)。「HBP1 および Mad1 リプレッサーは、反対のらせん方向で Sin3 コリプレッサー PAH2 ドメインに結合する」。Nat . Struct. Mol. Biol . 11 (8): 738– 46. doi :10.1038/nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594. S2CID 44324333.
^ Lavender P、Vandel L、Bannister AJ、Kouzarides T (1997 年 6 月)。「HMG ボックス転写因子 HBP1 はポケットタンパク質と E1A の標的となる」。Oncogene . 14 ( 22): 2721–8 . doi : 10.1038/sj.onc.1201243 . ISSN 0950-9232. PMID 9178770。

さらに読む

Tevosian SG、Shih HH、Mendelson KG、et al. (1997)。「HBP1: 網膜芽細胞腫ファミリーが標的とする HMG ボックス転写抑制因子」。Genes Dev . 11 (3): 383–96 . doi : 10.1101/gad.11.3.383 . PMID 9030690。
Lavender P、Vandel L、Bannister AJ、Kouzarides T (1997)。「HMGボックス転写因子HBP1はポケットタンパク質とE1Aの標的となる」。Oncogene . 14 ( 22): 2721–8 . doi : 10.1038/sj.onc.1201243 . PMID 9178770。
Zhuma T, Tyrrell R, Sekkali B, et al. (2000). 「ヒトHMGボックス転写因子HBP1：hCD2 LCR機能における役割」. EMBO J. 18 ( 22): 6396– 406. doi :10.1093/emboj/18.22.6396. PMC 1171702. PMID 10562551 .
Lemercier C, Duncliffe K, Boibessot I, et al. (2000). 「ヒストン H10 遺伝子発現における網膜芽細胞腫タンパク質と HBP1 の関与」Mol. Cell. Biol . 20 (18): 6627– 37. doi :10.1128/MCB.20.18.6627-6637.2000. PMC 86159. PMID 10958660 .
Shih HH、Xiu M、Berasi SP、et al. (2001)。「HMG ボックス転写抑制因子 HBP1 は分化肝組織における増殖バリアを維持する」。Mol . Cell. Biol . 21 (17): 5723– 32. doi :10.1128/MCB.21.17.5723-5732.2001. PMC 87292. PMID 11486012 。
Sampson EM、Haque ZK、 Ku MC、et al. (2001)。「転写抑制因子HBP1によるWnt-β-カテニン経路の負の調節」。EMBO J. 20 (16): 4500–11 . doi :10.1093/emboj/20.16.4500. PMC 125566. PMID 11500377 。
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Hillier LW 、 Fulton RS、Fulton LA 、他 (2003)。「ヒト染色体7のDNA配列」。Nature . 424 ( 6945): 157– 64。Bibcode :2003Natur.424..157H。doi : 10.1038/nature01782。PMID 12853948。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
de Chiara C, Kelly G, Frenkiel TA, Pastore A (2004). 「転写因子 HBP1 の AXH ドメインの 1H、13C、および 15N 共鳴の割り当て」J. Biomol. NMR . 28 (4): 411– 2. doi :10.1023/B:JNMR.0000015367.92295.0f. PMID 14872137. S2CID 43367627.
Berasi SP、Xiu M、Yee AS、Paulson KE (2004)。「p47phox 遺伝子の HBP1 抑制: NADPH オキシダーゼによる細胞周期制御」。Mol . Cell. Biol . 24 (7): 3011– 24. doi :10.1128/MCB.24.7.3011-3024.2004. PMC 371097. PMID 15024088 。
Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
Swanson KA、Knoepfler PS、Huang K、et al. (2004)。「HBP1 および Mad1 リプレッサーは、逆のらせん方向で Sin3 コリプレッサー PAH2 ドメインに結合する」。Nat . Struct. Mol. Biol . 11 (8): 738– 46. doi :10.1038/nsmb798. PMID 15235594. S2CID 44324333.
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Yao CJ、Works K、 Romagnoli PA、Austin GE (2005)。「HBP1 の過剰発現が白血病骨髄細胞の増殖と分化に及ぼす影響」。白血病。19 ( 11 ): 1958– 68。doi :10.1038/ sj.leu.2403918。PMID 16179914。S2CID 10030062 。
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173– 8。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi :10.1038/nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Sekkali B、Szabat E、Ktistaki E、et al. (2005)。「ヒト高移動度グループボックス転写因子1は胸腺細胞の発達とトランスジーンの多様性に影響を与える」。J . Immunol . 175 (8): 5203–12 . doi : 10.4049/jimmunol.175.8.5203 . PMID 16210625。
Kim J、Zhang X、Rieger-Christ KM、他 (2006)。「浸潤性乳がん細胞における緑茶化合物 (-)-エピガロカテキン 3-ガレート (EGCG) による Wnt シグナル伝達の抑制。転写抑制因子 HBP1 の必要性」。J . Biol. Chem . 281 (16): 10865– 75. doi : 10.1074/jbc.M513378200 . PMID 16495219。
Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
Zhang X、Kim J、Ruthazer R、et al. (2007)。「HBP1 転写抑制因子は RAS 誘導性早期老化に関与する」。Mol . Cell. Biol . 26 (22): 8252– 66. doi :10.1128/MCB.00604-06. PMC 1636767. PMID 16966377 。

外部リンク

HBP1+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名標目表(MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000283847 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000105856、ENSG00000283847 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000002996 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-5] 「Entrez Gene: HBP1 HMGボックス転写因子1」。

[pmid15235594-6] Swanson KA、Knoepfler Paul S、Huang Kai、Kang Richard S、Cowley Shaun M、Laherty Carol D、Eisenman Robert N、Radhakrishnan Ishwar (2004 年 8 月)。「HBP1 および Mad1 リプレッサーは、反対のらせん方向で Sin3 コリプレッサー PAH2 ドメインに結合する」。Nat . Struct. Mol. Biol . 11 (8): 738– 46. doi :10.1038/nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594. S2CID 44324333.

[pmid9178770-7] Lavender P、Vandel L、Bannister AJ、Kouzarides T (1997 年 6 月)。「HMG ボックス転写因子 HBP1 はポケットタンパク質と E1A の標的となる」。Oncogene . 14 ( 22): 2721–8 . doi : 10.1038/sj.onc.1201243 . ISSN 0950-9232. PMID 9178770。