ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| GPC5 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GPC5、グリピカン5 |
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| 外部ID | オミム:602446; MGI : 1194894;ホモロジーン: 3285;ジーンカード:GPC5; OMA :GPC5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 E4 | 始める | 115,329,647 bp [2] |
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| 終わり | 116,762,591 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 睾丸
- 尾状核
- 被殻
- 内皮細胞
- 側坐核
- 嗅内皮質
- ポンス
- 上前庭核
- 扁桃体
- 外淡蒼球
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| | トップの表現 | - 黒質
- 淡蒼球
- 深部小脳核
- 背側被蓋核
- 耳石器官
- 卵形嚢
- 視床下部室傍核
- 外側視床下部
- 下丘
- 内側前庭核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞外領域
- 膜
- 膜の固定された構成要素
- ゴルジ体腔
- 細胞膜
- リソソーム腔
- 細胞外空間
- 細胞膜の固定成分
- 膜の不可欠な構成要素
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
- 細胞表面
| | 生物学的プロセス |
- グリコサミノグリカンの生合成プロセス
- レチノイド代謝プロセス
- グリコサミノグリカンの分解過程
- シグナル伝達の調節
- 細胞移動
- 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御
- 膜へのタンパク質局在の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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グリピカン5は、ヒトではGPC5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
細胞表面ヘパラン硫酸プロテオグリカンは、膜関連タンパク質コアがさまざまな数のヘパラン硫酸鎖で置換されて構成されています。グリピカン関連膜貫通プロテオグリカンファミリー (GRIPS) のメンバーには、グリコシルホスファチジルイノシトール結合を介して細胞質膜に固定されたコアタンパク質が含まれています。これらのタンパク質は、細胞分裂と成長調節の制御に役割を果たしている可能性があります。[6]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000179399 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022112 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Veugelers M、Vermeesch J、Reekmans G、 Steinfeld R、Marynen P、David G (1997 年 6 月)。「グリピカン 5 の特性と、グリピカン遺伝子ファミリーの新しいメンバーであるヒト GPC5 の染色体局在」。ゲノミクス。40 ( 1): 24–30。doi :10.1006/geno.1996.4518。PMID 9070915 。
- ^ ab "Entrez Gene: GPC5 グリピカン 5".
さらに読む
- De Cat B、David G (2001)。「グリピカンの発達における役割」。Semin . Cell Dev. Biol . 12 (2): 117–25. doi :10.1006/scdb.2000.0240. PMID 11292377。
- Watanabe K, Yamada H, Yamaguchi Y (1995). 「K-グリピカン:発達中の脳と腎臓で高度に発現する新規GPIアンカー型ヘパラン硫酸プロテオグリカン」J. Cell Biol . 130 (5): 1207–18. doi :10.1083/jcb.130.5.1207. PMC 2120559. PMID 7657705 .
- Saunders S、Paine-Saunders S、Lander AD (1997)。「細胞表面プロテオグリカングリピカン-5の発現は腎臓、四肢、脳において発達的に制御されている」(PDF)。Dev . Biol . 190 (1) : 78–93。doi : 10.1006 /dbio.1997.8690。PMID 9331333。S2CID 25320509 。
- Veugelers M、De Cat B、Delande N、et al. (2002)。「染色体13q32上のGPC5/GPC6遺伝子クラスターの4Mb BAC/PACコンティグと完全なゲノム構造」。Matrix Biol . 20 (5–6): 375–85. doi :10.1016/S0945-053X(01)00143-3. PMID 11566272。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Yu W、Inoue J、Imoto I、et al. (2004)。「GPC5 はリンパ腫細胞株で検出された 13q31-q32 増幅の可能性のある標的である」。J. Hum. Genet . 48 (6): 331–5. doi : 10.1007/s10038-003-0026-2 . PMID 12721791。
- Dunham A、Matthews LH、Burton J、他 (2004)。「ヒト染色体 13 の DNA 配列と分析」。Nature 428 ( 6982 ) : 522–8。Bibcode : 2004Natur.428..522D。doi : 10.1038 /nature02379。PMC 2665288。PMID 15057823。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。