分類
天然物、医薬品、または医薬品候補に糖を結合させる従来の方法は、化学的グリコシル化です。この古典的なアプローチでは、通常、重要なアノマー活性化/カップリング反応に加えて、複数の保護/脱保護ステップが必要であり、グリコシル供与体/受容体ペアによっては、アノマーの混合物が生じる可能性があります。古典的な化学的グリコシル化とは異なり、グリコランダム化法は分岐的(つまり、共通の出発物質から分岐する、分岐合成を参照)であり、糖/アグリコンの保護/脱保護や糖のアノマー活性化に依存しません。グリコランダム化/多様化を達成するための2つの相補的な戦略が開発されています。1つは「化学酵素的グリコランダム化」と呼ばれる酵素ベースの戦略、もう1つは「ネオグリコランダム化」として知られる化学選択的な方法です。どちらの方法も、遊離還元糖と標的アグリコンから出発し、標的天然物、医薬品、または医薬品候補に付加された糖のみが異なる化合物のライブラリーを得る。
比較
化学酵素的グリコランダム化とネオグリコランダム化はどちらも遊離還元糖と保護されていないアグリコンを使用するため、古典的なグリコシル化法に比べて顕著な進歩である。酵素的アプローチの顕著な利点は、生体内合成生物学アプリケーションで許容キナーゼ、ヌクレオチジルトランスフェラーゼ、および/またはグリコシルトランスフェラーゼをコードする対応する遺伝子を使用して生体内グリコランダム化を実現することである。[ 19 ]しかし、酵素プラットフォームは使用する酵素の許容性に依存する。対照的に、化学選択的ネオグリコランダム化の主な障害はアルコキシルアミンハンドルの導入である。酵素的アプローチとは異なり、化学選択的方法のアノマー立体選択性は使用する還元糖に依存し、場合によってはアノマー混合物につながる可能性がある。
用途
グリコランダム化は、製薬業界や学術界で、糖を含む天然物のグリコシル化パターンを変更したり、医薬品や医薬品候補に糖を付加したりするために使用されています。これは、天然物類似体の薬理学的特性に対する微妙な糖修飾の影響を迅速に調査する方法を提供し、[ 20 ]創薬への新しいアプローチを提供します。
参考文献
- ↑ Yang, J.; Hoffmeister, D.; Liu, L.; Thorson, JS (2004). "天然物グリコランダム化". Bioorganic & Medicinal Chemistry . 12 (7): 1577–1584 . doi : 10.1016/j.bmc.2003.12.046 . PMID 15112655 .
- ↑ Langenhan, JM; Griffith, BR; Thorson, JS (2005年11月)「ネオグリコランダム化と化学酵素的グリコランダム化:天然物多様化のための2つの補完的なツール」Journal of Natural Products . 68 (11): 1696–711 . Bibcode : 2005JNAtP..68.1696L . doi : 10.1021/np0502084 . PMID 16309329 .
- ↑グリフィス、BR; ランゲンハン、JM; ソーソン、JS (2005年12月)。「グリコランダム化による天然物の甘味化」Current Opinion in Biotechnology 16 ( 6): 622–30 . doi : 10.1016/j.copbio.2005.10.002 . PMID 16226456 .
- ↑ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Thorson, JS (2011年10月)「医薬品および低分子化合物のグリコ(多様化/ランダム化)のための酵素的方法」Natural Product Reports . 28 (11): 1811–53 . doi : 10.1039/c1np00045d . PMID 21901218 .
- ↑ Thibodeaux, CJ; Melançon, CE; Liu, HW (2007年4月26日). 「特異な糖生合成と天然物の糖鎖多様化」. Nature . 446 ( 7139): 1008–16 . Bibcode : 2007Natur.446.1008T . doi : 10.1038/nature05814 . PMID 17460661. S2CID 4404027 .
- ↑マドゥリ、K;ケネディ、J;リヴォラ、G;インベンティ・ソラリ、A;フィリピン人、S;ザヌソ、G;アラバマ州コロンボ。ゲウェイン、ケンタッキー州。オッチ、JL;マクニール、DJ。コロンビア州ハッチンソン(1998年1月)。 「 Streptomyces peucetiusの遺伝子操作株による抗腫瘍薬エピルビシン (4'-エピドキソルビシン) とその前駆体の生産」。ネイチャーバイオテクノロジー。16 (1): 69–74。土井: 10.1038/nbt0198-69。PMID 9447597。S2CID 7304148。
- ↑ Hoffmeister, D; Yang, J; Liu, L; Thorson, JS (2003年11月11日) 「指向性進化による初のアノマーD/L糖キナーゼの創出」米国科学アカデミー紀要100 ( 23): 13184–9 . Bibcode : 2003PNAS..10013184H . doi : 10.1073 / pnas.2235011100 . PMC 263743. PMID 14612558 .
- ↑ Barton, WA; Lesniak, J; Biggins, JB; Jeffrey, PD; Jiang, J; Rajashankar, KR; Thorson, JS; Nikolov, DB (2001年6月)「グリコランダム化への第一歩としてのヌクレオチジルトランスフェラーゼの構造、メカニズム、およびエンジニアリング」Nature Structural Biology . 8 (6): 545–51 . doi : 10.1038/88618 . PMID 11373625 . S2CID 25049013 .
- ↑ Moretti, R; Chang, A; Peltier-Pain, P; Bingman, CA; Phillips GN, Jr; Thorson, JS (2011年4月15日). "指向性進化によるヌクレオチジルトランスフェラーゼRmlAのヌクレオチドおよび糖1-リン酸の非特異性の拡大" . The Journal of Biological Chemistry . 286 (15): 13235– 43. doi : 10.1074/jbc.m110.206433 . PMC 3075670 . PMID 21317292 .
- ↑ Fu, X; Albermann, C; Jiang, J; Liao, J; Zhang, C; Thorson, JS (2003 年 12 月). "抗生物質の最適化:in vitro グリコランダム化による". Nature Biotechnology . 21 (12): 1467–9 . doi : 10.1038/nbt909 . PMID 14608364. S2CID 2469387 .
- ↑ Fu, X; Albermann, C; Zhang, C; Thorson, JS (2005年4月14日). "化学酵素戦略によるバンコマイシンの多様化". Organic Letters . 7 (8): 1513–5 . doi : 10.1021/ol0501626 . PMID 15816740 .
- ↑ Peltier-Pain, P; Marchillo, K; Zhou, M; Andes, DR; Thorson, JS (2012年10月5日). "タンデムグリコシルトランスフェラーゼ触媒の可逆性とネオグリコシル化による天然物二糖類のエンジニアリング" . Organic Letters . 14 (19): 5086–9 . doi : 10.1021/ol3023374 . PMC 3489467 . PMID 22984807 .
- ↑ Williams, GJ; Zhang, C; Thorson, JS (2007年10月)「指向性進化による天然物グリコシルトランスフェラーゼの多機能性の拡大」Nature Chemical Biology . 3 (10): 657–62 . doi : 10.1038/nchembio.2007.28 . PMID 17828251 .
- ↑ Zhang, C; Griffith, BR; Fu, Q; Albermann, C; Fu, X; Lee, IK; Li, L; Thorson, JS (2006年9月1日). "天然物グリコシルトランスフェラーゼ触媒反応の可逆性の利用". Science . 313 ( 5791): 1291–4 . Bibcode : 2006Sci...313.1291Z . doi : 10.1126/science.11 30028. PMID 16946071. S2CID 38072017 .
- ↑ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Cournoyer, WJ; Thorson, JS (2011年8月21日). 「単純なドナーを用いてグリコシルトランスフェラーゼ触媒反応の平衡を制御する」 . Nature Chemical Biology . 7 (10): 685–91 . doi : 10.1038/nchembio.638 . PMC 3177962. PMID 21857660 .
- ↑ Peri, F.; Dumy, P.; Mutter, M. (1998). "ヒドロキシルアミノ誘導体の化学選択的および立体選択的グリコシル化:糖複合体への多用途なアプローチ". Tetrahedron . 54 (40): 12269– 12278. doi : 10.1016/s0040-4020(98)00763-7 .
- ↑ Langenhan, JM; Peters, NR; Guzei, IA; Hoffmann, FM; Thorson, JS (2005年8月30日). 「ネオグリコランダム化による心臓配糖体の抗がん特性の強化」 .米国科学アカデミー紀要. 102 (35): 12305–10 . Bibcode : 2005PNAS..10212305L . doi : 10.1073 / pnas.0503270102 . PMC 1194917. PMID 16105948 .
- ↑ Goff, RD; Thorson, JS (2014年8月1日). "ネオグリコシル化とネオグリコランダム化:新規グリコシル化生物活性プローブと初期段階リードの発見を可能にするツール" . MedChemComm . 5 (8): 1036– 1047. doi : 10.1039/c4md00117f . PMC 4111257 . PMID 25071927 .
- ↑ Williams, GJ; Yang, J; Zhang, C; Thorson, JS (2011年1月21日). "生体内グリコランダム化のための組換え大腸菌プロトタイプ株" . ACS Chemical Biology . 6 (1): 95– 100. doi : 10.1021/cb100267k . PMC 3025069 . PMID 20886903 .
- ↑ Zhang, J; Hughes, RR; Saunders, MA; Elshahawi, SI; Ponomareva, LV; Zhang, Y; Winchester, SR; Scott, SA; Sunkara, M; Morris, AJ; Prendergast, MA; Shaaban, KA; Thorson, JS (2016年12月28日). "化学酵素的グリコシルスキャンによる神経保護性スポキサゾマイシンおよびオキサケリン配糖体の同定" . Journal of Natural Products . 80 (1): 12– 18. doi : 10.1021/acs.jnatprod.6b00949 . PMC 5337260 . PMID 28029796 .