ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
GTF2F2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1BBY、1F3U、2BBY、5IY9、5IYA、5IYC、5IYB、5IY7、5IY8、5IYD、5IY6
識別子 エイリアス GTF2F2 、BTF4、RAP30、TF2F2、TFIIF、一般転写因子IIFサブユニット2 外部ID オミム : 189969; MGI : 1915955; ホモロジーン : 37884; ジーンカード :GTF2F2; OMA :GTF2F2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 14番染色体(マウス) [2] バンド 14|14 D3 始める 76,134,377 bp [2] 終わり 76,248,305 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 生殖腺 心室帯 神経節隆起 アキレス腱 太ももの筋肉 腹部の皮膚 睾丸 脚の皮膚 上腕二頭筋の骨格筋組織 腓腹筋
トップの表現 胚 桑実胚 桑実胚 胚葉上層 胚 子宮 レンズ 受精卵 精子細胞 頸部
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合
ヌクレオチド結合
ヘリカーゼ活性
タンパク質結合
加水分解酵素活性
ATP結合
細胞成分
微小管細胞骨格
核質
転写因子TFIIF複合体
核
転写開始前複合体
生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング
転写の調節、DNAテンプレート
RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長
7-メチルグアノシンmRNAキャッピング
RNAポリメラーゼIIによる転写
RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始の正の制御
転写、DNAテンプレート
ウイルス転写の正の制御
RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写
線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路
RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長の正の制御
RNA代謝プロセス
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
一般転写因子IIFサブユニット2は、ヒトでは GTF2F2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
インタラクション
GTF2F2はPOLR2E [7] および HTATSF1 [8] と 相互作用する ことが示されている 。
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000188342 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000067995 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Heng HH、Xiao H、Shi XM、Greenblatt J、Tsui LC (1994年5月)。「RNAポリメラーゼII転写の一般的な開始因子をコードする遺伝子はヒトゲノム中に分散している」。Hum . Mol. Genet . 3 (1): 61–4. doi :10.1093/hmg/3.1.61. PMID 8162052。
^ 「Entrez Gene: GTF2F2 一般転写因子 IIF、ポリペプチド 2、38kDa」。
^ Wei W, Dorjsuren D, Lin Y, Qin W, Nomura T, Hayashi N, Murakami S (2001年4月). 「転写因子IIF (TFIIF) のサブユニットRAP30とRNAポリメラーゼサブユニット5の直接的な相互作用は、TFIIFとRNAポリメラーゼIIの結合に寄与する」 J. Biol. Chem . 276 (15): 12266–73. doi : 10.1074/jbc.M009634200 . PMID 11278533.
^ Kim JB、Yamaguchi Y、Wada T、Handa H、Sharp PA (1999年9月)。「Tat-SF1タンパク質はRAP30およびヒトSPT5タンパク質と会合する」。Mol . Cell. Biol . 19 (9): 5960–8. doi :10.1128/mcb.19.9.5960. PMC 84462. PMID 10454543 。
さらに読む
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). 「HIV-1 Tat は細胞伸長因子と連携して in vitro でプロセッシビティ因子として機能する」。 Genes Dev . 6 (4): 655–66. doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID 1559613。
Horikoshi M, Fujita H, Wang J, Takada R, Roeder RG (1991). 「RAP30 のヌクレオチドおよびアミノ酸配列」。 Nucleic Acids Res . 19 (19): 5436. doi :10.1093/nar/19.19.5436. PMC 328912 . PMID 1840667.
Sopta M、Burton ZF 、 Greenblatt J (1989) 。 「RNAポリメラーゼIIに結合する一般的な転写開始因子の構造と関連するDNAヘリカーゼ活性」 。Nature。341 ( 6241): 410–4。Bibcode :1989Natur.341..410S。doi : 10.1038/341410a0。PMID 2477704。S2CID 4321793 。
Sopta M、Carthew RW、Greenblatt J (1985)。「哺乳類RNAポリメラーゼIIに結合する3つのタンパク質の単離」。J . Biol. Chem . 260 (18): 10353–60。doi : 10.1016 /S0021-9258(17)39255-4。PMID 3860504 。
Tan S、Aso T、Conaway RC、Conaway JW (1994)。「RNAポリメラーゼIIによる転写開始および伸長における転写因子IIFのRAP30およびRAP74サブユニットの役割」。J . Biol. Chem . 269 (41): 25684–91. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47303-6 . PMID 7929273。
Yonaha M, Aso T, Kobayashi Y, Vasavada H, Yasukochi Y, Weissman SM, Kitajima S (1993). 「ヒト一般転写開始因子 TFIIF のドメイン構造」。 Nucleic Acids Res . 21 (2): 273–9. doi :10.1093/nar/21.2.273. PMC 309103 . PMID 8441635.
Tang H, Sun X, Reinberg D, Ebright RH (1996). 「真核生物の転写開始におけるタンパク質間相互作用: 開始前複合体の構造」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (3): 1119–24. Bibcode :1996PNAS...93.1119T. doi : 10.1073/pnas.93.3.1119 . PMC 40041 . PMID 8577725.
Martin ML、Lieberman PM、Curran T (1996)。「Fos-Jun 二量体化は基本領域と TFIIE-34 および TFIIF との相互作用を促進する」。Mol . Cell. Biol . 16 (5): 2110–8. doi :10.1128/mcb.16.5.2110. PMC 231198. PMID 8628277 。
Fang SM、Burton ZF (1996)。「RNAポリメラーゼII関連タンパク質(RAP)74は転写因子(TF)IIBに結合し、TFIIB-RAP30結合をブロックする」。J . Biol. Chem . 271 (20):11703–9。doi : 10.1074 /jbc.271.20.11703。PMID 8662660 。
Dubrovskaya V、Lavigne AC、Davidson I、Acker J、Staub A、Tora L (1996)。「hTAFII100 の異なるドメインは、転写因子 TFIIF ベータ (RAP30) との機能的相互作用および TFIID 複合体への組み込みに必要である」。EMBO J. 15 ( 14): 3702–12. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00740.x. PMC 452026. PMID 8758937 。
Rowlands JC、McEwan IJ、Gustafsson JA (1996)。「ヒトアリール炭化水素受容体およびアリール炭化水素受容体核転座タンパク質によるトランス活性化:基礎転写因子との直接相互作用」。Mol . Pharmacol . 50 (3): 538–48. PMID 8794892。
Zhou Q、Sharp PA (1996)。「Tat-SF1: HIV-1 Tat による転写伸長の刺激のための補因子」。Science . 274 ( 5287): 605–10。Bibcode : 1996Sci ...274..605Z。doi : 10.1126/science.274.5287.605。PMID 8849451。S2CID 13266489 。
Parada CA、Roeder RG (1996)。「Tat 誘導によるカルボキシ末端ドメインのリン酸化によって誘発される RNA ポリメラーゼ II のプロセッシビティの強化」。Nature。384 ( 6607 ) : 375–8。Bibcode : 1996Natur.384..375P。doi : 10.1038/384375a0。PMID 8934526。S2CID 4278432。
Kojima S, Kobayashi A, Gotoh O, Ohkuma Y, Fujii-Kuriyama Y, Sogawa K (1997). 「GC ボックス結合因子であるヒト BTEB2 の転写活性化ドメイン」 J. Biochem . 121 (2): 389–96. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021600. PMID 9089417.
Cujec TP、Cho H、Maldonado E、Meyer J、Reinberg D、Peterlin BM (1997)。「ヒト免疫不全ウイルストランスアクチベーターTatはRNAポリメラーゼIIホロ酵素と相互作用する」。Mol . Cell. Biol . 17 (4): 1817–23. doi :10.1128/mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429 。
McEwan IJ、Gustafsson J (1997)。「ヒトアンドロゲン受容体トランス活性化機能と一般転写因子TFIIFとの相互作用」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 ( 16): 8485–90。Bibcode : 1997PNAS ... 94.8485M。doi : 10.1073/ pnas.94.16.8485。PMC 22967。PMID 9238003 。
Newberry EP、Latifi T、Battaile JT、 Towler DA (1997)。「Msx2 を介した転写抑制の構造機能解析」。 生化学 。36 ( 34): 10451–62。doi :10.1021/bi971008x。PMID 9265625 。
Liang G、Hai T (1997)。「cAMP 応答エレメント結合タンパク質 (CREB) 結合タンパク質の複数のドメインと相互作用する転写活性化因子であるヒト活性化転写因子 4 の特性」。J . Biol. Chem . 272 (38): 24088–95。doi : 10.1074/ jbc.272.38.24088。PMID 9295363 。
Okamoto T, Yamamoto S, Watanabe Y, Ohta T, Hanaoka F, Roeder RG, Ohkuma Y (1998). 「TFIIEbeta サブユニットの構造機能研究による転写制御における TFIIE の役割の解析」 J. Biol. Chem . 273 (31): 19866–76. doi : 10.1074/jbc.273.31.19866 . PMID 9677423.
外部リンク
GTF2F2+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名表 (MeSH)
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。