ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| GTF2E2 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1D8J、1D8K、5IY9、5IYA、5IYC、5IYB、5IY7、5IY8、5IYD、5IY6 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GTF2E2、FE、TF2E2、TFIIE-B、TTD6、一般転写因子IIEサブユニット2 |
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| 外部ID | オミム: 189964; MGI : 1915403;ホモロジーン: 37573;ジーンカード:GTF2E2; OMA :GTF2E2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 A4 | 始める | 34,221,861 bp [2] |
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| 終わり | 34,267,201 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 膵臓の体
- 右精巣
- 左精巣
- アキレス腱
- 精子
- 生殖腺
- ランゲルハンス島
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 子宮内膜間質細胞
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| | トップの表現 | - 耳板
- 球形嚢
- 精子細胞
- 精母細胞
- 耳小胞
- 胎児の尾
- 原始的な線
- 体節
- 性器結節
- 腹壁
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質結合
- RNA結合
- TFIIHクラス転写因子複合体結合
- RNAポリメラーゼII一般転写開始因子活性
| | 細胞成分 |
- 核
- 転写因子TFIIE複合体
- 核質
- 転写因子TFIID複合体
- 細胞質
- 核の粒
| | 生物学的プロセス |
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001167921 NM_001167922 NM_026584 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001161393 NP_001161394 NP_080860 |
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| 場所 (UCSC) | 8 章: 30.58 – 30.66 Mb | 8 章: 34.22 – 34.27 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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一般転写因子IIEサブユニット2(GTF2E2 )は、転写開始因子IIEサブユニットベータ(TFIIE-ベータ)としても知られ、ヒトではGTF2E2遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000197265 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031585 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: 一般転写因子 IIE」。
さらに読む
- Jeronimo C、Forget D、Bouchard A、Li Q、Chua G、Poitras C、Thérien C、Bergeron D、Bourassa S、Greenblatt J、Chabot B、Poirier GG、Hughes TR、Blanchette M、Price DH、Coulombe B (2007 年 7 月)。「ヒト転写機構のタンパク質相互作用ネットワークの体系的分析により、7SK キャッピング酵素の正体が明らかになりました」。Molecular Cell。27 ( 2 ) : 262–74。doi : 10.1016 /j.molcel.2007.06.027。PMC 4498903。PMID 17643375。
- 田中 明、渡辺 剛、飯田 勇、花岡 文、大熊 勇(2009 年 3 月)。「ヒト TFIIE ベータの中央フォークヘッドドメインは転写開始時に二本鎖 DNA に結合する主要な役割を果たす」。Genes to Cells。14 ( 3 ) : 395–405。doi : 10.1111/ j.1365-2443.2008.01278.x。PMID 19210545。S2CID 36600862 。
- Kang SW、Kuzuhara T、 Horikoshi M (2000 年 4 月) 。 「一般転写開始因子 TFIIE と一般クロマチン因子 SPT16/CDC68 の機能的相互作用」。Genes to Cells。5 (4) : 251–63。doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00323.x。PMID 10792464。S2CID 33454256。
- Langelier MF、Forget D、Rojas A、Porlier Y、Burton ZF、Coulombe B (2001 年 10 月)。「RNA ポリメラーゼ II による転写開始における転写因子 (TF) IIA と TFIIE および TFIIF の構造的および機能的相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 42): 38652–7。doi : 10.1074 / jbc.M106422200。PMC 4492724。PMID 11509574。
- Yamamoto S, Watanabe Y, van der Spek PJ, Watanabe T, Fujimoto H, Hanaoka F, Ohkuma Y (2001 年 1 月)。「線虫 TFIIE 機能の研究により、RNA ポリメラーゼ II の Ser-5 リン酸化と転写開始から伸長への移行との関連が明らかになりました」。分子細胞生物学。21 (1): 1–15。doi : 10.1128 / MCB.21.1.1-15.2001。PMC 86563。PMID 11113176。
- 渡辺 孝文、林 健、田中 明、古本 孝文、花岡 文文、大熊 勇治 (2003 年 4 月)。「TFIIE の小サブユニットのカルボキシ末端は、RNA ポリメラーゼ II による転写開始から伸長への移行を制御する」。 分子細胞生物学。23 (8): 2914–26。doi :10.1128/ mcb.23.8.2914-2926.2003。PMC 152561。PMID 12665589。
- ジャワリ A、ウーリング M、デ カルロ S、十字架 C、トッキーニ ヴァレンティーニ G、モラス D、シュルツ P、ポテルシュマン A (2006 年 5 月)。 「ヒト転写因子TFIIEの構造とオリゴマー状態」。EMBOレポート。7 (5):500-5。土井:10.1038/sj.embor.7400663。PMC 1479554。PMID 16547462。
- Orphanides G、 Lagrange T、Reinberg D (1996 年 11 月)。「RNA ポリメラーゼIIの一般的な転写因子」。 遺伝子と発達。10 (21): 2657–83。doi : 10.1101/gad.10.21.2657。PMID 8946909。
- Kim TK、Ebright RH、 Reinberg D (2000 年 5 月)。「転写因子 IIH による ATP 依存性プロモーター融解のメカニズム」。Science 288 ( 5470): 1418–22。Bibcode : 2000Sci ...288.1418K。doi : 10.1126/science.288.5470.1418。PMID 10827951 。
- 池田 功、ハレ JP、ステルツァー G、マイスターエルンスト M、川上 功 (1998 年 1 月)。「亜鉛フィンガーホメオドメイン転写因子 AREB6 による活性抑制における負の補因子 NC2 の関与」。 分子細胞生物学。18 ( 1): 10–8。doi : 10.1128/mcb.18.1.10。PMC 121442。PMID 9418848。
- Holstege FC、Fiedler U、Timmers HT (1997 年 12 月)。「RNA ポリメラーゼ II 転写複合体の開始時の 3 つの遷移」。EMBOジャーナル 。16 ( 24 ): 7468–80。doi : 10.1093 / emboj /16.24.7468。PMC 1170346。PMID 9405375。
- Cirulli ET、Kasperaviciūte D、Attix DK、Need AC、Ge D、Gibson G、Goldstein DB (2010 年 7 月)。「一般的な遺伝的変異と標準化された認知テストのパフォーマンス」。European Journal of Human Genetics。18 ( 7 ): 815–20。doi :10.1038/ejhg.2010.2。PMC 2987367。PMID 20125193。
- Yu X、Li P、Roeder RG、Wang Z (2001 年 7 月)。「スプリットのアミノ末端エンハンサーによるアンドロゲン受容体介在転写の阻害」。 分子細胞生物学。21 (14): 4614–25。doi : 10.1128 / MCB.21.14.4614-4625.2001。PMC 87125。PMID 11416139。
- 横森 健、 Verrijzer CP、Tjian R (1998 年 6 月)。「TATA ボックス結合タンパク質と転写因子 IIE および IIA の相互作用が DNA 結合と転写を調節する」。 米国科学アカデミー紀要。95 ( 12): 6722–7。Bibcode : 1998PNAS ...95.6722Y。doi : 10.1073 / pnas.95.12.6722。PMC 22611。PMID 9618479。
- Liu L、Ishihara K、Ichimura T、Fujita N、Hino S、Tomita S、Watanabe S、Saitoh N、Ito T、Nakao M (2009 年 2 月)。「MCAF1/AM は、がん関連テロメラーゼ活性の Sp1 媒介維持に関与している」。The Journal of Biological Chemistry 。284 ( 8 ) : 5165–74。doi : 10.1074/ jbc.M807098200。PMID 19106100。
- De Graeve F、Bahr A、Chatton B、Kedinger C (2000 年 3 月)。「転写抑制活性を持つマウス ATFa 関連因子」。Oncogene . 19 ( 14): 1807–19. doi : 10.1038/sj.onc.1203492 . PMID 10777215。
- Okamoto T, Yamamoto S, Watanabe Y, Ohta T, Hanaoka F, Roeder RG, Ohkuma Y (1998 年 7 月)。「TFIIEbeta サブユニットの構造機能研究による転写制御における TFIIE の役割の解析」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 31): 19866–76。doi : 10.1074 /jbc.273.31.19866。PMID 9677423。
- フェステン EA、ストッカーズ PC、ファン ディーメン CC、ファン ボーデグラーフェン AA、ボーゼン HM、クルシウス BJ、オム DW、ファン デル ワウデ CJ、ファン デル ワウデ JC、バルシュン T、フェルスパジェット HW、シュライバー S、デ ヨング DJ、フランケ A、ダイクストラG、ワイメンガ C、ヴェルスマ RK (2 月) 2010)。 「オランダの研究サンプルの遺伝子分析により、より多くの潰瘍性大腸炎感受性遺伝子座が特定され、疾患リスクにおけるそれらの相加的な役割が示されました。」アメリカ消化器病学会誌。105 (2): 395–402。土井:10.1038/ajg.2009.576。PMID 19861958。S2CID 10250290 。