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| FCB上門 | |
|---|---|
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| バクテロイデス属 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| クレード: | FCBグループ |
| 門 | |
| 同義語 | |
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スフィンゴバクテリアキャバリエ・スミス、1987 [1] | |
FCBグループは細菌の上門であり、主要メンバーである線維性細菌門、緑藻門、バクテロイデス門にちなんで名付けられている。メンバーは、保存された特徴的なインデルの数により、系統群を形成すると考えられている。[2]
キャバリエ・スミスは、これに相当するグループをスフィンゴバクテリア門と呼んでいます。この門には、緑藻類、線維性細菌、バクテロイデス類、フラボバクテリア類が含まれます。しかし、この大分類は科学界全体では採用されていません。[3] [4] [5]
PVC グループ/プランクトバクテリアでも同様の状況が見られます。
注記
参照
参考文献
- ^ Cavalier-Smith, T. (1987). 細胞の起源：遺伝子、触媒、膜の共生。Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 52, 805-24, [1], [2]。
- ^ ab Gupta, RS (2004). 「Fibrobacteres、Chlorobi、Bacteroidetes の系統発生とシグネチャー配列特性」。微生物学批評レビュー。30 (2): 123–143。doi : 10.1080 /10408410490435133。PMID 15239383。S2CID 24565648。
- ^ Cavalier-Smith T (2006). 「遷移分析による生命の樹の根源の特定」Biol. Direct . 1:19 . doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID 16834776.
- ^ Krieg, NR; Ludwig, W.; Whitman, WB; Hedlund, BP; Paster, BJ; Staley, JT; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (2010 年 11 月 24 日) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (編)。バクテロイデス、スピロヘータ、テネリクテス (モリクテス)、アシドバクテリア、フィブロバクテリア、フソバクテリア、ディクチオグロミ、ゲマティモナデテス、レンティスファエラ、ヴェルコミクロビア、クラミジア、プランクトミセテス。Bergey's Manual of Systematic Bacteriology。第 4 巻 (第 2 版)。ニューヨーク: Springer。p. 908。ISBN 978-0-387-95042-6大英図書館番号GBA561951。
- ^ LPSNでの分類; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020 年 11 月 1 日)。「命名法で定められた原核生物名のリスト (LPSN) が DSMZ に移動」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。70 (11): 5607–5612。doi : 10.1099 / ijsem.0.004332。
- ^ Emiley A Eloe-Fadrosh 他 2017、「地球規模のメタゲノム調査により地熱温泉に新たな細菌候補門が発見される」Nature Communications 7 · 2016 年 1 月 DOI: 10.1038/ncomms1047
- ^ キルケゴール、ラスムス・ハンセン;デューホルム、モーテン・シモンセン。マキロイ、サイモン・ジョン。ニエリクロ、マルタ。カルスト、ソーレン・マイケル。アルバートセン、マッツ。ニールセン、ペル・ハルクジャー（2016 年 10 月）。 「中温嫌気性消化器に共通する候補門 Hyd24-12 のメンバーに対するゲノムの洞察」。ISMEジャーナル。10 (10): 2352–2364。土井：10.1038/ismej.2016.43。ISSN 1751-7370。PMC 5030696。PMID 27058503。
- ^ 「The LTP」 。 2021年2月23日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2021年2月23日閲覧。
- ^ 「LTP_12_2021 リリースノート」(PDF) 。 2021年2月23日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース07-RS207」。ゲノム分類データベース。 2022年6月20日閲覧。
- ^ "ar53_r207.sp_label".ゲノム分類データベース. 2022年6月20日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2022年6月20日閲覧。
- ^ Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (2016年4月11日). 「生命の樹に対する新たな見方」Nature Microbiology . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID 27572647.