フィブロバクテロタ

フィブロバクター門は 、反芻動物を含む哺乳類の消化管に関連するセルロース分解細菌を含む細菌門である。^{[ 2 ]}フィブロバクター属は1988年にバクテロイデス属から分離された。^{[ 3 ]}

フィブロバクテロタは独立した門として認識されているが、RpoC およびDNA ジャイレース Bタンパク質配列に基づく系統発生学的研究は、それがバクテロイドタ門およびクロロビオタ門と関連していることを示している。^{[ 4 ]}これら 3 つの門の種は、いくつかのタンパク質における保存された特徴的な挿入欠失に基づいて一緒にクラスター化される。^{[ 5 ]}比較ゲノム研究では、2 つの保存された特徴的な挿入欠失（RpoC タンパク質の 5 ～ 7 アミノ酸の挿入とセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼの 13 ～ 16 アミノ酸の挿入）と、これらの門の種に共通する 1 つの特徴的なタンパク質 (PG00081) が特定された。^{[ 6 ]}これらの結果は、フィブロバクテロタ、バクテロイドタ、およびクロロビオタをFCB グループに配置することを支持している。^{[ 4 ] [ 6 ]}

以下の系統樹は、LTP_10_2024の16S rRNA遺伝子系統樹と、GTDBリリースR11-RS232のゲノムベースの系統樹を比較したものです。

GTDB はFibrobacter succinogenes subsp. elongatus をFibrobacter elongatusとして扱い、Fibrobacter intestinalisをHallerella属のHallerella intestinalisとして割り当てています。LPSN は前者をF. succinogenesの亜種として、後者をF. intestinalisとして保持しています。^{[ 11 ] [ 13 ] [ 14 ]}

現在受け入れられている分類体系は、命名法上の地位を有する原核生物名のリスト（LPSN）^{[ 15 ]}と国立生物工学情報センター（NCBI） ^{[ 16 ]}に基づいています。

• キチニスピリルム綱Sorokin et al. 2016
  • キチニスピリルム目Sorokin et al. 2016
    • キチニスピリルム科Sorokin et al. 2016
      • 属Cellulosispirillum Sorokin, Merkel & Khizhniak 2025 ^{[ 17 ]}
        • 種C. alkaliphilum Sorokin, Merkel & Khizhniak 2025
      • キチニスピリルム 属Sorokin et al. 2016
        • 種C. alkaliphilum Sorokin et al. 2016
• キチニビブリオニア綱Sorokin et al. 2014
  • キチニビブリオ目Sorokin et al. 2014
    • キチニビブリオ科Sorokin et al. 2014
      • キチニビブリオ 属Sorokin et al. 2014
        • 種C. alkaliphilus Sorokin et al. 2014
• フィブロバクテリア綱スペイン他 2012
  • フィブロバクター目スペインら、2012年
    • フィブロバクター科（Fibrobacteraceae）スペインら、2012年
      • フィブロバクター 属Montgomery et al. 1988
        • 種F. intestinalis Montgomery et al. 1988
        • 種F. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
          • 亜種F. s. elongatus corrig. Montgomery et al. 1988
          • 亜種F. s. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
      • ハレレラ 属Wylensek et al. 2021年^{[ 14 ]}
        • 種H. porci Wylensek et al. 2021年
        • 種H. succinigenes Wylensek et al. 2021
  • 「カンディダトゥス・フィブリモナダレス」コリッグ。アブドゥル・ラーマンら。 2016年^{[ 18 ]}
    • 「カンジダトゥス・フィブリモナダ科」コルリグ。アブドゥル・ラーマンら。 2016年
      • カンジダトゥス・フィブリモナス属（Ｃｏｒｒｉｇ）。アブドゥル・ラーマンら。 2016年
        • 種「Candidatus Fibrimonas termitidis」corrig。アブドゥル・ラーマンら。 2016年

フィブロバクター門は、バクテロイドータ門とクロロビオタ門も含むFCBグループの一部です。 ^{[ 4 ] [ 6 ]}フィブロバクター属のメンバーは、ウシやブタなどの哺乳類の消化管に存在します。^{[ 19 ]}この属で記載されている2つの種、Fibrobacter succinogenesとFibrobacter intestinalisは、哺乳類の消化管内の繊維分解性コミュニティのメンバーであり、植物繊維を分解する能力について研究されています。

さまざまな環境からの16S rRNA遺伝子の増幅に基づく分子証拠は、この門が当初認識されていたよりも広く分布していることを示唆している。^{[ 20 ] [ 21 ]}これらの研究では、哺乳類環境からのクローンのほとんどが、亜門 1 と呼ばれる既知の分離株とグループ化された。^{[ 21 ]}亜門 2 と呼ばれるグループのメンバーは、シロアリや一部の落葉を食べるゴキブリの腸内で見つかった。^{[ 21 ] [ 22 ] [ 23 ]}亜門 2 のメンバーは、木材を食べるシロアリNasutitermes cornigerの後腸内の繊維関連細菌群集に豊富に存在していた。^{[ 24 ]}

• フィブロバクター・サクシノゲネス
• 候補門TG3
• 細菌の目一覧
• 細菌属のリスト

• Holt JG 編 (1994).バーギー細菌分類マニュアル(第 9 版). Williams & Wilkins. ISBN 978-0-683-00603-2。

• 命名法上の地位を有する原核生物名のリスト–フィブロバクター属
• Systema Naturae 2000分類：Fibrobacteres門（2006年3月14日にWayback Machineにアーカイブ済み）