ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| FBLN2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | FBLN2、フィブリン2 |
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| 外部ID | オミム: 135821; MGI : 95488;ホモロジーン: 1514;ジーンカード:FBLN2; OMA :FBLN2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 D1|6 40.42 cM | 始める | 91,189,437 bp [2] |
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| 終わり | 91,249,522 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右耳介
- 右冠動脈
- 皮下脂肪組織
- 腹部の脂肪
- 左冠動脈
- 心の頂点
- 大静脈
- 伏在静脈
- 心膜
- 脛骨神経
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| | トップの表現 | - 骨髄間質
- 臍帯
- 外頸動脈
- 内頸動脈
- 足首関節
- 脱落膜
- 輸出管
- 足底筋
- 乳腺
- リンパ管の内皮細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- カルシウムイオン結合
- 細胞外マトリックス構造成分
- 細胞外マトリックス結合
- 弾力性を与える細胞外マトリックス成分
| | 細胞成分 |
- 細胞外マトリックス
- 細胞外小胞
- 細胞外エクソソーム
- 細胞外空間
- 細胞外領域
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 細胞基質接着の正の調節
- 細胞外マトリックスの組織化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001004019 NM_001165035 NM_001998 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001004019 NP_001158507 NP_001989 |
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| 場所 (UCSC) | 3 章: 13.55 – 13.64 Mb | 6 章: 91.19 – 91.25 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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フィブリン-2は、ヒトではFBLN2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、フィブリンファミリーに属する細胞外マトリックスタンパク質をコードしています。このタンパク質は、さまざまな細胞外リガンドやカルシウムと結合します。臓器の発達、特に心臓、骨格、神経構造の分化において役割を果たす可能性があります。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されています。[6]
髄膜腫(中枢神経系に影響を及ぼす一般的な腫瘍)のバイオマーカーとしての役割が最近報告され、血液検査によって患者がグレードII髄膜腫(転帰不良)であるかどうかを予測でき、外科的生検を必要とせずにグレードI髄膜腫(転帰良好)ではないことが予測できるようになった。[7]
インタラクション
FBLN2はラミニンα1[8 ] [ 9]、ラミニンα5 [8]、およびパールカン[10] [11]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000163520 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000064080 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Zhang RZ、Pan TC、Zhang ZY、Mattei MG、Timpl R、Chu ML (1995 年 1 月)。「Fibulin-2 (FBLN2): ヒト cDNA 配列、mRNA 発現、およびヒトとマウスの染色体上の遺伝子のマッピング」。Genomics . 22 ( 2): 425– 30. doi :10.1006/geno.1994.1404. PMID 7806230。
- ^ ab EntrezGene 2199 「FBLN2 フィブリン 2 [ ホモ・サピエンス (ヒト) ]」
- ^ Sofela, Agbolahan A.; Hilton, David A.; Ammoun, Sylwia; Baiz, Daniele; Adams, Claire L.; Ercolano, Emanuela; Jenkinson, Michael D.; Kurian, Kathreena M.; Teo, Mario; Whitfield, Peter C.; Sahm, Felix; Hanemann, C. Oliver (2021年1月8日). 「フィブリン-2:グレードIIとグレードIの髄膜腫を区別するための新しいバイオマーカー」. International Journal of Molecular Sciences . 22 (2): 560. doi : 10.3390/ijms22020560 . PMC 7827565 . PMID 33429944.
- ^ ab Utani, A; Nomizu M; Yamada Y (1997年1月). 「Fibulin-2は保存されたアミノ酸配列を介してラミニン-5およびラミニン-1の短腕に結合する」J. Biol. Chem . 272 (5): 2814– 20. doi : 10.1074/jbc.272.5.2814 . PMID 9006922.
- ^ Talts, JF; Sasaki T; Miosge N; Göhring W; Mann K; Mayne R; Timpl R (2000 年 11 月). 「ラミニン α4 鎖の組み換え G ドメインの構造と機能の解析および組織におけるそのタンパク質分解処理」. J. Biol. Chem . 275 (45): 35192–9 . doi : 10.1074/jbc.M003261200 . PMID 10934193.
- ^ Hopf, M; Göhring W; Mann K; Timpl R (2001 年 8 月). 「ニドゲン、フィブリン-2、フィブロネクチン、ヘパリンの結合部位のパールカンの異なる IG モジュールへのマッピング」J. Mol. Biol . 311 (3): 529– 41. doi :10.1006/jmbi.2001.4878. PMID 11493006.
- ^ Sasaki, T; Göhring W; Pan TC; Chu ML; Timpl R (1995年12月). 「マウスおよびヒトのフィブリン-2の細胞外マトリックスリガンドへの結合」J. Mol. Biol . 254 (5): 892– 9. doi :10.1006/jmbi.1995.0664. PMID 7500359.
さらに読む
- Sasaki T, Göhring W, Pan TC, et al. (1996). 「マウスおよびヒト fibulin-2 の細胞外マトリックスリガンドへの結合」J. Mol. Biol . 254 (5): 892– 9. doi :10.1006/jmbi.1995.0664. PMID 7500359.
- Pan TC、Sasaki T、Zhang RZ、他 (1994)。「カルシウム結合のための複数の EGF 様リピートとコンセンサスモチーフを持つ新規細胞外マトリックスタンパク質、フィブリン 2 の構造と発現」。J . Cell Biol . 123 (5): 1269– 77. doi :10.1083/jcb.123.5.1269. PMC 2119879. PMID 8245130 。
- Reinhardt DP、Sasaki T、Dzamba BJ、et al. (1996)。「フィブリリン-1 とフィブリン-2 は相互作用し、一部の組織で共局在する」。J . Biol. Chem . 271 (32): 19489–96 . doi : 10.1074/jbc.271.32.19489 . PMID 8702639。
- Miosge N、Götz W、Sasaki T、他(1996年)。 「ヒト初期胚における細胞外マトリックスタンパク質フィブリン-1およびフィブリン-2」。組織化学。 J. 28 (2): 109–16 .土井:10.1007/BF02331415。PMID 8737292。S2CID 25996538 。
- Collod G、Chu ML、Sasaki T、et al. (1997)。「Fibulin-2: マルファン症候群 2 型における候補遺伝子としての遺伝子マッピングと除外」( PDF )。Eur . J. Hum. Genet。4 ( 5 ): 292– 5。doi : 10.1159/000472216。PMID 8946175。S2CID 9891855。
- Utani A, Nomizu M, Yamada Y (1997). 「フィブリン-2は保存されたアミノ酸配列を介してラミニン-5およびラミニン-1の短腕に結合する」J. Biol. Chem . 272 (5): 2814– 20. doi : 10.1074/jbc.272.5.2814 . PMID 9006922.
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- Brown JC、Sasaki T、Göhring W、et al. (1998)。「パールカンの C 末端ドメイン V は、β1 インテグリンを介した細胞接着を促進し、ヘパリン、ニドゲン、フィブリン-2 に結合し、グリコサミノグリカンによって修飾される可能性がある」。Eur . J. Biochem . 250 (1): 39– 46. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00039.x . PMID 9431988。
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- Hopf M、Göhring W、Mann K、Timpl R (2001)。「ニドゲン、フィブリン-2、フィブロネクチン、ヘパリンの結合部位のパールカンの異なるIGモジュールへのマッピング」。J. Mol. Biol . 311 (3): 529– 41. doi :10.1006/jmbi.2001.4878. PMID 11493006。
- Hunzelmann N、Nischt R、Brenneisen P、他 (2001)。「日光弾性線維症におけるフィブリン-2 の沈着増加と弾性繊維との共局在」。Br . J. Dermatol . 145 (2): 217– 22. doi :10.1046/j.1365-2133.2001.04337.x. PMID 11531782. S2CID 45863539。
- Sasaki T, Göhring W, Mann K, et al. (2002). 「ラミニン5ガンマ2鎖の短腕領域:構造、処理メカニズム、ヘパリンおよびタンパク質への結合」J. Mol. Biol . 314 (4): 751– 63. doi :10.1006/jmbi.2001.5176. PMID 11733994.
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- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.