ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| EYA1 エイヤ1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | EYA1、BOP、BOR、BOS1、OFC1、EYA転写共活性化因子およびホスファターゼ1 |
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| 外部ID | オミム:601653; MGI : 109344;ホモロジーン: 74943;ジーンカード:EYA1; OMA :EYA1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1 A3|1 4.31 cM | 始める | 14,239,178 bp [2] |
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| 終わり | 14,380,459 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 脈絡叢上皮
- 尿道
- 副鼻腔粘膜
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 被殻
- 下垂体
- 気管支上皮細胞
- 尾状核
- 下垂体前葉
- 歯周繊維
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| | トップの表現 | - 前庭感覚上皮
- 性器結節
- 虹彩
- 上顎突出
- 毛様体
- 蝸牛管の前庭膜
- 精管
- 鼻
- 嗅上皮
- 鼻板
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性
- 金属イオン結合
- タンパク質結合
- RNA結合
- タンパク質チロシンホスファターゼ活性
- 加水分解酵素活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- タンパク質-DNA複合体
- 核
- 核質
- 核体
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- パターン指定プロセス
- 電離放射線に対する反応
- ニューロン分化の調節
- 胎児骨格系の形態形成
- 尿管芽の発達
- 細胞運命決定
- 横紋筋組織の発達
- 三半規管の形態形成
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 解剖学的構造の発達
- 上皮細胞増殖の正の調節
- ニューロン運命指定
- 解剖学的構造の形態形成
- DNA修復の正の調節
- タンパク質の脱リン酸化
- 流出路の形態形成
- 耳小胞の形態形成
- 外耳の形態形成
- 聴覚
- 大動脈の形態形成
- タンパク質SUMO化
- 転写、DNAテンプレート
- 耳小胞の発達
- DNA損傷刺激に対する細胞反応
- 多細胞生物の発達
- 耳の形態形成
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 尿管芽の形態形成に関与する分岐
- 蝸牛の形態形成
- 内耳の形態形成
- 中耳の形態形成
- 動物の器官の形態形成
- 二次心臓領域の心芽細胞増殖の正の調節
- ペプチジルチロシン脱リン酸化
- 後腎の発達
- 中胚葉細胞の運命の指定
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 咽頭系の発達
- リガンド不在下での外因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の制御
- 二本鎖切断修復
- DNA修復
- 細胞分化
- クロマチン組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_000503 NM_001288574 NM_001288575 NM_172058 NM_172059
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NM_172060 NM_001370333 NM_001370334 NM_001370335 NM_001370336 |
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NM_001252192 NM_010164 NM_001310459 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_000494 NP_001275503 NP_001275504 NP_742055 NP_742056
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NP_001357262 NP_001357263 NP_001357264 NP_001357265 |
| NP_001239121 NP_001297388 NP_034294 NP_001389588 NP_001389589
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NP_001389590 NP_001389591 |
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| 場所 (UCSC) | 8 章: 71.2 – 71.59 Mb | 1 章: 14.24 – 14.38 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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Eyes Absentホモログ1は、ヒトではEYA1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、EYA(eyes Absent)サブファミリーのタンパク質のメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、腎臓、鰓弓、眼、耳の発達に関与している可能性があります。この遺伝子の変異は、鰓腎異形成症候群、鰓症候群、先天性白内障および眼球前部異常の散発的な症例と関連しています。マウスの同様のタンパク質は、転写活性化因子として作用する可能性があります。この遺伝子には、3つの異なるアイソフォームをコードする4つの転写バリアントが特定されています。[6]
インタラクション
EYA1はSIX1と相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000104313 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025932 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ アブデルハーク S、カラツィス V、ハイリグ R、コンパン S、サムソン D、ヴィンセント C、ワイル D、クルオー C、サーリ I、レイボヴィッチ M、ビトナー=グリンジッチ M、フランシス M、ラコム D、ヴィニュロン J、チャラション R、ボーベン K 、ベッドベダー P、ファン レゲモルター N、ヴァイセンバッハ J、プティ C (3 月) 1997)。 「ショウジョウバエの目の欠損遺伝子のヒト相同体が鰓耳腎(BOR)症候群の根底にあり、新規遺伝子ファミリーを同定する。」ナット・ジュネ。15 (2):157-64。土井:10.1038/ng0297-157。PMID 9020840。S2CID 28527865 。
- ^ ab "Entrez Gene: EYA1 eyes Absent homolog 1 (Drosophila)"。
- ^ Buller, C; Xu X; Marquis V; Schwanke R; Xu PX (2001 年 11 月)。「BOR 症候群における臓器欠陥を引き起こす Eya1 ドメイン変異の分子的影響」。Hum . Mol. Genet . 10 (24)。イギリス: 2775–81。doi : 10.1093 /hmg/ 10.24.2775。ISSN 0964-6906。PMID 11734542 。
さらに読む
- Stoppa-Lyonnet D、Carter PE、Meo T、Tosi M (1990)。「遺伝子内 Alu 反復のクラスターは、ヒト C1 インヒビター遺伝子座に有害な再配列を生じさせる傾向がある」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 87 (4): 1551–5。Bibcode : 1990PNAS ...87.1551S。doi : 10.1073/ pnas.87.4.1551。PMC 53513。PMID 2154751。
- Vincent C、Kalatzis V、Abdelhak S 他(1998年)。 「BOR および BO 症候群は EYA1 の対立遺伝子欠損です。」ユーロ。 J. ハム。ジュネット。5 (4):242-6。土井:10.1159/000484770。PMID 9359046。
- Abdelhak S、Kalatzis V、Heilig R、他 (1998)。「EYA1 の相同領域 (eyaHR) を欠く眼における鰓耳腎 (BOR) 症候群の原因となる変異のクラスター化」。Hum . Mol. Genet . 6 (13): 2247–55. doi : 10.1093/hmg/6.13.2247 . PMID 9361030。
- Pignoni F, Hu B, Zavitz KH, et al. (1998). 「眼の特定タンパク質 So と Eya は複合体を形成し、ショウジョウバエの眼の発達における複数のステップを制御する」. Cell . 91 (7): 881–91. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80480-8 . PMID 9428512. S2CID 269908.
- Kumar S、Kimberling WJ、Weston MD、他 (1998)。「鰓耳腎症候群に関連するヒトEYA1タンパク質における3つの新規変異の同定」。Hum . Mutat . 11 (6): 443–9. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1998)11:6<443::AID-HUMU4>3.0.CO;2-S . PMID 9603436. S2CID 26027737.
- Kalatzis V、Sahly I、El-Amraoui A、Petit C (1999)。「発達中の耳と腎臓におけるEya1発現:Branchio-Oto-Renal(BOR)症候群の病因の理解に向けて」。Dev . Dyn . 213(4):486–99。doi : 10.1002/(SICI)1097-0177(199812)213:4<486::AID-AJA13>3.0.CO;2- L。PMID 9853969。S2CID 20398554 。
- Kumar S、Deffenbacher K、Cremers CW、他 (1999)。「鰓耳腎症候群: 新規変異の特定、分子特性、変異分布、および遺伝子検査の展望」。Genet . Test . 1 (4): 243–51. doi :10.1089/gte.1997.1.243. PMID 10464653。
- Ohto H, Kamada S, Tago K, et al. (1999). 「Eya の核移行を介した six と eya の協力による標的遺伝子の活性化」Mol. Cell. Biol . 19 (10): 6815–24. doi :10.1128/mcb.19.10.6815. PMC 84678. PMID 10490620 .
- Azuma N, Hirakiyama A, Inoue T, et al. (2000). 「先天性白内障および眼球前部異常患者で検出されたショウジョウバエの眼球欠失遺伝子 (EYA1) のヒト相同遺伝子の変異」Hum. Mol. Genet . 9 (3): 363–6. doi : 10.1093/hmg/9.3.363 . PMID 10655545.
- Rickard S、Boxer M、Trompeter R、Bitner-Glindzicz M (2000)。「鰓耳腎症候群および重複表現型における臨床評価と分子検査の重要性」。J . Med. Genet . 37 (8): 623–7. doi :10.1136/jmg.37.8.623. PMC 1734672. PMID 10991693 。
- Rickard S、Parker M、van't Hoff W、他 (2001)。「耳顔頸部 (OFC) 症候群は EYA1 に関連する連続遺伝子欠失症候群です。分子解析により BOR 症候群との対立遺伝子が確認され、さらに Duane 症候群の重要領域が 1 cM に絞り込まれました」。Hum . Genet . 108 (5): 398–403. doi :10.1007/s004390100495. PMID 11409867. S2CID 8451069.
- 難波 明、阿部 誠、新川 秀、他 (2001)。「耳の異常に伴う難聴の遺伝的特徴:PDS および EYA1 変異解析」。J. Hum. Genet . 46 (9): 518–21. doi : 10.1007/s100380170033 . PMID 11558900。
- Fukuda S, Kuroda T, Chida E, et al. (2002). 「EYA1 変異を伴う鰓耳症候群に罹患した家族」Auris Nasus Larynx . 28 Suppl: S7–11. doi :10.1016/s0385-8146(01)00082-7. PMID 11683347.
- Buller C, Xu X, Marquis V, et al. (2002). 「BOR症候群における臓器障害を引き起こすEya1ドメイン変異の分子的影響」Hum. Mol. Genet . 10 (24): 2775–81. doi : 10.1093/hmg/10.24.2775 . PMID 11734542.
- 尾崎 浩、渡辺 勇、池田 健、川上 健 (2002)。「鰓耳腎症候群患者に見られるマウス Eyal 遺伝子変異と Six、Dach、G タンパク質との相互作用障害」。J. Hum. Genet . 47 (3): 107–16. doi : 10.1007/s100380200011 . PMID 11950062。
- Xu PX、Zheng W、Laclef C、et al. (2002)。「Eya1は哺乳類の胸腺、副甲状腺、甲状腺の形態形成に必要である」。Development . 129 (13): 3033–44. doi :10.1242/dev.129.13.3033. PMC 3873877. PMID 12070080 。
- Vervoort VS、Smith RJ、O'Brien J、et al. (2003)。「EYA1 のゲノム再配列は、BOR 症候群の家族の大部分を占める」。Eur . J. Hum. Genet . 10 (11): 757–66. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200877 . PMID 12404110。
- Fougerousse F、Durand M、Lopez S、et al. (2003)。「ヒト体節形成中の Six および Eya 発現と MyoD 遺伝子ファミリーの活性化」。J . Muscle Res. Cell. Motil . 23 (3): 255–64. doi :10.1023/A:1020990825644. PMID 12500905. S2CID 42497614.
- Yashima T, Noguchi Y, Ishikawa K, et al. (2003). 「鰓耳症候群患者におけるEYA1遺伝子の変異」Acta Otolaryngol . 123 (2): 279–82. doi :10.1080/0036554021000028103. PMID 12701758. S2CID 24399383.