ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| エルク4 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1BC7、1BC8、1HBX、1K6O |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ELK4、SAP1、ETS転写因子、ETS転写因子ELK4 |
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| 外部ID | オミム:600246; MGI : 102853;ホモロジーン: 1492;ジーンカード:ELK4; OMA :ELK4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 E4 | 始める | 131,935,345 bp [2] |
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| 終わり | 131,960,350 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 上腕二頭筋の腱
- 結腸上皮
- 精子
- 鼻咽頭上皮
- 太ももの皮
- ヒップの皮膚
- 上腕二頭筋
- 浅側頭動脈
- 壁側胸膜
- 精嚢
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| | トップの表現 | - 球形嚢
- パネートセル
- 耳板
- 半月弁
- 毛包
- 大動脈弁
- 血
- 結膜円蓋
- 胸腺
- 足首
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合
- 配列特異的DNA結合
- クロマチン結合
- 転写共調節活性
- タンパク質結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ヒストンH3の脱アセチル化
- 細胞分化
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | NM_007923 NM_001376954 NM_001376955 NM_001376956 NM_001376957
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NM_001376958 NM_001376959 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001964 NP_068567 NP_068567.1 |
| NP_031949 NP_001363883 NP_001363884 NP_001363885 NP_001363886
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NP_001363887 NP_001363888 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 205.6 – 205.63 Mb | 1 章: 131.94 – 131.96 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ETSドメイン含有タンパク質Elk-4は、ヒトではELK4遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
この遺伝子は、転写因子の Ets ファミリーおよび三元複合体因子 (TCF) サブファミリーのメンバーです。TCF サブファミリーのタンパク質は、c-fos 原癌遺伝子のプロモーター内の血清応答因子および血清応答要素に結合することで三元複合体を形成します。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、キナーゼ、MAPK1 および MAPK8 によってリン酸化されます。この遺伝子にはいくつかの転写バリアントが記述されています。[7]
インタラクション
ELK4 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000158711 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026436 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Shipley J、Sheer D、Dalton S、Treisman R、Patel K (1995 年 3 月)。「ヒト SAP1 (SRF アクセサリ タンパク質 1) 遺伝子と、関連タンパク質をコードする遺伝子 SAP2 の、それぞれ染色体バンド 1q32 と 12q23 へのマッピング」。Genomics . 23 ( 3): 710–1. doi :10.1006/geno.1994.1564. PMID 7851904。
- ^ Giovane A、Sobieszczuk P、Mignon C、Mattei MG、Wasylyk B (1996 年 3 月)。「マウスとヒトのゲノムの 3 つの相同領域における ets サブファミリー メンバー net、elk1、sap1 (ELK3、ELK1、ELK4) の位置」。Genomics . 29 ( 3): 769–72. doi :10.1006/geno.1995.9938. PMID 8575773。
- ^ ab "Entrez Gene: ELK4 ELK4、ETS ドメイン タンパク質 (SRF アクセサリ タンパク質 1)"。
- ^ Chai Y、Chipitsyna G、Cui J、Liao B、Liu S、Aysola K、Yezdani M、Reddy ES、Rao VN (2001 年 3 月)。「c-Fos がん遺伝子調節因子 Elk-1 は BRCA1 スプライスバリアント BRCA1a/1b と相互作用し、乳がん細胞における BRCA1a/1b を介した増殖抑制を強化する」。Oncogene . 20 ( 11): 1357–67. doi : 10.1038/sj.onc.1204256 . PMID 11313879。
- ^ Hassler M、Richmond TJ (2001 年 6 月)。「三元複合体の構造において、B ボックスが SAP-1-SRF 相互作用を支配している」。EMBO J. 20 (12): 3018–28. doi : 10.1093/emboj/20.12.3018. PMC 150215. PMID 11406578 。
- ^ Zhu C, Johansen FE, Prywes R (1997年9月). 「ATF6と血清応答因子の相互作用」. Mol. Cell. Biol . 17 (9): 4957–66. doi :10.1128/MCB.17.9.4957. PMC 232347. PMID 9271374 .
さらに読む
- Sharrocks AD、Brown AL、Ling Y、Yates PR (1998)。「ETSドメイン転写因子ファミリー」。Int . J. Biochem. Cell Biol . 29 (12): 1371–87. doi :10.1016/S1357-2725(97)00086-1. PMID 9570133。
- Wasylyk B、Hagman J、Gutierrez-Hartmann A (1998)。「Ets転写因子:Ras-MAPキナーゼシグナル伝達経路の核エフェクター」。Trends Biochem. Sci . 23 (6): 213–6. doi :10.1016/S0968-0004(98)01211-0. PMID 9644975。
- Dalton S 、 Treisman R (1992)。「血清応答因子によってc-fos血清応答エレメントにリクルートされるタンパク質SAP-1の特性」。Cell 68 ( 3 ): 597–612。doi :10.1016 / 0092-8674(92)90194-H。PMID 1339307。S2CID 26274460。
- Price MA、 Rogers AE、Treisman R (1995)。「三元複合因子 Elk-1、SAP-1a、SAP-2 (ERP/NET) の比較分析」。EMBO J. 14 (11): 2589–601. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07257.x. PMC 398373. PMID 7540136 。
- Adams MD、Kerlavage AR、Fleischmann RD、Fuldner RA、Bult CJ、Lee NH、Kirkness EF、Weinstock KG、Gocayne JD、White O (1995)。「8,300 万ヌクレオチドの cDNA 配列に基づくヒト遺伝子の多様性と発現パターンの初期評価」( PDF )。Nature。377 ( 6547 Suppl): 3–174。PMID 7566098 。
- Dalton S, Treisman R (1994). 「血清応答因子によって c-fos 血清応答エレメントにリクルートされるタンパク質 SAP-1 の特性」(PDF)。Cell。76 (2): 411. PMID 8293474。 2011-09-28 に オリジナル(PDF)からアーカイブ。2011-06-29に取得。
- Janknecht R, Hunter T (1997). 「c-Jun N末端キナーゼ(JNK)ミトゲン活性化タンパク質キナーゼによるSap-1a転写因子の活性化」J. Biol. Chem . 272 (7): 4219–24. doi : 10.1074/jbc.272.7.4219 . PMID 9020136.
- Janknecht R, Hunter T (1997). 「三元複合体因子 Sap-1a における MAP キナーゼ経路の収束」EMBO J. 16 ( 7): 1620–7. doi : 10.1093/emboj/16.7.1620. PMC 1169766. PMID 9130707.
- Stein B、Yang MX、Young DB、Janknecht R、Hunter T、Murray BW、Barbosa MS (1997)。「p38-2、独特の特性を持つ新しいミトゲン活性化タンパク質キナーゼ」。J . Biol. Chem . 272 (31): 19509–17。doi : 10.1074/ jbc.272.31.19509。PMID 9235954。
- Mo Y、Vaessen B、Johnston K、Marmorstein R (1998)。「E74およびc-fosプロモーターからのDNAターゲットに結合したSAP-1の構造:Etsタンパク質によるDNA配列識別の洞察」。Mol . Cell . 2 (2): 201–12. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80130-6 . PMID 9734357。
- Yates PR、Atherton GT、Deed RW 、Norton JD、Sharrocks AD (1999)。「Id ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質は、TCF ETS ドメイン転写因子による核タンパク質複合体の形成を阻害する」。EMBO J. 18 (4): 968–76. doi :10.1093/emboj/18.4.968. PMC 1171189. PMID 10022839 。
- 鎌倉 誠、森口 徹、西田 栄 (1999)。「受容体チロシンキナーゼによるタンパク質キナーゼERK5/BMK1の活性化。核へのシグナル伝達経路の同定と特徴づけ」。J . Biol. Chem . 274 (37): 26563–71. doi : 10.1074/jbc.274.37.26563 . PMID 10473620。
- Chai Y、Chipitsyna G、Cui J、Liao B、Liu S、Aysola K、Yezdani M、Reddy ES、Rao VN (2001)。「c-Fos がん遺伝子調節因子 Elk-1 は BRCA1 スプライスバリアント BRCA1a/1b と相互作用し、乳がん細胞における BRCA1a/1b を介した増殖抑制を強化する」。Oncogene . 20 ( 11): 1357–67. doi : 10.1038/sj.onc.1204256 . PMID 11313879。
- Hassler M、Richmond TJ (2001)。「三元複合体の構造において、B ボックスが SAP-1-SRF 相互作用を支配する」。EMBO J. 20 (12): 3018–28. doi : 10.1093/emboj/20.12.3018. PMC 150215. PMID 11406578 。
- Mo Y、Ho W、Johnston K、Marmorstein R (2002)。「三元SAP-1/SRF/c-fos SRE DNA複合体の結晶構造」。J. Mol. Biol . 314 (3): 495–506. doi :10.1006/jmbi.2001.5138. PMID 11846562。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。