デビッド・サンコフ

デビッド・サンコフ
2013 年、ケベック州ブロモントで開催された「ゲノム進化のモデルとアルゴリズム」に出席した David Sankoff 氏。
生まれる	( 1942-12-31 )1942年12月31日（81歳） モントリオール、ケベック、カナダ
国籍	カナダ人
母校	マギル大学(BSc、MSc、PhD)
知られている	変数ルール分析[要出典] コードスイッチング[要出典] 配列アラインメント[要出典] 核酸の二次構造[要出典] 計算ゲノム科学[要出典]
受賞歴	カナダ王立協会会員（1995年） カナダ研究委員長（2002-2016） ISCBフェロー（2009）[1] ISCB上級科学者賞（2003年）[2] ウェルドン記念賞（2004年）
科学者としてのキャリア
フィールド	ゲノミクス バイオインフォマティクス 言語学 社会言語学[3]
機関	オタワ大学 モントリオール大学 Centre de Recherches 数学 カナダ高等研究院 パプアニューギニア統計局[4]
論文	確率過程としての歴史言語学 （1969）
博士課程の指導教員	ドナルド・アンドリュー・ドーソン[5]
Webサイト	アルバカーキ.バイオインフォマティクス.uottawa.ca

デビッド・サンコフ（1942年12月31日生まれ）は、カナダの数学者、バイオインフォマティクス学者、コンピュータ科学者、言語学者である。オタワ大学数学・統計学部の数理ゲノム科学のカナダ研究員を務め、生物学部と情報技術・工学部を兼任している。科学雑誌 「Language Variation and Change」（ケンブリッジ）^[6]の創刊編集者であり、多くのバイオインフォマティクス、計算生物学、言語学雑誌の編集委員を務めている。^{[7] [8] [9] [10]サンコフは、}計算言語学と計算ゲノム科学における先駆的な貢献で最もよく知られている。^[3]彼はバイオインフォマティクスの創始者の一人と考えられている。特に、計算生物学における配列アライメントやその他の問題に対する動的計画法^[11]の導入に重要な役割を果たした。パベル・ペブズナーの言葉によれば、 ^[2] 「マイケル・ウォーターマンとデビッド・サンコフは、バイオインフォマティクスを、定義が曖昧な問題の『切手コレクション』から、重要な生物学的応用を伴う厳密な学問へと変革した責任を負っている。」

サンコフは1963年にマギル大学で数学の学部生だったときに最初の論文を発表しました^[12]。博士研究から始めて、彼は社会言語学と歴史言語学における多くの重要な概念の数学的定式化を開発しました。その中には、グロットクロノロジー^{[13] 、}可変規則分析（ヘンリエッタ・セダーグレンと共著）^{[14] 、}言語市場[ ^15]、コードスイッチング^[16]が含まれます。

数学の博士号を取得した後、サンコフは1969年にモントリオール大学で研究を開始しました。 1971年に、サンコフは分子配列の比較に興味を持ち^{[11] 、ペアワイズ}配列アライメントのためのニードルマン-ヴンシュアルゴリズムの最初の2次時間版を考案しました。^[17] 1973年に、サンコフとロバート・セダーグレンは5SリボソームRNAの系統発生と多重配列アライメントの共同推定法を開発し^[18]、比較ゲノミクスのアルゴリズムの基礎を築きました。1975年に、サンコフとヴァーツラフ・クヴァータルはランダム入力に対する最長共通部分配列問題の挙動を研究しました。^{[19]この研究で生じた比例定数は}クヴァータル-サンコフ定数として知られるようになりました。 1980年、ロバート・セダーゲンとデビッド・サンコフはモントリオール大学でバイオインフォマティクスの最初の研究グループを設立しました。^{[20]サンコフのバイオインフォマティクスの研究は、} RNAの二次構造、ゲノムの再編成、配列アライメント、ゲノムの進化と系統学を扱っています。^[21]

• 2003年に国際計算生物学会の上級科学者賞を初受賞。 ^[2]
• カナダ王立協会会員に選出（1995年）^[22]
• 2009年に国際計算生物学会よりISCBフェローに選出^[1]
• マルセル・ヴァンサン賞（1977年）^[23]
• オンタリオ優秀研究者賞（2002年）^[22]
• ウェルドン記念賞（2004年）^[24]
• オタワ大学優秀研究賞^[25] (2013)
• テルアビブ大学名誉博士号（2014年）^[26]