| DCP1A |
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| 利用可能な構造物 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| 別名 | DCP1A、HSA275986、Nbla00360、SMAD4IP1、SMIF、脱キャップmRNA 1A |
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| 外部ID | オミム: 607010 ; MGI : 1923151 ;ホモロジーン: 10178 ;ジーンカード: DCP1A ; OMA : DCP1A - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 卵母細胞
- 二次卵母細胞
- 軟骨組織
- 睾丸
- アキレス腱
- 生殖腺
- 腓腹神経
- 前脛骨筋
- 頬粘膜細胞
- ランゲルハンス島
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| | トップは | - 二次卵母細胞
- 接合子
- 一次卵母細胞
- 髄質集合管
- 胚の尾
- 球形嚢
- 耳胞
- 生殖器結節
- 耳板
- 卵丘細胞
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照発現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - 酵素調節活性
- 酵素活性化活性
- タンパク質結合
- mRNA結合
- 加水分解酵素活性
- 同一のタンパク質結合
- キネシン結合
| | 細胞成分 | - 細胞質
- 細胞質
- 膜
- 核
- Pボディ
- 細胞質リボ核タンパク質顆粒
| | 生物学的プロセス | - 触媒活性の正の調節
- 核転写mRNAの脱アデニル化非依存性脱キャップ
- タンパク質の細胞質ストレス顆粒への局在化
- mRNA安定性の調節
- 核転写mRNAの脱アデニル化依存性脱キャップ
- 脱アデニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ分解による異化
- 核転写mRNAの分解過程、ナンセンス変異依存性分解
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | |
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NM_018403 NM_001290204 NM_001290205 NM_001290206 NM_001290207 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001277133 NP_001277134 NP_001277135 NP_001277136 NP_060873 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 3: 53.28 – 53.35 MB | Chr 14: 30.2 – 30.25 Mb |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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mRNA脱キャップ酵素1Aは、ヒトではDCP1A遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ]
脱キャップは、一般的なmRNA分解および制御されたmRNA分解における重要なステップである。この遺伝子によってコードされるタンパク質は脱キャップ酵素である。このタンパク質と別の脱キャップ酵素は脱キャップ複合体を形成し、ナンセンス変異依存性mRNA分解因子hUpf1と相互作用し、早期終止コドンを含むmRNAにリクルートされる可能性がある。このタンパク質はTGF-βシグナル伝達経路にも関与している。[ 5 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000272886 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021962 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- 1 2 "Entrez Gene: DCP1A DCP1脱キャップ酵素ホモログA (S. cerevisiae)" .
- 1 2 Lykke-Andersen J (2002 年 12 月). 「ナンセンス変異依存性分解における hUpf タンパク質に関連するヒト脱キャップ複合体の同定」 . Molecular and Cellular Biology . 22 (23): 8114– 8121. doi : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . PMC 134073 . PMID 12417715 .
- ↑ Eystathioy T、Jakymiw A、Chan EK、Séraphin B、Cougot N、Fritzler MJ (2003 年 10 月)。「GW182 タンパク質は、細胞質 GW ボディ内で mRNA 分解関連タンパク質 hDcp1 および hLSm4 と共局在する」。RNA。9 ( 10 ) : 1171– 1173。doi : 10.1261 / rna.5810203。PMC 1370480。PMID 13130130。
- ↑ Tritschler F、Braun JE、Motz C、Igreja C、Haas G、Truffault V、et al. (2009 年 12 月)。「DCP1は非対称三量体を形成し、後生動物で活性mRNA脱キャップ複合体に組み立てられる」。米国科学アカデミー紀要。106 ( 51 ) : 21591–21596。Bibcode : 2009PNAS..10621591T。doi : 10.1073/ pnas.0909871106。PMC 2789166。PMID 19966221。
- ↑ Tritschler F、Eulalio A、Truffault V、Hartmann MD、Helms S、Schmidt S、et al. (2007 年 12 月)。「EDC3タンパク質の異なる Sm フォールドが DCP1 結合と P ボディ標的化を媒介する」。Molecular and Cellular Biology。27 ( 24): 8600– 8611。doi : 10.1128 / MCB.01506-07。PMC 2169425。PMID 17923697。
- ↑ Steffens A 、 Jaegle B、Tresch A、Hülskamp M、Jakoby M (2014年4月)。 「シロイヌナズナにおけるプロセッシングボディの動きは、ミオシンとDECAPPING PROTEIN1の相互作用に依存する」。Plant Physiology。164 ( 4 ): 1879–1892。doi : 10.1104 / pp.113.233031。PMC 3982750。PMID 24525673。
さらに読む
- Bai RY、Koester C、Ouyang T、Hahn SA、Hammerschmidt M、Peschel C、Duyster J (2002年3月)「SMIF、TGFβシグナル伝達における共活性化因子として機能するSmad4相互作用タンパク質」Nature Cell Biology . 4 (3): 181– 190. doi : 10.1038/ncb753 . PMID 11836524 . S2CID 19938060 .
- Callebaut I (2002 年 5 月). 「TGFβ シグナル伝達における主要な役割を担う EVH1/WH1 ドメイン」 FEBS Letters 519 ( 1– 3): 178– 180. doi : 10.1016/S0014-5793(02)02751-5 . PMID 12023040 . S2CID 84499961 .
- Lykke-Andersen J (2002年12月). 「ナンセンス変異依存性mRNA分解におけるhUpfタンパク質に関連するヒト脱キャップ複合体の同定」 . Molecular and Cellular Biology . 22 (23): 8114– 8121. doi : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . PMC 134073 . PMID 12417715 .
- Ingelfinger D、Arndt-Jovin DJ、Lührmann R、Achsel T (2002 年 12 月)。「ヒト LSm1-7 タンパク質は、mRNA 分解酵素 Dcp1/2 および Xrnl と異なる細胞質焦点で共局在する」。RNA。8 ( 12 ) : 1489–1501。doi : 10.1017 / S1355838202021726。PMC 1370355。PMID 12515382。
- Leonard D 、 Ajuh P、Lamond AI、Legerski RJ (2003 年 9 月)。「hLodestar/HuF2 は CDC5L と相互作用し、pre-mRNA スプライシングに関与する」。Biochemical and Biophysical Research Communications。308 ( 4): 793–801。CiteSeerX 10.1.1.539.8359。doi : 10.1016 / S0006-291X(03 ) 01486-4。PMID 12927788。
- Lehner B、Sanderson CM(2004年7月)。 「ヒトmRNA分解のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。Genome Research。14 ( 7):1315–1323。doi:10.1101 / gr.2122004。PMC 442147。PMID 15231747。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、et al. (2004 年 8 月) 「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性解析」米国科学アカデミー紀要101 (33): 12130– 12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Liu J、Valencia- Sanchez MA、Hannon GJ、Parker R(2005年7月)。「哺乳類Pボディへの標的mRNAのマイクロRNA依存的局在」。Nature Cell Biology。7 ( 7 ):719–723。doi:10.1038 / ncb1274。PMC 1855297。PMID 15937477 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、Hirozane-Kishikawa T、Dricot A、Li N、et al. (2005 年 10 月) 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオーム規模のマップに向けて」Nature . 437 (7062): 1173– 1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Fenger-Grøn M、Fillman C、Norrild B、Lykke-Andersen J (2005年12月) 「複数のプロセシングボディ因子とARE結合タンパク質TTPがmRNA脱キャップを活性化する」。Molecular Cell。20 ( 6 ) : 905–915。doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.031。PMID 16364915。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006年11月) 「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」 Cell . 127 ( 3): 635–648 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .