ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
サイクリンK は、ヒトでは CCNK 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、転写サイクリンファミリーのメンバーです。これらのサイクリンは、 構造変化を介して サイクリン依存性キナーゼ (CDK)との結合と活性化を介して 転写を制御します。 [8] [9] サイクリンパートナーを介してCDKが活性化されると、 リン酸化を介して標的タンパク質を活性化するキナーゼ複合体が生成されます。標的タンパク質は、最終的に 細胞周期 内での細胞の進行の決定を制御します。この遺伝子産物は、CDKと RNAポリメラーゼII (RNAP2)の活性 の両方を制御するという二重の役割を果たしていると考えられます。 [7] サイクリンKは、転写を活性化するためにRNAリクルートメントのみを使用します。 [10]
インタラクション
サイクリンKは、 CDK9 や最新のCDK12、CDK13 を含む複数のCDKと相互作用することが示されています。 [6] [9] 役割には、RNAP2サブユニットのC末端ドメインのリン酸化を助けることが含まれます。 [11] サイクリンKは、関連するプロセッシブ伸長の誘導で最もよく知られています。 [8] また、 G1期 および S 期サイクリン活性と同定されていますが、機能は深く理解されていません。 [5] [12]
サイクリンKはHIVのnefタンパク質とも相互作用する。 [13] 過剰発現したNefタンパク質が存在すると、サイクリンKとCDK9の結合が誘導され、他のCDK9結合複合体の正の伸長因子を阻害し、特定のHIV-1遺伝子発現を阻害する。 [9] [13] CDK13は、NefとともにHIV mRNAスプライシングやGagおよびEnv関連タンパク質の過少発現と相互作用することが特徴である。 [12] [10]
サイクリンKは白血病の増殖に不可欠です。SETD1Aは、FLOSドメインを介してサイクリンKに結合することも知られています。 [14] この相互作用は、DNA損傷応答遺伝子と白血病の増殖に重要であることが示されている。 [10] [14]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000090061 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021258 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ ab Edwards MC、Wong C、Elledge SJ (1998 年 7 月)。「ヒトサイクリン K、カルボキシ末端ドメインキナーゼと Cdk 活性化キナーゼ活性の両方を持つ新規 RNA ポリメラーゼ II 関連サイクリン」。 分子 細胞 生物 学 。18 (7): 4291–300。doi :10.1128/ MCB.18.7.4291。PMC 109013。PMID 9632813 。
^ ab Fu TJ、Peng J、Lee G、Price DH、Flores O (1999 年 12 月)。「サイクリン K は CDK9 調節サブユニットとして機能し、RNA ポリメラーゼ II 転写に関与する」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 49): 34527–30。doi : 10.1074/ jbc.274.49.34527。PMID 10574912 。
^ ab "Entrez Gene: CCNK サイクリン K".
^ ab Baek K, Brown RS, Birrane G, Ladias JA (2007 年 2 月). 「サイクリン依存性キナーゼ 9 の正の調節因子であるヒトサイクリン K の結晶構造」. Journal of Molecular Biology . 366 (2): 563–73. doi :10.1016/j.jmb.2006.11.057. PMC 1852425. PMID 17169370 .
^ abc Greifenberg AK, Hönig D, Pilarova K, Düster R, Bartholomeeusen K, Bösken CA, Anand K, Blazek D, Geyer M (2016年1月). 「Cdk13/Cyclin K複合体の構造と機能の解析」. Cell Reports . 14 (2): 320–31. doi : 10.1016/j.celrep.2015.12.025 . hdl : 11858/00-001M-0000-0029-567D-5 . PMID 26748711.
^ abc Kohoutek J、 Blazek D (2012 年 4 月)。 「 サイクリン K は Cdk12 および Cdk13 と共存する」。 細胞 分裂 。7 :12。doi : 10.1186 /1747-1028-7-12。PMC 3348076。PMID 22512864 。
^ Edwards MC、Wong C、Elledge SJ (1998 年 7 月)。「ヒトサイクリン K、カルボキシ末端ドメインキナーゼと Cdk 活性化キナーゼ活性の両方を持つ新規 RNA ポリメラーゼ II 関連サイクリン」。 分子 細胞 生物 学 。18 ( 7): 4291–300。doi :10.1128/mcb.18.7.4291。PMC 109013。PMID 9632813 。
^ ab Berro R、Pedati C、Kehn-Hall K、Wu W、Klase Z、Even Y、Genevière AM、Ammosova T、Nekhai S、Kashanchi F (2008 年 7 月)。 「CDK13、ウイルス mRNA スプライシングを制御する新しい潜在的なヒト免疫不全ウイルス 1 型阻害因子」。 ウイルス学ジャーナル 。 82 (14): 7155–66。 土井 :10.1128/JVI.02543-07。 PMC 2446983 。 PMID 18480452。
^ ab Khan SZ、Mitra D (2011年7月)。「サイクリンKは、サイクリン依存性キナーゼ9 (CDK9)とサイクリンT1の相互作用をNef依存的に阻害することで、HIV-1遺伝子の発現と複製を阻害する」。The Journal of Biological Chemistry。286 ( 26 ): 22943–54。doi : 10.1074/ jbc.M110.201194。PMC 3123062。PMID 21555514 。
^ ab Hoshii T, Cifani P, Feng Z, Huang CH, Koche R, Chen CW, Delaney CD, Lowe SW, Kentsis A, Armstrong SA (2018年2月). 「SETD1Aの非触媒機能がサイクリンKとDNA損傷応答を制御する」. Cell . 172 (5): 1007–1021.e17. doi :10.1016/j.cell.2018.01.032. PMC 6052445. PMID 29474905 .
さらに読む
Lin X、Taube R、Fujinaga K、Peterlin BM (2002 年 5 月)。「サイクリン K と Cdk9 を含む P-TEFb は RNA を介して転写を活性化できる」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 19): 16873–8。doi : 10.1074/jbc.M200117200。PMID 11884399 。
Mori T, Anazawa Y, Matsui K, Fukuda S, Nakamura Y , Arakawa H (2002). 「サイクリンKはp53腫瘍抑制因子の直接転写標的である」。新生物。4 ( 3 ) : 268–74。doi : 10.1038/ sj.neo.7900235。PMC 1531701。PMID 11988847 。
Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。
Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、Fisk CJ、Li N、Smolyar A、Hill DE、Barabási AL、Vidal M、Zoghbi HY (2006 年 5 月)。「ヒトの遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 ( 4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。
Baek K、Brown RS、Birrane G、Ladias JA (2007 年 2 月)。「サイクリン依存性キナーゼ 9 の正の調節因子であるヒトサイクリン K の結晶構造」。Journal of Molecular Biology。366 ( 2 ): 563–73。doi : 10.1016 /j.jmb.2006.11.057。PMC 1852425。PMID 17169370 。
外部リンク