ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CPNE6 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CPNE6、コピン6 |
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| 外部ID | オミム:605688; MGI : 1334445;ホモロジーン: 81815;ジーンカード:CPNE6; OMA :CPNE6 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 C3 | 始める | 55,747,902 bp [2] |
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| 終わり | 55,754,888 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 側頭葉
- 扁桃体
- 小脳の右半球
- 海馬本体
- 上前頭回
- 右前頭葉
- 側坐核
- 前帯状皮質
- 前頭前皮質
- 被殻
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| | トップの表現 | - CA3フィールド
- 鉤状部
- 歯状回
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 嗅内皮質
- 嗅周囲皮質
- 海馬本体
- 前扁桃体領域
- 海馬のI領域
- 顔面運動核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- カルシウムイオン結合
- トランスポーター活性
- ホスファチジルセリン結合
- タンパク質結合
- カルシウム依存性リン脂質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- エンドソーム
- 核周細胞
- 細胞投影
- 膜
- クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞
- 細胞膜
- 軸索
- 樹状突起
- 細胞外エクソソーム
- 細胞質小胞
- クラスリン被覆小胞
| | 生物学的プロセス |
- カルシウムイオンに対する細胞反応
- 細胞分化
- 脂質代謝
- 神経系の発達
- グリセロリン脂質の生合成過程
- 樹状突起伸長の正の調節
- 小胞輸送
- 化学シナプス伝達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001136057 NM_001146183 NM_009947 NM_001360193 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001129529 NP_001139655 NP_034077 NP_001347122 |
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| 場所 (UCSC) | 14章: 24.07 – 24.08 Mb | 14 章: 55.75 – 55.75 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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コパイン6はヒトではCPNE6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、カルシウム依存性膜結合タンパク質からなるコパインファミリーの脳特異的メンバーをコードしています。遺伝子産物には、2つのN末端C2ドメインと1つのフォン・ヴィレブランド因子Aドメインが含まれています。シナプス可塑性に役割を果たしている可能性があります。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100884 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022212 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Nakayama T, Yaoi T, Yasui M, Kuwajima G (1998年7月). 「N-コピン:神経活動によって発現が調節される2つのC2ドメインを含む新規タンパク質」. FEBS Lett . 428 (1–2): 80–4. doi :10.1016/S0014-5793(98)00497-9. PMID 9645480. S2CID 27969998.
- ^ ab "Entrez Gene: CPNE6 コピン VI (ニューロン)".
外部リンク
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Nakayama T, Yaoi T, Kuwajima G (1999). 「マウス脳におけるN-コピンの局在と細胞内分布」J. Neurochem . 72 (1): 373–9. doi : 10.1046/j.1471-4159.1999.0720373.x . PMID 9886090.
- Nakayama T, Yaoi T, Kuwajima G, et al. (1999). 「2つのC2ドメインタンパク質ファミリーのメンバーであるN-コピンと、骨肉腫で頻繁に増幅される遺伝子の産物であるOS-9とのCa2(+)依存性相互作用」。FEBS Lett . 453 (1–2): 77–80. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00700-0 . PMID 10403379。
- Caudell EG、Caudell JJ、 Tang CH、et al. (2000)。「キナーゼ活性を伴うリン酸化タンパク質としてのヒトコピンIIIの特性評価」。生化学。39 ( 42): 13034–43。doi :10.1021/bi001250v。PMID 11041869 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。