人間の体内に存在するタンパク質
| COL19A1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COL19A1、COL9A1L、D6S228E、コラーゲンXIX型アルファ1、コラーゲンXIX型アルファ1鎖 |
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| 外部ID | オミム:120165; MGI : 1095415;ホモロジーン: 55608;ジーンカード:COL19A1; OMA :COL19A1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 A5 | 始める | 24,300,971 bp [2] |
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| 終わり | 24,626,553 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 睾丸
- 生殖腺
- 胃粘膜
- 内皮細胞
- 鼻咽頭上皮
- 小脳虫部
- 小脳の右半球
- 軟骨組織
- 前脛骨筋
- リンパ節
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| | トップの表現 | - 顔面骨格
- 一次運動野
- リブ
- 大動脈領域の中膜
- 皮膚頭蓋
- 乳頭体
- 後頭骨の外側部分
- CA3フィールド
- 嗅周囲皮質
- 膜状骨
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質高分子アダプター活性
- 細胞外マトリックス構造成分
- 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- 小胞体腔
- コラーゲン
- 細胞外領域
- 細胞外マトリックス
- 細胞外空間
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- コラーゲン分解プロセス
- 多細胞生物の発達
- 骨格系の発達
- 細胞分化
- 筋肉器官の発達
- 骨格筋組織の発達
- 細胞外マトリックスの組織化
- 細胞接着
- 細胞間接着
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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コラーゲンα-1(XIX)鎖は、ヒトではCOL19A1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、FACITコラーゲンファミリー(中断されたらせんを持つ原繊維関連コラーゲン)のメンバーであるタイプXIXコラーゲンのアルファ鎖をコードします。このコラーゲンの機能は不明ですが、このコラーゲンファミリーの他のメンバーはタイプIやIIなどの原繊維形成コラーゲンに関連して発見され、細胞外マトリックスの完全性を維持する役割を果たします。この遺伝子から生成される転写物には、完全に配列されていない異常に大きい3' UTRがあります。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000082293 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026141 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^
- ^ Gerecke DR、Olson PF、Koch M、Knoll JH、Taylor R、Hudson DL、Champliaud MF、Olsen BR、Burgeson RE (1997 年 7 月)。「コラーゲン XII の 2 つのスプライスバリアントの完全な一次構造、およびアルファ 1(XII) コラーゲン (COL12A1)、アルファ 1(IX) コラーゲン (COL9A1)、およびアルファ 1(XIX) コラーゲン (COL19A1) のヒト染色体 6q12-q13 への割り当て」。Genomics。41 ( 2 ) : 236–42。doi :10.1006/geno.1997.4638。PMID 9143499 。
- ^ ab 「Entrez Gene: COL19A1 コラーゲン、タイプ XIX、アルファ 1」。
さらに読む
- Yoshioka H, Zhang H, Ramirez F, et al. (1992). 「ヒトの 6q12-q14 における新規 FACIT 様コラーゲン遺伝子座 (D6S228E) とアルファ 1 (IX) コラーゲン (COL9A1) の遺伝子座のシンテニー」。Genomics . 13 (3): 884–6. doi :10.1016/0888-7543(92)90176-S. PMID 1639419。
- Inoguchi K, Yoshioka H, Khaleduzzaman M, Ninomiya Y (1995). 「FACIT の新しいメンバーであるアルファ 1(XIX) コラーゲン鎖の mRNA には、長い異常な 3' 非翻訳領域が含まれており、多くのユニークなスプライシングバリアントが見られます」。J . Biochem . 117 (1): 137–46. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124700. PMID 7775380。
- Myers JC、Yang H、D'Ippolito JA、他 (1994)。「ヒト XIX 型コラーゲンの三重らせん領域は複数のコラーゲンサブドメインから構成され、アルファ 1(XVI) と限定的な配列相同性を示す」。J . Biol. Chem . 269 (28): 18549–57. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32344-X . PMID 8034603。
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- 住吉 秀、井口 功、Khaleduzzaman M、他 (1997)。「マウスの胚発生中のα1(XIX)コラーゲン遺伝子 (Col19a1) の普遍的な発現は、成体生物ではいくつかの組織に限定される」。J . Biol. Chem . 272 (27): 17104–11. doi : 10.1074/jbc.272.27.17104 . PMID 9202028。
- Khaleduzzaman M、Sumiyoshi H、Ueki Y、他 (1998)。「ヒト XIX 型コラーゲン (COL19A1) 遺伝子の構造は、FACIT ファミリーの祖先遺伝子から発生したことを示唆している」。Genomics . 45 ( 2): 304–12. doi :10.1006/geno.1997.4921. PMID 9344653。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Myers JC、Li D、Amenta PS、et al. (2003)。「ヒト臍帯から精製されたタイプ XIX コラーゲンは、コラーゲンサブドメインを区切る複数の鋭い折れ曲がりと、球状、ジスルフィド結合、ヘパリン結合アミノ末端を介した分子間凝集体によって特徴付けられる」。J . Biol. Chem . 278 (34): 32047–57. doi : 10.1074/jbc.M304629200 . PMID 12788917。
- Mungall AJ 、Palmer SA、Sims SK、他 (2003)。「ヒト染色体6のDNA配列と分析」。Nature 425 ( 6960 ) : 805–11。Bibcode :2003Natur.425..805M。doi : 10.1038/ nature02055。PMID 14574404 。
- Käylä J、Jäälinoja J、Tulla M、他。 (2005)。 「線維結合コラーゲン IX は、軟骨基質への細胞接着のための新しいメカニズムを提供します。」J.Biol.化学。279 (49): 51677–87。土井:10.1074/jbc.M409412200。PMID 15383545。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。