人間の体内に存在するタンパク質
COL16A1 識別子 エイリアス COL16A1、447AA 、FP1572、コラーゲンXVIアルファ1、コラーゲンXVIアルファ1鎖 外部ID オミム ：120326; MGI : 1095396; ホモロジーン : 1397; ジーンカード ：COL16A1; OMA :COL16A1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体4（マウス） [2] バンド 4|4 D2.2 始める 129,941,633 bp [2] 終わり 129,993,076 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 脛骨 軟骨組織 左卵巣 子宮頸管 腓骨神経 C1セグメント 右卵巣 右冠動脈 子宮体部 歯周繊維
トップの表現 大腿骨体 臍帯 頭蓋冠 精管 精細管 子宮 リップ 精母細胞 輸出管 真皮
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
インテグリン結合 タンパク質結合 細胞外マトリックス構造成分 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分 細胞成分
細胞外領域 コラーゲンXVI型三量体 コラーゲン 小胞体腔 細胞外マトリックス 細胞外空間 コラーゲン含有細胞外マトリックス 生物学的プロセス
アミノ酸刺激に対する細胞反応 インテグリンを介したシグナル伝達経路 女性の妊娠 接着斑集合体の正の調節 インテグリン活性化 細胞接着 細胞外マトリックスの組織化 インテグリンを介した細胞接着 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq (タンパク質) NP_082542 NP_001391281 NP_001391282
場所 (UCSC) 1 章: 31.65 – 31.7 Mb 4 章: 129.94 – 129.99 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
コラーゲンα-1(XVI)鎖は、 ヒトでは COL16A1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、FACITコラーゲンファミリー（中断されたらせんを持つ原線維関連コラーゲン）のメンバーであるXVI型コラーゲンのα鎖をコードしています。このコラーゲンファミリーのメンバーは、I型やII型などの原線維形成コラーゲンに関連して見られ、 細胞外マトリックスの完全性を維持する役割を果たしています。 線維芽細胞 と ケラチノサイト 、平滑筋と 羊膜 には、高レベルのXVI型コラーゲンが見つかっています 。 [6]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000084636 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040690 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Pan TC, Zhang RZ, Mattei MG, Timpl R, Chu ML (1992年8月). 「ヒトα1(XVI)コラーゲンのクローニングと染色体位置」 Proc Natl Acad Sci USA . 89 (14): 6565– 9. Bibcode :1992PNAS...89.6565P. doi : 10.1073/pnas.89.14.6565 . PMC 49542 . PMID 1631157. ^ ab 「Entrez Gene: COL16A1 コラーゲン、タイプ XVI、アルファ 1」。
さらに読む
Yamaguchi N, Kimura S, McBride OW, Hori H, Yamada Y, Kanamori T, Yamakoshi H, Nagai Y (1993). 「反復コラーゲンドメインとシステイン含有非コラーゲンセグメントからなる新規コラーゲン鎖α1(XVI)の分子クローニングと部分的特性評価」 J. Biochem . 112 (6): 856– 63. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123989. PMID 1284248. Ratzinger S、Grässel S、Dowejko A、Reichert TE 、 Bauer RJ (2011)。「XVI型コラーゲン発現の誘導は口腔癌細胞の増殖を促進する」。Matrix Biology。30 ( 2): 118– 25。doi :10.1016/ j.matbio.2011.01.001。PMID 21251976 。 Sires UI、Dublet B、Aubert-Foucher E、van der Rest M、Welgus HG (1995)。「92kDa ゼラチナーゼによるタイプ XIV コラーゲンの COL1 ドメインの分解」。J . Biol. Chem . 270 (3): 1062–7 . doi : 10.1074/jbc.270.3.1062 . PMID 7836360。 Tillet E、Mann K、Nischt R、Pan TC、Chu ML、Timpl R (1995)。「ヒトα1（XVI）コラーゲンの組み換え分析。N末端球状ドメインの処理の証拠」。Eur . J. Biochem . 228 (1): 160– 8. doi :10.1111/j.1432-1033.1995.tb20245.x. PMID 7882999。 Grässel S, Timpl R, Tan EM, Chu ML (1997). 「ヒト線維芽細胞および平滑筋細胞におけるタイプ XVI コラーゲンの生合成と処理」 Eur. J. Biochem . 242 (3): 576– 84. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0576r.x . PMID 9022684. Ratzinger S、Grässel S、Dowejko A、Reichert TE 、 Bauer RJ (2011 年 3 月)。「XVI 型コラーゲン発現の誘導は口腔癌細胞の増殖を促進する」。Matrix Biology。30 ( 2): 118– 25。doi :10.1016/ j.matbio.2011.01.001。PMID 21251976 。 Kassner A, Hansen U, Miosge N, Reinhardt DP, Aigner T, Bruckner-Tuderman L, Bruckner P, Grässel S (2004). 「コラーゲン XVI の組織特異的コラーゲン原線維またはビーズ状ミクロ原線維への個別統合」. Matrix Biol . 22 (2): 131– 43. doi :10.1016/S0945-053X(03)00008-8. PMID 12782140. Kassner A、Tiedemann K、Notbohm H、Ludwig T、Mörgelin M、Reinhardt DP、Chu ML、Bruckner P、Grässel S (2004)。「組み換えヒト XVI 型コラーゲンの分子構造と相互作用」。J . Mol. Biol . 339 (4): 835– 53. doi :10.1016/j.jmb.2004.03.042. PMID 15165854。 Eble JA、Kassner A、Niland S、Mörgelin M、Grifka J、Grässel S (2006)。「コラーゲン XVI は C 末端ドメインにインテグリン α1 β1 認識部位を持つ」。J . Biol. Chem . 281 (35): 25745– 56. doi : 10.1074/jbc.M509942200 . PMID 16754661。
外部リンク 「COL16A1（コラーゲン、タイプXVI、アルファ1）」。
