
分子生物学および遺伝学において、ブロットとは、大きな生体分子(タンパク質、DNA、RNA )をニトロセルロース、ポリフッ化ビニリデン、ナイロンなどの膜などのキャリアに転写する方法である。多くの場合、これはゲル電気泳動の後に行われ、分子をゲルからブロッティング膜に転写するか、サンプルを直接膜に追加します。ブロッティング後、転写された分子は、色素染色(タンパク質の銀染色など)、放射性標識分子のオートラジオグラフィー可視化(ブロットの前に実行)、または一部のタンパク質または核酸の特異的標識によって視覚化されます。後者は、ブロットの一部の分子にのみ結合し、酵素が結合している抗体またはハイブリダイゼーションプローブを使用して行われます。適切に洗浄した後、この酵素活性(およびブロット中に見られる分子)は適切な試薬とともにインキュベートすることで可視化され、ブロット上に色のついた沈着物が形成されるか、または写真フィルムに記録される化学発光反応が生じます。
サザンブロット
サザンブロット法は、分子生物学においてDNAサンプル中の特定のDNA配列を検出するために日常的に使用される手法である。サザンブロット法は、電気泳動で分離されたDNA断片をフィルター膜に転写し、その後プローブハイブリダイゼーションによって断片を検出する手法である。[1]
ウェスタンブロット
ウェスタンブロットは、複雑なサンプル内の特定のタンパク質を検出するために使用されます。タンパク質は、まず電気泳動を使用してサイズ別に分離され、その後適切なブロッティングマトリックス(通常はポリフッ化ビニリデンまたはニトロセルロース)に転写され、抗体で検出されます。
ファーウェスタンブロット
ウエスタンブロットと同様に、ファーウエスタンブロットはタンパク質間の相互作用を利用して、ブロットマトリックス上に固定された特定のタンパク質の存在を検出します。次に抗体を使用してタンパク質間複合体の存在を検出するため、ファーウエスタンブロットはウエスタンブロットの特殊なケースとなります。
サウスウェスタンブロット
サウスウェスタンブロットはサザンブロットに基づいており 、特定のオリゴヌクレオチドプローブに結合する能力によってDNA結合タンパク質を識別および特徴付けるために使用されます。[2]タンパク質はゲル電気泳動によって分離され、その後、他のタイプのブロットと同様にニトロセルロース膜に転写されます。
イースタンブロット
イースタンブロットは、タンパク質の特定の翻訳後修飾を検出するために使用されます。タンパク質はゲル電気泳動によって分離され、ブロッティングマトリックスに転写され、特定の基質(コレラ毒素、コンカナバリン、リンモリブデン酸など)または抗体によって翻訳後修飾が検出されます。[3]
極東の汚点
ファーイースタンブロットは脂質結合オリゴ糖の検出に使用されます。高性能薄層クロマトグラフィーは、まず脂質を物理的および化学的特性によって分離するために使用され、次にブロッティングマトリックスに転送されてから、オリゴ糖が特定の結合タンパク質(抗体またはレクチン)によって検出されます。
ノーザンブロット
ノーザンブロットは、複雑なサンプル内の特定の RNA 配列を検出するためのものです。ノーザンブロットでは、まずゲル電気泳動によってサンプルをサイズ別に分離し、その後、サンプルをブロットマトリックスに移して、標識された RNA プローブで検出します。
逆ノーザンブロット
リバースノーザン ブロットは、 DNA が最初にブロッティング マトリックス上に固定され、特定の配列がラベル付けされた RNA プローブで検出される点で、ノーザン ブロットやサザン ブロットの両方とは異なります。
ドットブロット
ドットブロットは、ブロットの前に電気泳動によってサンプルを分離するのではなく、分析対象物がブロット マトリックスに直接追加され (「ドット」として表示されます)、上記のブロットの特殊なケースです。
ブロット一覧
- DNAのサザンブロット
- RNAのノーザンブロット
- RNAの逆ノーザンブロット
- タンパク質のウェスタンブロット
- タンパク質間相互作用のファーウェスタンブロット
- 翻訳後修飾のイースタンブロット
- 糖脂質のファーイースタンブロット
- ドットブロット
参照
参考文献
- ^ Towbin, Staehelin T, Gordon J, et al. (1979). 「ポリアクリルアミドゲルからニトロセルロースシートへのタンパク質の電気泳動転写:手順といくつかの応用」. PNAS . 76 (9): 4350–4 . Bibcode :1979PNAS...76.4350T. doi : 10.1073/pnas.76.9.4350 . PMC 411572. PMID 388439 .
- ^ Bowen B、Steinberg J、Laemmli UK、Weintraub H (1980年1月)。「タンパク質ブロッティングによるDNA結合タンパク質の検出」。Nucleic Acids Res 8 (1): 1– 20. doi :10.1093/nar/8.1.1. PMC 327239 . PMID 6243775。
- ^ Thomas、Thirumalapura N、Crossley EC、Ismail N、Walker DH 、 et al. (2009). 「Ehrlichia における抗原タンパク質の修飾」。寄生虫免疫学。31 (6): 296– 303. doi :10.1111/j.1365-3024.2009.01099.x. PMC 2731653 . PMID 19493209.
