アルファ/ベータ加水分解酵素スーパーファミリー

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

	細菌リパーゼ、このファミリーのメンバーの1つ
識別子
シンボル	アブヒドロラーゼ_1
パム	PF00561
ファム一族	CL0028
エコド	7579.1.1
インタープロ	著作権
SCOP2	1ede / スコープ / SUPFAM
OPMスーパーファミリー	127
OPMタンパク質	1qge
医療機器	cl21494
メンブラノーム	300
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

α /β加水分解酵素スーパーファミリーは、系統学的起源と触媒機能が大きく異なる加水分解酵素のスーパーファミリーであり、共通のフォールドを共有している。^[1]各酵素の核はα/βシート（バレルではなく）であり、 6つのαヘリックスによって接続された8つのβストランドを含む。^[1]^[2]これらの酵素は共通の祖先から分岐したと考えられており、明らかな配列類似性はほとんど保持していないが、触媒残基の配置は保存されている。すべて触媒トライアドを持ち、その要素はループ上にあり、これがフォールドの最もよく保存された構造的特徴である。

アルファ/ベータ加水分解酵素には、プロテアーゼ、リパーゼ、ペルオキシダーゼ、エステラーゼ、エポキシド加水分解酵素、脱ハロゲン化酵素が含まれます。^[3]

データベース

ESTHERデータベースは、このタンパク質スーパーファミリーに関する膨大な情報コレクションを提供しています。^[4]

亜科

3-オキソアジペートエノールラクトナーゼ InterPro : IPR012790

このドメインを含むヒトタンパク質

ABHD10; ABHD11 ; ABHD12 ; ABHD12B; ABHD13; ABHD2 ; ABHD3 ; ABHD4; ABHD5 ; ABHD6 ; ABHD7; ABHD8; ABHD9; BAT5 ; BPHL; C20orf135; EPHX1 ; EPHX2 ; FAM108B1;リパ;リップフ;リップジェイ;リップ;リップム; リプン;ライプラル1 ;メスト; MGLL ; PPME1 ;サール; SERHL2; SPG21 ; CES1 ; CES2 ; C4orf29

参照

エクジステロイドリン酸ホスファターゼ- ステロイドリン酸ホスファターゼの構造
セリン加水分解酵素 - 主にα-β加水分解酵素フォールドを持つタンパク質で構成される酵素ファミリー

外部リンク

ESTHER データベース

参考文献

^ ab Ollis, DL; Cheah, E.; Cygler, M.; Dijkstra, B.; Frolow, F.; Franken, SM; Harel, M.; Remington, SJ; Silman, I.; Schrag, J.; Sussman, JL; Verschueren, KHG & Goldman, A. (1992). 「α/β加水分解酵素フォールド」(PDF) . Protein Eng . 5 (3): 197–211. doi :10.1093/protein/5.3.197. hdl : 11370/2d4c057d-1a67-437d-ad10-701f7a60f1e6 . PMID 1409539.
^ Carr PD、Ollis DL (2009)。「アルファ/ベータヒドロラーゼフォールド：最新情報」。Protein Pept. Lett . 16 (10): 1137–48. doi :10.2174/092986609789071298. PMID 19508187。
^ Nardini M、Dijkstra BW (1999 年 12 月)。「アルファ/ベータ加水分解酵素フォールド酵素: ファミリーは成長し続けています」。Curr . Opin. Struct. Biol . 9 (6): 732–7. doi :10.1016/S0959-440X(99)00037-8. PMID 10607665。
^ Renault L、Nègre V、Hotelier T、Cousin X、Marchot P、Chatonnet A (2005 年 12 月)。「タンパク質のアルファ/ベータ加水分解酵素フォールドスーパーファミリーのデータベースである ESTHER のユーザー向けの新しい使いやすいツール」。Chem . Biol. Interact . 157–158: 339–43. doi :10.1016/j.cbi.2005.10.100. PMID 16297901。

[PUB00004958-1] Ollis, DL; Cheah, E.; Cygler, M.; Dijkstra, B.; Frolow, F.; Franken, SM; Harel, M.; Remington, SJ; Silman, I.; Schrag, J.; Sussman, JL; Verschueren, KHG & Goldman, A. (1992). 「α/β加水分解酵素フォールド」(PDF) . Protein Eng . 5 (3): 197–211. doi :10.1093/protein/5.3.197. hdl : 11370/2d4c057d-1a67-437d-ad10-701f7a60f1e6 . PMID 1409539.

[pmid19508187-2] Carr PD、Ollis DL (2009)。「アルファ/ベータヒドロラーゼフォールド：最新情報」。Protein Pept. Lett . 16 (10): 1137–48. doi :10.2174/092986609789071298. PMID 19508187。

[pmid10607665-3] Nardini M、Dijkstra BW (1999 年 12 月)。「アルファ/ベータ加水分解酵素フォールド酵素: ファミリーは成長し続けています」。Curr . Opin. Struct. Biol . 9 (6): 732–7. doi :10.1016/S0959-440X(99)00037-8. PMID 10607665。

[pmid16297901-4] Renault L、Nègre V、Hotelier T、Cousin X、Marchot P、Chatonnet A (2005 年 12 月)。「タンパク質のアルファ/ベータ加水分解酵素フォールドスーパーファミリーのデータベースである ESTHER のユーザー向けの新しい使いやすいツール」。Chem . Biol. Interact . 157–158: 339–43. doi :10.1016/j.cbi.2005.10.100. PMID 16297901。