アドナビリア

アドナビリア
アキディアヌス糸状ウイルス 3 (AFV3) ウイルス粒子
ウイルスの分類
(ランク外):	ウイルス
領域:	アドナビリア
王国：	ジリグビラエ
門:	タレアビリコタ
クラス：	トキビリス
亜分類群
テキストを参照

アドナビリアは、糸状のビリオン（すなわち本体）と線状の二本鎖DNAゲノムを持つ古細菌ウイルスを含むウイルスの領域です。 ^[1]ゲノムはA型（ A-DNA）で存在し、SIRV2フォールド（ 4つのヘリックスを含むアルファヘリックス束の一種）を含む二量体主要カプシドタンパク質（MCP）をコードしています。ビリオンは、カプシドタンパク質に包まれたゲノムで構成され、ヘリックス状の核タンパク質複合体を形成します。一部のウイルスでは、このヘリックスはエンベロープと呼ばれる脂質膜に囲まれています。一部のウイルスでは、核タンパク質ヘリックスとエンベロープの間に追加のタンパク質層が含まれています。完全なビリオンは細長く、柔軟な場合もあれば、棒のように硬い場合もあります。

アドナビリアは、極低温電子顕微鏡検査により、この領域のウイルスが共通のMCP、A-DNA、および一般的なビリオン構造により関連していることが示された後、2020年に確立されました。アドナビリアのウイルスは、超好熱性および好酸性の古細菌、つまり非常に高温の環境と高酸性の環境に生息する古細菌に感染します。そのA-DNAゲノムは、この極端な環境への適応である可能性があります。アドナビリアのウイルスは、最後の古細菌の共通祖先に感染した可能性があると考えられているため、潜在的に長い間存在していました。一般に、領域外のウイルスとは遺伝的関係を示しません。

Adnaviria の名前の最初の部分Adna - は A-DNA から取られており、これはこの界のすべてのウイルスの A 型ゲノム DNA を指します。2 番目の部分 - viriaは、ウイルス界を表す接尾辞です。この界の唯一の界Zilligvirae は、超好熱古細菌の研究で Wolfram Zillig (1925–2005) にちなんで命名され、ウイルス界接尾辞 - viraeが付けられています。唯一の門Taleaviricotaの名前は、この界のウイルスの形態を表す「桿体」を意味するラテン語 taleaと、ウイルス門接尾辞 - viricotaに由来しています。最後に、この領域で唯一のクラスであるTokiviricetesは、グルジア語で「糸」を意味する toki (თოკი)と、ウイルスのクラスに使用される接尾辞viricetesから構成されています。^[2]

アドナビリア属のウイルスは、超好熱性および好酸性古細菌に感染し、長さが約16～56キロ塩基対の線状二本鎖DNA（dsDNA）ゲノムを有する。ゲノムの末端には逆方向末端反復配列が含まれる。^{[3] [4] [5]}ゲノムはA型（A-DNAとも呼ばれる）で存在し、^[1] B型DNAよりも1回転あたりの塩基対が多いコンパクトな右巻きらせん構造のDNAの一種である。^[6]ゲノムA-DNAの生成は、主要カプシドタンパク質（MCP）二量体との相互作用によって引き起こされ、ビリオンの組み立て中にプレゲノムB-DNAを覆い、ゲノムA-DNAを含むらせん状の核タンパク質複合体を形成する。^[2] A型ゲノムは、極限条件下でDNAが生存できるように適応したものである可能性がある。^[1]さらに、アドナビリアのウイルスはゲノムの冗長性が高く、これもまたこのような極端な環境で生き残るための適応である可能性がある。^[7]

核タンパク質らせんは、2 つの MCP の非対称単位で構成されています。ルディウイルスの場合、これはホモ二量体ですが、リポトリックスウイルスとトリストローマウイルスの場合、^{[8]はパラロガス MCP のヘテロ二量体です。}アドナウイルスのウイルスの MCPには、4 つのらせん^[4]を含むアルファ ヘリックス束の一種からなる折り畳み構造が含まれています。これはSIRV2 折り畳み構造と呼ばれ、同名のウイルスであるサルフォロバス アイランドカス桿体ウイルス 2 (SIRV2) にちなんで名付けられました。タンパク質構造にはバリエーションがありますが、すべてのアドナウイルスで同じ基本構造が保持されています。^[2]

アデノウイルスは糸状のウイルス粒子を持ち、長くて細い円筒形をしています。リポスリックスウイルスとウングラウイルスは、長さ約 410～2,200 ナノメートル (nm)、幅約 24～38 nm の柔軟なウイルス粒子を持ち、核タンパク質のらせんが脂質エンベロープに囲まれています。^{[3] [9] [10]}約 400 x 32 nm のトリストローマウイルスも同様にエンベロープを持つ柔軟なウイルス粒子を持ち、核タンパク質複合体とエンベロープの間に追加のタンパク質鞘層が含まれています。^{[5] [9] [11]}ルドウイルスは、約 600～900 x 23 nm の硬くてエンベロープのない棒状のウイルス粒子を持っています。^{[4] [9]}リポトリックスウイルスとウングラウイルスは、ウイルス粒子の両端にモップ状または爪状の構造を持ち、それが首輪につながっています。一方、ルディウイルスとトリストローマウイルスは、両端にプラグがあり、そこから細いフィラメントの束が伸びています。^{[3] [5] [10] [12]}

アドナウイルス科のウイルスは、最後の古細菌の共通祖先に感染した可能性があると考えられており、潜在的に長い間存在していた。^[13]一般に、この領域外のウイルスとは遺伝的関連を示さない。他のウイルスと共有されている遺伝子は、グリコシルトランスフェラーゼ、リボンヘリックスヘリックス転写因子、および抗CRISPRタンパク質のみである。アドナウイルスは形態的には非古細菌糸状ウイルスに類似しているが、そのウイルス粒子は異なるカプシドタンパク質から構築されている。糸状古細菌ウイルスの科であるクラバウイルス科のウイルスも同様に MCP およびウイルス粒子構成を有しており、アドナウイルスの MCP およびウイルス粒子構成とは関連がないため、この領域から除外されている。^{[2] [9]}

アドナビリア科は、その唯一の綱であるトキビリケテス綱まで単型であり、トキビリケテス綱には3つの目がある。この分類法は以下に示すとおりである。^{[2] [14]}

• 領域:アドナヴィリア
  • 王国:ジリグヴィラエ
    • 門:タレアウイルス門
      • クラス:トキウイルス綱
        • 目:リガメンウイルス目
        • 目:マキシモンウイルス目
        • 目:プリマウイルス目

アドナウイルス科のウイルスは、1980年代にウォルフラム・ツィリッヒとその同僚によって発見され始めました。^[15]これらのウイルスを発見するために、ツィリッヒは宿主を培養する方法を考案しました。^[16]最初に記載されたのは、1983年のTTV1、TTV2、TTV3でした。^[17] TTV1は最初のリポトリックスウイルスとして分類されましたが、現在はトリストロマウイルスに分類されています。^[18]ルディウイルスであるSIRV2は、1998年の発見後、ウイルスと宿主の相互作用を研究するためのモデルになりました。[ ^{15 ] [19]リポ}トリックスウイルス科とルディウイルス科は、2012年にそれらの関連性の証拠に基づいてリガメンウイルス目として統合されました。^{[20] [21]} 2020年に極低温電子顕微鏡検査により、トリストロマウイルスのMCPにはリガメンウイルスのようなSIRV2のようなフォールドが含まれていることが示され、同年にアドナビリアを確立する根拠となった。 ^{[8] [22]}

• 高等ウイルス分類群の一覧

• ウィキメディア・コモンズのAdnaviriaに関連するメディア