リポトリックスウイルス科

LipothrixviridaeはLigamenvirales目に属するウイルス科です。Thermoproteota門に属する好熱性古細菌が自然宿主として機能します。 ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}

以下の属と種がこの科に分類されます: ^{[ 2 ]}

• アルファリポトリックスウイルス
• ベータリポトリックスウイルス
• デルタリポトリックスウイルス

この科は、Alphalipothrixvirus、Betalipothrixvirus、Deltalipothrixvirusの 3 つの属から構成されています。Captovirusはかつて Gammalipothrixvirus 属としてこの科に属していましたが、現在はUngulaviridae科の唯一の属となっています。^{[ 6 ] [ 7 ]}これらは、ゲノム特性と宿主細胞認識に関与する末端付属物の多様性に基づいて属に分類されます。当初提案されたAlphalipothrixvirus属はAlphatristromavirusと改名され、 Tristromaviridae科に移されました。^{[ 8 ] [ 9 ] 2020 年に、Sulfolobus filamentous virus 1 [ 10 ]}および Sulfolobales Beppu filamentous virus 2 ^{[ 11 ]}の分類のためにAlphalipothrixvirus属が再作成されました。

Gammalipothrixvirus属では、ウイルス粒子の両端に爪のような構造が見られる。^{[ 12 ]}

リポトリックスウイルス科のメンバーは、非エンベロープの棒状ウイルスを含むルディウイルス科のウイルスと構造的およびゲノム的特徴を共有しています。両科のウイルスは線状dsDNAゲノムを持ち、最大9つの遺伝子を共有しています。さらに、ルディウイルスとリポトリックスウイルスの線状粒子は、構造的に類似した相同な主要カプシドタンパク質から構成されています。これらの共通の特性により、両科のウイルスはリガメンウイルス目に分類されます。^{[ 13 ]}

リガメンウイルス目に属するウイルスは、リポトリックスウイルスと同様にエンベロープを持ち、リガメンウイルスと同じ折り畳み構造を持つ2つのパラログ主要カプシドタンパク質をコードするトリストロマウイルス科のウイルスと構造的に関連している。 ^{[ 14 ]}これらの構造的類似性から、リガメンウイルス目とトリストロマウイルス科は「トキウイルス綱」（トキはグルジア語で「糸」を意味し、ウイルス綱はウイルス綱の公式接尾辞である）に統合されることが提案された。^{[ 14 ]}

ウイルスはエンベロープを持ち、線状である。カプシドの長さは410～1950ナノメートル（nm）と大きく異なり、 直径は24～38 nmである。エンベロープは二重層構造で、ジフィタニルテトラエーテル脂質を含む。^{[ 1 ] [ 12 ]}カプシドはらせん状のヌクレオカプシドコアを持つ細長い形状をしている。ビリオンの両端には爪状の突起がある。^{[ 12 ]}

主要なカプシドタンパク質は 2 つ (MCP1 と MCP2) です。MCP1 と MCP2 はヘテロ二量体を形成し、線状 dsDNA ゲノムを包み込んで A 型に変換します。ゲノムと MCP の相互作用により、ゲノムは凝縮してビリオンの超らせんになります。^{[ 10 ] [ 15 ] [ 16 ]}ゲノムは線状で、長さは最大 40 kb です。^{[ 1 ]}

ウイルス複製は細胞質で行われる。宿主細胞への侵入は、宿主細胞への吸着によって達成される。アシディアヌス糸状ウイルス1は、細胞の線毛様付属器官に結合することがわかっている。DNAテンプレート転写が転写方法である。古細菌が自然宿主として機能する。伝播経路は受動拡散である。^{[ 1 ]}

スルフォロブス・アイランディクス糸状ウイルス（SIFV）の場合、ビリオンの組み立てと放出が研究されている。ビリオンは細胞内で組み立てられる。主要カプシドタンパク質二量体が線状二本鎖DNAゲノムに結合すると、ヌクレオカプシドが組み立てられ、その後、未知のメカニズムによって細胞内でエンベロープが形成される。^{[ 17 ]}すべてのリポトリックスウイルスは溶菌性ウイルスである可能性が高い。ベータリポトリックスウイルスとデルタリポトリックスウイルスの場合、ビリオンはウイルス関連ピラミッド（VAP）と呼ばれるピラミッド状のポータルを通して放出される。SIFVのVAPは六角形の底面（つまり、6つの三角形の面から構成されている）を持つ。^{[ 17 ]}

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