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| トリストロマウイルス科 | |
|---|---|
ウイルスの分類 
| |
| (ランク外): | ウイルス |
| レルム: | アドナビリア |
| 王国： | ジリグビラエ |
| 門: | タレアビリコタ |
| クラス： | トキビリス |
| 注文： | プリマウイルス目 |
| 家族： | トリストロマウイルス科 |
トリストロマウイルス科はウイルスの科である。 [1]サーモ プロテウス属とピロバキュラム属の古細菌が自然宿主となる。 [2]トリストロマウイルス科はプリマウイルス目の唯一の科である。この科には2属3種が含まれる。 [3]
分類
この科には以下の属と種が割り当てられている：[3]
- アルファトリストロマウイルス
- アルファトリストマウイルス ポッツオリエンセ
- アルファトリストローマウイルス プテオリエンセ
- ベータトリストローマウイルス
- ベータトリストローマウイルス クラフラエンセ
構造
トリストロマウイルス科のウイルスはエンベロープを持ち、棒状の形をしています。直径は約 38 nm、長さは 410 nm です。ゲノムは直線的で、長さは約 15.9 kb です。TTV1 ウイルス粒子には、TP1-4 という 4 つのウイルスコード化タンパク質が含まれています。[2] [4]これらのタンパク質は、リポトリックスウイルスを含む他の科のウイルスの構造タンパク質と配列の類似性を示しません。ヌクレオカプシドタンパク質 TP1 は、適応型 CRISPR-Cas 免疫の保存された構成要素である Cas4 エンドヌクレアーゼから進化したようで、ウイルスカプシドタンパク質機能のための酵素の適応の最初の例を示しています。[5]
クライオ電子顕微鏡法によって、タイプ種を代表する PFV1 と近縁の Pyrobaculum 糸状ウイルス 2 (PFV2) のウイルス粒子の高解像度構造が決定されました。[6]構造から、ヌクレオカプシドが 2 つの主要なカプシドタンパク質 (MCP1 と MCP2) から形成されていることが明らかになりました。MCP1 と MCP2 はヘテロ二量体を形成し、線状 dsDNA ゲノムを包み込んで A 型に変換します。ゲノムと MCP の相互作用により、ゲノムが凝縮してウイルス粒子のスーパーヘリックスを形成します。[6]ヘリカル ヌクレオカプシドは脂質エンベロープに囲まれており、他のウイルスタンパク質も含まれていますが、VP3 が最も豊富です。[7]
トリストロマウイルスのMCPの折り畳みとウイルス粒子の構成は、リガメンウイルス目を構成するルディウイルス科[8]とリポスリックスウイルス科[9] [10]のメンバーのものと類似している。これらの構造的類似性により、リガメンウイルス目とトリストロマウイルス科は「トキウイルス科」という綱に統合することが提案された（トキはグルジア語で「糸」を意味し、ウイルス科はウイルス綱の公式接尾辞である）。[6]
ライフサイクル
ウイルスの複製は細胞質内で行われる。宿主細胞への侵入は宿主細胞への吸着によって達成される。転写の方法はDNAテンプレート転写である。サーモプロテウス属とピロバキュラム属の古細菌が自然宿主となる。ウイルス粒子は溶解によって放出される。感染経路は受動拡散である。[2]
参考文献
- ^ Prangishvili, D; Rensen, E ; Mochizuki, T; Krupovic, M; ICTVレポート、コンソーシアム（2019年2月）。「ICTVウイルス分類プロファイル：トリストロマウイルス科」。 一般ウイルス学ジャーナル。100 （2）：135–136。doi ：10.1099/ jgv.0.001190。PMID 30540248。
- ^ abc "Tristomaviridae". ViralZone . スイスバイオインフォマティクス研究所. 2021年5月14日閲覧。
- ^ ab 「ウイルス分類：2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会（ICTV）。2021年3月。 2021年5月14日閲覧。
- ^ Neumann, Horst; Schwass, Volker; Eckerskorn, Christoph; Zillig, Wolfram (1989). 「Thermoproteus tenax ウイルス TTV1 の 3 つの構造タンパク質をコードする遺伝子の同定と特徴付け」. MGG Molecular & General Genetics . 217 (1): 105–110. doi :10.1007/BF00330948. PMID 2505050. S2CID 13335423.
- ^ Krupovic M, Cvirkaite-Krupovic V, Prangishvili D, Koonin EV (2015). 「CRISPR関連Cas4ヌクレアーゼからの古細菌ウイルスヌクレオカプシドタンパク質の進化」Biol Direct . 10 (1): 65. doi : 10.1186/s13062-015-0093-2 . PMC 4625639 . PMID 26514828.
- ^ abc Wang, F; Baquero, DP; Su, Z; Osinski, T; Prangishvili, D; Egelman, EH; Krupovic, M (2020年1月). 「糸状ウイルスの構造が古細菌ウイルス圏内の家族関係を明らかにする」.ウイルス進化. 6 (1): veaa023. doi :10.1093/ve/veaa023. PMC 7189273. PMID 32368353 .
- ^ Rensen, EI; Mochizuki, T; Quemin, E; Schouten, S; Krupovic, M; Prangishvili, D (2016). 「DNAウイルスの中でユニークな構造を持つ超好熱性古細菌ウイルス」。米国科学アカデミー紀要。113 ( 9 ) : 2478–83。Bibcode : 2016PNAS..113.2478R。doi : 10.1073 / pnas.1518929113。PMC 4780613。PMID 26884161。
- ^ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Krupovic, M; Prangishvili, D; Egelman, EH (2015). 「ウイルス学。超好熱菌に感染するウイルスはA型DNAをカプシド化する」。Science . 348 (6237): 914–7. doi :10.1126/science.aaa4181. PMC 5512286 . PMID 25999507.
- ^ カッソン、P;ディマイオ、F;ゆう、×。ルーカス・スタート、S;クルポビッチ、M;スショウテン、S;プランギシビリ、D;イーゲルマン、EH (2017)。 「糸状超好熱性ウイルスにおける新規膜エンベロープのモデル」。eライフ。６．土井：10.7554/eLife.26268。PMC 5517147。PMID 28639939。
- ^ Liu, Y; Osinski, T; Wang, F; Krupovic, M; Schouten, S; Kasson, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). 「超好熱性好酸性菌に感染する膜エンベロープ糸状ウイルスの構造保全」Nature Communications . 9 (1): 3360. Bibcode :2018NatCo...9.3360L. doi :10.1038/s41467-018-05684-6. PMC 6105669 . PMID 30135568.
外部リンク
ウィキメディア・コモンズのトリストロマウイルス科に関連するメディア- ICTV レポート: トリストロマウイルス科