ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ASB2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ASB2、ASB-2、アンキリンリピート、および2を含むSOCSボックス |
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| 外部ID | オミム:605759; MGI : 1929743;ホモロジーン:69202;ジーンカード:ASB2; OMA :ASB2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12 E|12 52.9 cM | 始める | 103,287,401 bp [2] |
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| 終わり | 103,322,260 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 骨格筋組織
- 腓腹筋
- 太ももの筋肉
- 心の頂点
- 左心室
- 平滑筋組織
- S状結腸の筋層
- 右耳介
- 左子宮管
- 右冠動脈
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| | トップの表現 | - 膝関節
- 太ももの筋肉
- 外側広筋
- 上腕三頭筋
- 側頭筋
- 心室の心筋
- 前脛骨筋
- 胸鎖乳突筋
- 二腹筋
- 骨格筋組織
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- Cul5-RING ユビキチンリガーゼ複合体
- 細胞質
- ユビキチンリガーゼ複合体
| | 生物学的プロセス |
- 骨格筋細胞の分化
- 筋芽細胞の分化
- 細胞内シグナル伝達
- タンパク質ポリユビキチン化
- シグナル伝達
- 翻訳後タンパク質修飾
- タンパク質のユビキチン化
- ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000100628 ENSG00000278693 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 14 章: 93.93 – 93.98 Mb | 12 章: 103.29 – 103.32 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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アンキリンリピートおよびSOCSボックスタンパク質2(ASBS)は、ヒトのASB2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
ASB2 タンパク質は、アンキリンリピートおよびSOCSボックス含有 (ASB) タンパク質ファミリーに属します。これは、アンキリンリピート配列と SOCS ボックスドメインで構成されています。SOCS ボックスは、サイトカインシグナル伝達抑制因子 (SOCS) タンパク質とその結合パートナーをエロンギン B および C 複合体と接続する役割を果たし、それらの分解を促進する可能性があります。この遺伝子は、オールトランスレチノイン酸によって誘導されます。骨髄性白血病細胞では、このコードされたタンパク質の発現により、増殖阻害とクロマチン凝縮が誘導されることが示されています。この遺伝子には、複数の選択的スプライシング転写バリアントが記載されていますが、その全長配列は不明です。[5]
参考文献
- ^ abc ENSG00000278693 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100628, ENSG00000278693 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021200 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: ASB2 アンキリンリピートと SOCS ボックス含有 2」。
外部リンク
さらに読む
- Kile BT、Schulman BA、Alexander WS、他 (2002)。「SOCS ボックス: 破壊と劣化の物語」。Trends Biochem. Sci . 27 (5): 235–41. doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6. PMID 12076535。
- Hilton DJ、Richardson RT、Alexander WS、他 (1998)。「C 末端 SOCS ボックスを含む 20 種類のタンパク質が 5 つの構造クラスを形成する」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 95 ( 1): 114–9。Bibcode : 1998PNAS ...95..114H。doi : 10.1073/ pnas.95.1.114。PMC 18144。PMID 9419338。
- Kile BT、Viney EM、Willson TA、他 (2001)。「アンキリンリピートとSOCSボックス含有タンパク質Asb-1、Asb-2、Asb-3、Asb-4をコードする遺伝子のクローニングと特性解析」。Gene . 258 ( 1–2 ): 31–41。doi :10.1016/S0378-1119(00)00402-9。PMID 11111040 。
- Kile BT、Metcalf D、Mifsud S、et al. (2001)。「マウスにおける遺伝子改変を用いた Asb-1 の機能解析」。Mol . Cell. Biol . 21 (18): 6189–97. doi :10.1128/MCB.21.18.6189-6197.2001. PMC 87336. PMID 11509662 。
- Kohroki J, Fujita S, Itoh N, et al. (2001). 「ATRA制御Asb-2遺伝子はHL-60白血病細胞の分化に誘導される」. FEBS Lett . 505 (2): 223–8. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02829-0 . PMID 11566180.
- Guibal FC、Moog-Lutz C、Smolewski P、et al. (2002)。「ASB-2 は骨髄性白血病細胞の成長を阻害し、コミットメントを促進する」。J . Biol. Chem . 277 (1): 218–24. doi : 10.1074/jbc.M108476200 . PMID 11682484。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Namciu SJ、Friedman RD、Marsden MD、他 (2004)。「14q32.1 のヒトセリンプロテアーゼインヒビター遺伝子クラスターの配列構成とマトリックス付着領域」。Mamm . Genome . 15 (3): 162–78. doi :10.1007/s00335-003-2311-y. PMID 15014966. S2CID 8594824.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Heuzé ML、Guibal FC、Banks CA、et al. (2005)。「ASB2 は、Cullin 5 および Rbx1 と会合して E3 ユビキチンリガーゼ複合体を再構成できる Elongin BC 相互作用タンパク質です」。J . Biol. Chem . 280 (7): 5468–74. doi : 10.1074/jbc.M413040200 . PMID 15590664。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Kohroki J, Nishiyama T, Nakamura T, Masuho Y (2006). 「ASB タンパク質は Cullin5 および Rbx2 と相互作用して E3 ユビキチンリガーゼ複合体を形成する」. FEBS Lett . 579 (30): 6796–802. doi : 10.1016/j.febslet.2005.11.016 . PMID 16325183. S2CID 7196353.