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2007年のAFCチャンピオンズリーグは、アジア最高峰のクラブサッカー大会としては26回目の大会であり、現在のAFCチャンピオンズリーグという名称になってからの5回目の大会だった。
日本の浦和レッズはイランのセパハンを破り、アジア選手権で初優勝を果たし、アジア選手権を制覇した4番目の日本クラブとなり、2007 FIFAクラブワールドカップへの出場権を獲得した。
合計28クラブが地域に基づいて4クラブずつ7つのグループに分けられました。東アジアと東南アジアのクラブはグループE～Gに、残りのクラブはグループA～Dに分けられました。各クラブは、同じグループの3クラブと総当たり戦（ホーム＆アウェイ）を行い、合計6試合を行いました。クラブは勝利で3ポイント、引き分けで1ポイント、敗北で0ポイントを獲得しました。クラブはポイントに基づいて順位付けされ、タイブレークは次の順序で行われました。
7つのグループの勝者と前回優勝チームが準々決勝に進出した。
8つのクラブはすべてランダムに組み合わせられましたが、唯一の制限は、同じ国のクラブ同士が準々決勝で対戦できないことでした。試合はホーム＆アウェイ方式の2試合制で行われ、合計得点で勝敗が決まりました。合計得点で勝敗が決まらない場合は、「アウェーゴールルール」が適用されました。それでも同点の場合は延長戦が行われ、延長戦でも「アウェーゴールルール」が適用されました。それでも同点の場合は、PK戦が行われました。
AFC加盟後、オーストラリアには2つの出場枠が認められた。そのため、タイとベトナムはそれぞれ1つのクラブしか出場できず、2つ目のクラブは両国から1チームずつAFCカップに出場することになった。
抽選会は12月22日にクアラルンプールで行われ、チームは7つのグループに分けられた。2月、AFCは選手登録を期限内に行わなかったエステグラル・テヘランをグループBから失格とした。
グループリーグの試合は、2007年3月7日、3月21日、4月11日、4月25日、4月9日、5月23日の試合日に開催される予定だった。