ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
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| 識別子 |
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| エイリアス | VPS13D、液胞タンパク質選別13ホモログD、SCAR4 |
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| 外部ID | OMIM : 608877; MGI : 2448530; HomoloGene : 15583; GeneCards : VPS13D; OMA :VPS13D - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 E1 | 始める | 144,699,192 bp [2] |
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| 終わり | 144,921,575 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 脚の皮膚
- 腹部の皮膚
- 腓骨神経
- 左心室
- 甲状腺の右葉
- 脛骨動脈
- 甲状腺の左葉
- 心の頂点
- 子宮頸管
- 腱
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| | トップの表現 | - 手
- 顆粒球
- 耳石器官
- 卵形嚢
- 網膜の神経層
- 太ももの筋肉
- 食道
- 小腸上皮
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 胸腺
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001033190 NM_001128198 NM_001276465 NM_001276502 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 12.23 – 12.51 Mb | 4 章: 144.7 – 144.92 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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液胞タンパク質選別関連タンパク質13Dは、ヒトではVPS13D遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
この遺伝子は、液胞タンパク質選別 13 遺伝子ファミリーに属するタンパク質をコードします。酵母では、液胞タンパク質選別 13 タンパク質は、トランスゴルジネットワークと前液胞区画間の膜タンパク質の輸送に関与しています。
この遺伝子にはいくつかの転写変異体が存在する可能性があるが、現在までに全長の性質が記述されているのは2つだけである。これら2つはこの遺伝子の主要な変異体であり、異なるアイソフォームをコードしている。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000048707 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020220 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: VPS13D 液胞タンパク質選別 13 ホモログ D (S. cerevisiae)」。
さらに読む
- Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、他 (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
- Yu W、Andersson B、Worley KC、et al. (1997)。「大規模連結cDNAシークエンシング」。Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 。
- Seki N, Ohira M, Nagase T, et al. (1998). 「ヒト脳からのサイズ分画cDNAライブラリーにおけるcDNAクローンの特性評価」DNA Res . 4 (5): 345–9. doi : 10.1093/dnares/4.5.345 . PMID 9455484.
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用: 長い cDNA で構成された機能的に分類されたライブラリを使用した 2 ハイブリッド スクリーニング」Genome Res . 12 (11): 1773–84. doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Velayos-Baeza A、Vettori A、 Copley RR 、 et al. (2005)。「ヒト VPS13 遺伝子ファミリーの解析」。ゲノミクス。84 (3): 536–49。doi :10.1016/j.ygeno.2004.04.012。PMID 15498460 。
- Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。