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| U4 スプライソソームRNA | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| シンボル | Ｕ４ |
| Rfam | RF00015 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子; snRNA ;スプライシング |
| ドメイン | 真核生物 |
| 行く | GO:0017070 GO:0000353 GO:0000351 GO:0005687 GO:0046540 |
| それで | 0000393 ... |
| PDB構造 | PDBe |
U4核小体リボ核酸 (U4 snRNA) は、主要または U2 依存性スプライソソーム(プレメッセンジャー RNA (プレmRNA ) のスプライシングに関与する真核生物の分子機械)の非コード RNA成分です。U4 snRNA はU6と二重鎖を形成し、スプライシングの各ラウンドで、ATP 依存的に U6 snRNA (およびスプライソソーム) から置換され、U6 が再度折り畳まれてスプライシング触媒の活性部位が形成されます。タンパク質 Brr2 が関与するリサイクル プロセスにより、U4 は U6 から解放され、タンパク質Prp24 はU4 と U6 を再アニールします。結合タンパク質と複合した U4 の5'ステム ループの結晶構造が解明されています。[1]
生物学的役割
U4 snRNA は、タンパク質に結合した小さな核リボ核タンパク質snRNP [2]、di-snRNP の U6 snRNA に関与するもの[3] 、および tri-snRNP の U6 snRNA と U5 snRNA の両方に関与するもの [4] など、さまざまな形式で存在することが示されている。[ 5]さまざまな形式は、ペンタ snRNP の活動におけるさまざまな一時的イベントと一致すると提案されている[6]、またはスプライソソームの組み立てと活動の段階的モデルにおける中間体として提案されている[7] 。
U4 snRNA（および酵母の類似体である可能性のある snR14 [8]）は、スプライシング反応の特定の触媒活性に直接関与しないことが示されており、[9]代わりに U6 snRNA の調節因子として働くことが提案されています。U4 snRNA は、2 つの高度に保存されたステム領域で U6 snRNA 間の相補的な塩基対合により、組み立て中のスプライソソーム活性を阻害します。[10]この塩基対合相互作用により、U6 snRNA が U2 snRNA と組み立てられて触媒活性に必要な構造を形成するのが妨げられることが示唆されています。 [11] U4 snRNA が分解され、スプライソソームから除去されると、スプライシングは効果的に停止します。[12] U4 および U6 snRNA は、in vitro でのスプライシングに必要であることが実証されています。[13]
構造
U4 snRNAの二次構造は、U6 snRNAとの相互作用に応じて変化すると考えられています。[7] X線結晶構造解析、[1] [14] NMR、[15]および化学修飾RNA構造プローブ[16]を含むいくつかの実験は、U4 snRNAの二次構造にいくつかの保存されたモチーフ[17]が含まれていることを示しています。これらは、他のスプライシング成分との相互作用を確立するための構造的役割を果たすだけでなく、仲介的な役割も果たします。図2に示されている推定U4/U6 snRNA塩基対形成二次構造は、スプライシング機構の起源が古代であることを示唆する、さまざまな生物にわたって保存されています。[18]高度に保存されたキンクループが特定のタンパク質相互作用に関与することが以前に示されています。[1] [19]
インタラクション
U4 snRNAは、スプライソソームが活性化される前に、タンパク質Brr2を含むATP依存プロセスでU6 snRNAから置換される必要がある。[9] [20] [21] Brr2とタンパク質prp24の両方を含むサイクルが提案されており、これはU4をU6 snRNAに選択的に再アニールする。[21] [22] [23] [24] Smタンパク質のリングは、3'末端近くのU4 snRNAの保存領域を取り囲んでおり、異なるsnRNP間の好ましい相互作用を促進するとともに、U4 snRNAをRNase酵素による分解から保護すると期待されている。[25] [26]スプライソソーム経路に関与するタンパク質は100以上特定されており、さまざまなサイズのタンパク質がU4 snRNPと相互作用することも知られている。[27]
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
- Rfamの U4 スプライソソーム RNA のページ