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| サーモコッカス・キシス | |
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| 電子顕微鏡写真 | |
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| 種： | コダカレンシス
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| 二名法名 | |
| サーモコッカス・コダカレンシス アトミら、2004 [1]
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Thermococcus kodamarensisは、好熱性古細菌の一種です。基準菌株T. コダカレンシスKOD1 は、この属の中で最もよく研究されているものの 1 つです。 [2]
歴史
T. kodakarensisは、鹿児島県小宝島の海岸近くのソルファタラから分離されました。[3]この分離株は当初Pyrococcus kodakarensis KOD1と命名されましたが、 16S rRNA配列に基づいてThermococcusの一種として再分類されました。 [1] T. kodakarensisの初期の研究は主にその耐熱性酵素（KOD DNAポリメラーゼなど）に向けられていましたが、比較的取り扱いが容易で、自然の能力によって遺伝子操作が容易なため、いくつかの生物学的プロセスの研究にとって魅力的なシステムとなっています。[4] [5]
プロパティ
T. kodakarensis細胞は、直径1～2 μmの不規則な球菌で、対になって存在することが多く、冠毛古細菌によって高度に運動します。細胞壁は、ジエーテル脂質とテトラエーテル脂質の層と、外側の糖タンパク質コートで構成されています。[1] [3] T. kodakarensisは、偏性嫌気性菌で従属栄養生物であり、元素硫黄の存在下でさまざまな有機基質上で急速に増殖し、硫化水素ガスを発生します。発生時間は、最適条件下で 40 分と推定されています。[3]ピルビン酸またはデンプンを増殖に使用すると、元素硫黄の必要性が軽減されます。硫黄がない場合、硫化水素の代わりに水素が生産されます。 [1]増殖は 60～100 °C の温度範囲で可能で、最適温度は 85 °C です。[1]他の海洋生物と同様に、最適な成長には高い塩濃度が必要であり、希薄溶液では細胞溶解が起こる可能性があります。
ゲノム
2005年にT. kodakarensis KOD1のゲノムが完全に解読されました。ゲノムは2,088,737塩基対の環状染色体1本で構成され、2306個のタンパク質をコードしていると予測されています。[6]
参照
参考文献
- ^ abcde Atomi H, Fukui T, Kanai T, Morikawa M, Imanaka T (2004年10月). 「以前にPyrococcus sp. KOD1として報告された、よく研究されている超好熱性古細菌Thermococcus kodakaraensis sp. nov.の説明」Archaea . 1 (4): 263–7. doi : 10.1155/2004/204953 . PMC 2685570 . PMID 15810436.
- ^ Atomi H, Reeve J (2019年11月). 「微生物プロファイル: Thermococcus kodakarensis: モデル超好熱性古細菌」.微生物学. 165 (11): 1166–1168. doi : 10.1099 /mic.0.000839 . PMC 7137780. PMID 31436525.
- ^ abc Morikawa M, Izawa Y, Rashid N, Hoaki T, Imanaka T (1994年12月). 「新たに単離された超好熱性Pyrococcus sp.からの耐熱性チオールプロテアーゼの精製と特性評価」.応用環境微生物学. 60 (12): 4559–66. doi :10.1128/aem.60.12.4559-4566.1994. PMC 202019. PMID 7811092.
- ^ 佐藤隆、福井隆、跡見裕、今中隆 (2003年1月)。 「超好熱性古細菌 Thermococcus kodakaraensis KOD1 における相同組換えによる標的遺伝子破壊」。細菌学ジャーナル。185 (1): 210-20。土井：10.1128/JB.185.1.210-220.2003。PMC 141832。PMID 12486058。
- ^ Sato T, Fukui T, Atomi H, Imanaka T (2005 年 7 月). 「超好熱性古細菌 Thermococcus kodakaraensis の複数の遺伝子操作を可能にする改良された多用途形質転換システム」.応用環境微生物学. 71 (7): 3889–99. doi :10.1128/AEM.71.7.3889-3899.2005. PMC 1169065. PMID 16000802 .
- ^ Fukui T, Atomi H, Kanai T, Matsumi R, Fujiwara S, Imanaka T (2005年3月). 「超好熱性古細菌 Thermococcus kodakaraensis KOD1 の完全ゲノム配列および Pyrococcus ゲノムとの比較」. Genome Research . 15 (3): 352–63. doi :10.1101/gr.3003105. PMC 551561. PMID 15710748 .
さらに読む
- Elshawadfy AM、Keith BJ、Ee Ooi H、Kinsman T、Heslop P、Connolly BA (2014 年 5 月 27 日)。「Pyrococcus furiosus および Thermococcus kodakarensis のファミリー B 酵素由来の DNA ポリメラーゼハイブリッド: ポリメラーゼ連鎖反応のパフォーマンス向上」。Frontiers in Microbiology。5 ( 224 ) : 224。doi : 10.3389 / fmicb.2014.00224。PMC 4034419。PMID 24904539。
- Hwa KY、Subramani B、Shen ST、Lee YM (2014 年 9 月)。「Thermococcus kodakarensis KOD1 由来の β-グリコシダーゼの熱安定性と熱活性には分子間ジスルフィド結合が必要である」。応用微生物 学およびバイオテクノロジー。98 (18) : 7825–36。doi :10.1007/s00253-014-5731-6。PMID 24728717。S2CID 9812474。
- 岸本 明、北 亜、石橋 哲、富田 英、横大路 裕、今中 達 他(2014 年 9 月)。 「サーモコッカス・コダカレンシス由来のホスホパントテン酸合成酵素の結晶構造」。タンパク質。82 (9): 1924 ～ 1936 年。土井：10.1002/prot.24546。PMID 24638914。S2CID 23549563 。