TUB（遺伝子）

浴槽
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1S31
識別子
エイリアス	TUB、rd5、RDOB、tubby 二分転写因子、TUB 二分転写因子
外部ID	オミム：601197; MGI : 2651573;ホモロジーン：31147;ジーンカード：TUB; OMA :TUB - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体11（ヒト）
終わり	8,106,243 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体7（マウス）
終わり	108,633,667 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	網状部; ; 緻密部; ; 中側頭回; ; 中心後回; ; 嗅内皮質; ; 上前頭回; ; 上前庭核; ; 橋; ; 腹側被蓋野; ; 下垂体;
	トップの表現
	網膜の神経層; ; 視床下部背内側核; ; 弓状核; ; 鉤状部; ; 腹内側核; ; 前扁桃体領域; ; 視床下部室傍核; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; ハベヌラ; ; 外側視床下部;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ホスファチジルイノシトール結合; タンパク質含有複合体結合; Gタンパク質共役受容体結合; 繊毛内輸送粒子A結合;
細胞成分	細胞質; 細胞外領域; 細胞質; 細胞膜; 繊毛; 膜; 核;
生物学的プロセス	貪食、認識; 非運動性繊毛への受容体の局在; ホルモンへの反応; 貪食作用の正の調節; 光受容細胞の維持; 聴覚; カメラ型眼における網膜の発達; 光受容体外節へのタンパク質の局在; 刺激に対する反応; 貪食作用; 繊毛へのタンパク質の局在; Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路の調節; 繊毛内輸送;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	7275
	22141
	ENSG00000166402
	ENSMUSG00000031028
	P50607
	P50586
	NM_003320 ; NM_177972
	NM_021885
	NP_003311 ; NP_813977
	NP_068685
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Tubbyタンパク質ホモログは、ヒトではTUB遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、二分性転写因子のTubbyファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、肥満や感覚神経の劣化に関与している可能性があります。マウスの類似タンパク質の結晶構造が決定されており、ホスホイノシチド加水分解に反応して核に移行する膜結合転写調節因子として機能します。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが特定されています。^[6]

インタラクション

TUB（遺伝子）はPLCG1と相互作用することが示されている。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166402 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031028 – Ensembl、2017 年 5 月
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^ Kapeller, R; Moriarty A; Strauss A; Stubdal H; Theriault K; Siebert E; Chickering T; Morgenstern JP; Tartaglia LA; Lillie J (1999 年 8 月). 「tub のチロシンリン酸化と Src 相同性 2 ドメイン含有タンパク質との関連は、インスリンによる細胞内シグナル伝達における tub の関与を示している」. J. Biol. Chem . 274 (35). 米国: 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . ISSN 0021-9258. PMID 10455176.

さらに読む

Ikeda A, Nishina PM, Naggert JK (2002). 「神経細胞の発達と機能に関与するファミリー、タビー様タンパク質」J. Cell Sci . 115 (Pt 1): 9–14. doi : 10.1242/jcs.115.1.9 . PMID 11801719.
Jones JM、Meisler MH、Seldin MF、他 (1992)。「インスリン-2 (Ins-2) と肥満変異体 tubby (tub) のマウス染色体 7 の異なる領域への局在」。Genomics。14 ( 1 ) : 197–9。doi : 10.1016/S0888-7543 ( 05)80308-8。hdl : 2027.42/29864。PMID 1358794。
North MA、Naggert JK、Yan Y、他 (1997)。「新規tubby遺伝子ファミリーのメンバーであるTUB、TULP1、TULP2の分子特性と眼疾患との関連の可能性」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 ( 7): 3128–33。Bibcode : 1997PNAS ...94.3128N。doi : 10.1073 / pnas.94.7.3128。PMC 20333。PMID 9096357。
Kapeller R、Moriarty A、Strauss A、et al. (1999)。「tub のチロシンリン酸化と Src 相同性 2 ドメイン含有タンパク質との関連は、インスリンによる細胞内シグナル伝達における tub の関与を示している」。J . Biol. Chem . 274 (35): 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . PMID 10455176。
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He W、Ikeda S、Bronson RT、et al. (2001)。「Tubby 遺伝子ファミリーメンバーの細胞内局在を決定するための GFP タグ発現および免疫組織化学研究」。Brain Res. Mol. Brain Res . 81 (1–2): 109–17. doi :10.1016/S0169-328X(00)00164-9. PMID 11000483。
Santagata S、Boggon TJ、Baird CL、他 (2001)。「Tubby Proteins を介した G タンパク質シグナル伝達」。Science . 292 ( 5524): 2041–50. doi :10.1126/science.1061233. PMID 11375483. S2CID 29856557.
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Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
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外部リンク

PDBe-KBの UniProt : P50607 (ヒト Tubby タンパク質ホモログ)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
PDBe-KBの UniProt : P50586 (マウス Tubby タンパク質)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166402 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031028 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8612280-5] Kleyn PW、Fan W、Kovats SG、Lee JJ、Pulido JC、Wu Y、Berkemeier LR、Misumi DJ、Holmgren L、Charlat O、Woolf EA、Tayber O、Brody T、Shu P、Hawkins F、Kennedy B、Baldini L、Ebeling C、Alperin GD、Deeds J、Lakey ND、Culpepper J、Chen H、Glucksmann-Kuis MA、Carlson GA、Duyk GM、Moore KJ (1996 年 6 月)。「マウス肥満遺伝子 tubby の同定と特徴付け: 新規遺伝子ファミリーのメンバー」。Cell。85 ( 2 ) : 281–90。doi : 10.1016/S0092-8674(00)81104-6。PMID 8612280。S2CID 15670925 。

[entrez-6] "Entrez Gene: TUB tubby ホモログ (マウス)"。

[pmid10455176-7] Kapeller, R; Moriarty A; Strauss A; Stubdal H; Theriault K; Siebert E; Chickering T; Morgenstern JP; Tartaglia LA; Lillie J (1999 年 8 月). 「tub のチロシンリン酸化と Src 相同性 2 ドメイン含有タンパク質との関連は、インスリンによる細胞内シグナル伝達における tub の関与を示している」. J. Biol. Chem . 274 (35). 米国: 24980–6. doi : 10.1074/jbc.274.35.24980 . ISSN 0021-9258. PMID 10455176.