ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| TTF2 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | TTF2、HuF2、ZGRF6、転写終結因子、RNAポリメラーゼII、転写終結因子2、F2 |
|---|
| 外部ID | オミム:604718; MGI : 1921294;ホモロジーン: 37826;ジーンカード:TTF2; OMA :TTF2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 3|3 F2.2 | 始める | 100,938,860 bp [2] |
|---|
| 終わり | 100,969,663 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 腓骨神経
- 結腸上皮
- アキレス腱
- 骨髄細胞
- 生殖腺
- 直腸
- 鼻咽頭上皮
- 付録
- 食道粘膜
- 睾丸
|
| | トップの表現 | - 手
- 原始的な線
- 髄質集合管
- 胚葉上層
- 耳小胞
- 下顎突出
- 上顎突出
- 毛包
- リンパ管の内皮細胞
- 心室帯
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- DNA結合
- ヌクレオチド結合
- ATP依存性活性、DNAに作用する
- 亜鉛イオン結合
- タンパク質結合
- ATP結合
- ヘリカーゼ活性
- 加水分解酵素活性
| | 細胞成分 |
- スプライソソーム複合体
- 転写伸長因子複合体
- 核
- 細胞質
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- DNAテンプレート転写、終結
- RNAポリメラーゼII転写の終結
- mRNA処理
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAスプライシング
- 転写、DNAテンプレート
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
転写終結因子2は、ヒトではTTF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、タンパク質-DNA相互作用を変化させる上で重要な役割を果たすSWI2/SNF2ファミリータンパク質のメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、dsDNA依存性ATPase活性とRNAポリメラーゼII終結活性を持つことが示されています。このタンパク質は、細胞分裂周期5様タンパク質と相互作用し、ヒトスプライシング複合体と関連し、プレmRNAスプライシングにおいて役割を果たします。[6]
インタラクション
TTF2はCDC5Lと相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116830 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033222 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Liu M、Xie Z、Price DH(1998年10月)。「ヒトRNAポリメラーゼII転写終結因子はSWI2/SNF2ファミリーのメンバーである」。The Journal of Biological Chemistry。273(40 ):25541–4。doi:10.1074 / jbc.273.40.25541。PMID 9748214 。
- ^ ab 「Entrez Gene: TTF2 転写終結因子、RNA ポリメラーゼ II」。
- ^ Leonard D、Ajuh P、Lamond AI、Legerski RJ (2003 年 9 月)。「hLodestar/HuF2 は CDC5L と相互作用し、pre-mRNA スプライシングに関与している」。生化学および生物物理学的研究通信。308 (4): 793– 801。CiteSeerX 10.1.1.539.8359。doi :10.1016/ S0006-291X (03)01486-4。PMID 12927788 。
さらに読む
- Girdham CH、Glover DM (1991 年 10 月)。「染色体の絡まりと分裂後期の切断は、ヌクレオシド三リン酸結合タンパク質をコードするショウジョウバエ遺伝子 lodestar の変異によって起こる」。遺伝子と発達 。5 ( 10 ): 1786–99。doi : 10.1101/gad.5.10.1786。PMID 1916263。
- Hara R、Selby CP、Liu M、Price DH、Sancar A (1999 年 8 月)。「ヒト転写解放因子 2 はシクロブタンチミン二量体で停止した RNA ポリメラーゼ I および II を解離する」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 35): 24779– 86。doi : 10.1074/jbc.274.35.24779。PMID 10455150。
- Leonard D 、Ajuh P、Lamond AI、 Legerski RJ (2003 年 9 月)。「hLodestar/HuF2 は CDC5L と相互作用し、pre-mRNA スプライシングに関与する」。生化学および生物物理学的研究通信。308 (4): 793– 801。CiteSeerX 10.1.1.539.8359。doi :10.1016/S0006-291X(03)01486-4。PMID 12927788 。
- Jiang Y、Liu M、Spencer CA、Price DH (2004 年 5 月)。「転写終結因子2 による有糸分裂時の転写伸長抑制への関与」。分子細胞。14 ( 3 ) : 375–85。doi : 10.1016 / S1097-2765 (04)00234-5。PMID 15125840。
- Colland F、Jacq X、Trouplin V、Mougin C、Groizeleau C、Hamburger A、Meil A、Wojcik J、Legrain P、Gauthier JM (2004 年 7 月)。 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。ゲノム研究。14 (7): 1324–32 .土井:10.1101/gr.2334104。PMC 442148。PMID 15231748。
- Jiang Y、Price DH (2004年9 月)。「siRNA耐性置換ベクターによる TTF2 ノックダウン表現型の救済」。Cell Cycle。3 ( 9 ) : 1151–3。doi : 10.4161/cc.3.9.1151。PMID 15467445。