ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| トラップPC3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1SZ7、2C0J、2CFH、3KXC |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TRAPPC3、BET3、輸送タンパク質粒子複合体3、輸送タンパク質粒子複合体サブユニット3 |
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| 外部ID | オミム:610955; MGI : 1351486;ホモロジーン: 6399;ジーンカード:TRAPPC3; OMA :TRAPPC3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 D2.2 | 始める | 126,156,118 bp [2] |
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| 終わり | 126,169,676 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右副腎
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 甲状腺の右葉
- ランゲルハンス島
- 甲状腺の左葉
- 右冠動脈
- S状結腸の筋層
- 左精巣
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| | トップの表現 | - 頭蓋冠
- 網膜の神経層
- 内側神経節隆起
- 小脳皮質
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 右腎臓
- 骨髄間質
- 脈絡叢
- リップ
- 脈絡叢上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- ゴルジ体
- 小胞体
- ゴルジ膜
- 細胞質
- TRAPP複合体
- シスゴルジ体膜
| | 生物学的プロセス |
- COPII小胞コーティング
- 小胞輸送
- ゴルジ小胞輸送
- 小胞体からゴルジ小胞を介した輸送
- ゴルジ体内小胞輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001270894 NM_001270895 NM_001270896 NM_001270897 NM_014408 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001257823 NP_001257824 NP_001257825 NP_001257826 NP_055223 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 36.14 – 36.16 Mb | 4 章: 126.16 – 126.17 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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輸送タンパク質粒子複合体サブユニット3は、ヒトではTRAPPC3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000054116 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028847 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W、Gibbs RA (1996 年 6 月)。「改良されたショットガン ライブラリ構築のための「ダブル アダプター」法」。Anal Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
- ^ 「Entrez Gene: TRAPPC3 輸送タンパク質粒子複合体 3」。
さらに読む
- Yu W、Andersson B、Worley KC、et al. (1997)。「大規模連結cDNAシークエンシング」。Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 。
- Sacher M、Jiang Y、Barrowman J 、et al. (1998)。「TRAPP、シスゴルジ体上で小胞のドッキングと融合を仲介する高度に保存された新規複合体」。EMBO J. 17 (9): 2494–503. doi :10.1093/emboj/17.9.2494. PMC 1170591. PMID 9564032 。
- Barrowman J、Sacher M、Ferro-Novick S (2000)。「TRAPP はゴルジ体と安定的に結合し、小胞ドッキングに必要である」。EMBO J. 19 (5): 862–9. doi :10.1093/emboj/19.5.862. PMC 305626. PMID 10698928 。
- Gavin AC 、 Bösche M、 Krause R、他 (2002)。「タンパク質複合体の体系的分析による酵母プロテオームの機能的構成」。Nature 415 ( 6868 ): 141–7。Bibcode :2002Natur.415..141G。doi :10.1038/415141a。PMID 11805826。S2CID 4425555 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Kim YG、Sohn EJ、Seo J、他 (2005)。「bet3 の結晶構造は、結合因子 TRAPP のゴルジ局在に関する新しいメカニズムを明らかにする」。Nat . Struct. Mol. Biol . 12 (1): 38–45. doi :10.1038/nsmb871. PMID 15608655. S2CID 22597154。
- Turnbull AP、Kümmel D、Prinz B、et al. (2005)。「パルミトイル化 BET3 の構造: TRAPP 複合体の組み立てと膜局在に関する考察」。EMBO J. 24 ( 5): 875–84. doi :10.1038/sj.emboj.7600565. PMC 554119. PMID 15692564 。
- Loh E、Peter F、Subramaniam VN、Hong W (2005)。「哺乳類 Bet3はER からゴルジ体への輸送に関与する細胞質因子として機能する」( PDF )。J . Cell Sci。118 ( Pt 6): 1209–22。doi : 10.1242/ jcs.01723。PMID 15728249。S2CID 3092909 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Kim MS、Yi MJ、Lee KH、他 (2006)。「生化学および結晶学的研究により、TRAPP サブユニット Trs33p と Bet3p 間の特定の相互作用が明らかになった」。Traffic . 6 ( 12): 1183–95. doi :10.1111/j.1600-0854.2005.00352.x. PMID 16262728. S2CID 24273412.
- Kümmel D、Müller JJ、Roske Y、et al. (2006)。「TRAPP の Bet3-Tpc6B コアの構造: 2 つの Tpc6 パラログが Bet3 および Mum2 と三量体複合体を形成する」。J. Mol. Biol . 361 (1): 22–32. doi :10.1016/j.jmb.2006.06.012. PMID 16828797。
- Yu S, Satoh A, Pypaert M, et al. (2006). 「mBet3p は哺乳類細胞における同型 COPII 小胞の結合に必要である」J. Cell Biol . 174 (3): 359–68. doi :10.1083/jcb.200603044. PMC 2064232. PMID 16880271 .
- Kümmel D, Heinemann U, Veit M (2006). 「輸送タンパク質粒子成分 Bet3 のユニークな自己パルミトイル化活性: タンパク質の安定性に必要なメカニズム」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (34): 12701–6. Bibcode :2006PNAS..10312701K. doi : 10.1073/pnas.0603513103 . PMC 1562543 . PMID 16908848.