ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| THSD1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | THSD1、TMTSP、UNQ3010、トロンボスポンジン1型ドメイン含有1、ANIB12 |
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| 外部ID | オミム:616821; MGI : 1929096;ホモロジーン: 10264;ジーンカード:THSD1; OMA :THSD1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 A2 | 始める | 22,717,329 bp [2] |
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| 終わり | 22,751,350 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 心室帯
- 右肺
- 心の頂点
- 胎盤
- 左肺の上葉
- 睾丸
- 皮下脂肪組織
- 側頭葉
- 扁桃体
- 左心室
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| | トップの表現 | - 外頸動脈
- 内頸動脈
- 左肺葉
- リップ
- リンパ管の内皮細胞
- 背中の皮膚
- 右肺葉
- 毛包
- 真皮
- 卵黄嚢
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001205253 NM_001293688 NM_019576 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001192182 NP_001280617 NP_062522 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 52.38 – 52.42 Mb | 8 章: 22.72 – 22.75 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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トロンボスポンジン1型ドメイン含有タンパク質1は、ヒトではTHSD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
この遺伝子によってコードされるタンパク質には、補体経路に関与する多くのタンパク質であるトロンボスポンジンや細胞外マトリックスタンパク質に見られるタイプ1トロンボスポンジンドメインが含まれています。異なるアイソフォームをコードする代替スプライス転写バリアントが観察されています。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000136114 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031480 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: THSD1 トロンボスポンジン、タイプ I、ドメイン含有 1"。
さらに読む
- Bork P (1993). 「結合組織成長因子に関連する新しい成長調節因子ファミリーのモジュール構造」FEBS Lett . 327 (2): 125–30. doi : 10.1016/0014-5793(93)80155-N . PMID 7687569.
- Gruber HE、Ingram JA、 Hanley EN (2007)。「ヒトおよびサンドラット の椎間板におけるトロンボスポンジンの免疫局在」。脊椎。31 ( 22): 2556–61。doi :10.1097/01.brs.0000241117.31510.e3。PMID 17047544。S2CID 43521262 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Orr AW、Pallero MA、Xiong WC、Murphy-Ullrich JE (2005)。「トロンボスポンジンはFAK依存性シグナル伝達を介してRhoA不活性化を誘導し、接着斑の分解を刺激する」。J . Biol. Chem . 279 (47): 48983–92. doi : 10.1074/jbc.M404881200 . PMID 15371459。
- Dunham A、Matthews LH、Burton J、他 (2004)。「ヒト染色体 13 の DNA 配列と分析」。Nature 428 ( 6982 ) : 522–8。Bibcode : 2004Natur.428..522D。doi : 10.1038 /nature02379。PMC 2665288。PMID 15057823。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。