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重複感染とは、特に外因性または内因性の異なる微生物によって、最初の感染に対する治療に抵抗性を示す別の感染が、以前の感染に重なって起こる状態を指します。 [ 1 ]細菌学における例としては、広域スペクトル抗生物質による治療後に起こる内因性クロストリジオイデス・ディフィシルの過剰増殖や、免疫不全患者における緑膿菌による肺炎や敗血症などが挙げられます。[ 2 ]
ウイルス学では、定義が若干異なります。重複感染とは、以前に1つのウイルスに感染した細胞が、後日、別のウイルス株または別のウイルスに同時感染するプロセスです。 [ 3 ]場合によっては、ウイルス重複感染は、元の感染の治療に使用されていた抗ウイルス薬に対して耐性を示すことがあります。ウイルス重複感染は、宿主の免疫応答に対しても感受性が低い場合があります。[ 4 ]ジカウイルス感染症では、別のフラビウイルスであるビンジャリウイルスの一次感染が、蚊の細胞におけるジカウイルスの二次感染を直接阻害するという証拠がいくつかあります。 [ 5 ]最近のメタゲノム解析では、新型コロナウイルスSARS-CoV-2が、ライノウイルス種やモラクセラ属などの他の病原体の重複感染および定着と関連していることが示されています。[ 6 ]