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スーパーヘリックスとは、ヘリックス自体がヘリックス状に巻かれた分子構造です。これは、タンパク質と、過度に巻き付いた環状DNAなどの遺伝物質の両方にとって重要です。
分子生物学における最も古い重要な参考文献は、1971 年に FB Fuller によって書かれたものです。
空間曲線の幾何学的不変量である「身悶え数」が定義され、研究されている。ねじれたコードの中心曲線の場合、身悶え数は中心曲線のコイル化がコードの局所的なねじれをどの程度緩和したかを測定する。この研究は、超コイル二本鎖DNAリングの研究で生じる疑問に答えるために始まった。[1]
うねりの数について、数学者のWFポールはこう述べています。
うねり数は閉空間曲線の全体的幾何学の標準的な尺度であることはよく知られている。[2]
直感に反して、トポロジカルな性質である連結数 は、次の関係に従って、 幾何学的な性質であるねじれとよじれから生じます。
- L k = T + W、
ここで、L kは連結数、Wはねじれ、T はコイルの ねじれです。
結合数とは、1 つの鎖が他の鎖に巻き付く回数を指します。 DNA ではこの特性は変化せず、トポイソメラーゼと呼ばれる特殊な酵素によってのみ変更できます。
参照
- DNAスーパーコイル(超らせんDNA)
- コイルコイル
- 結び目理論
参考文献
- ^ Fuller, F. Brock (1971). 「空間曲線のよじれ数」(PDF) . Proceedings of the National Academy of Sciences . 68 (4): 815– 819. Bibcode :1971PNAS...68..815B. doi : 10.1073/pnas.68.4.815 . MR 0278197. PMC 389050 . PMID 5279522.
- ^ Pohl, William F. (1968). 「閉空間曲線の自己連結数」.数学と力学ジャーナル. 17 (10): 975– 985. doi : 10.1512/iumj.1968.17.17060 . MR 0222777.
外部リンク
- Weisstein, Eric W.「Călugăreanu 定理」。MathWorld。
- ワイスタイン、エリック W.「Writhe」。MathWorld。
- Weisstein、Eric W.「Twist」。MathWorld。
- 分子生化学 II: ベロ講義における DNA の構造とトポロジー。
