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| サブチラーゼ3ファミリー | |||||||||
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 ヒルの一種ヒルド・メディシナリス由来のエラスターゼ阻害剤であるエグリンCとサブチリシン・カールスバーグとの間に形成される複合体の構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ペプチダーゼ_S8 | ||||||||
| パム | PF00082 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00125 | ||||||||
| メロプス | S8 | ||||||||
| SCOP2 | 1cse / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00306 | ||||||||
| メンブラノーム | 546 | ||||||||
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サブチラーゼは、サブチリシン様セリンプロテアーゼのファミリーです。トリプシンセリンプロテアーゼと同様に、Asp / Ser / His触媒三元が独立して収束的に進化したようです。このファミリーのタンパク質の構造は、7 本の鎖からなる平行なベータシートを含むアルファ/ベータフォールドを持つことを示しています。
ズブチリシンファミリーは、現在までに特徴付けられているセリンプロテアーゼファミリーの中で2番目に大きい。現在200種類以上のズブチラーゼが知られており、そのうち170種類以上について完全なアミノ酸配列が分かっている。[2]ズブチラーゼは広く分布しており、真正細菌、古細菌、真核生物、ウイルスに見られる。[3]ファミリーの大部分はエンドペプチダーゼであるが、エキソペプチダーゼであるトリペプチジルペプチダーゼも存在する。[ 3 ] [4]ズブチリシンファミリーのいくつかのメンバーの構造が決定されており、ズブチリシンはキモトリプシンと同じ触媒トライアドを利用するが、残基の順序が異なる（キモトリプシンではHis/Asp/Ser、ズブチリシンではAsp/His/Ser）ことが示されている。それ以外では、構造は他のタンパク質との類似性は示さない。[3] [4]いくつかのサブチリシンはモザイクタンパク質であるが、他のサブチリシンはN末端とC末端の延長を含み、他の既知のタンパク質との配列類似性を示さない。[3]配列相同性に基づいて、6つのファミリーへの細分化が提案されている。[2]
プロタンパク質処理エンドペプチダーゼであるケキシン、フーリン、および関連酵素は、ケキシンサブファミリー（S8B）として知られる独自のサブファミリーを形成している。これらは、C末端を優先的に切断して、一対の塩基性アミノ酸にする。このサブファミリーのメンバーは、活性部位の周りの微妙に異なるモチーフによって識別できる。[3] [4]ケキシンファミリーのメンバーは、酵母Tritirachium由来のエンドペプチダーゼR、T、K、およびMetarhizium由来のクチクラ分解ペプチダーゼとともに、チオール活性化を必要とする。これは、活性ヒスチジンの近くにCys-173が存在するためである。[4]サブチリシンファミリーのウイルスメンバーは、アメリカナマズに感染するヘルペスウイルス1由来の56kDaプロテアーゼの1つだけが知られている。[3]
セドリシン（セリンカルボキシルペプチダーゼ）は、サブチリシンに似た構造を持つタンパク質分解酵素であるが、成熟した触媒ドメインには約 375 個のアミノ酸が含まれており、かなり大きい。これらの酵素の特徴は、Ser/Glu/Asp というユニークな触媒三元構造と、オキシアニオンホールにアスパラギン酸残基が存在することである。現在、Pseudomonas sp. 101 由来のセドリシンと、好熱性細菌 Bacillus novo sp. MN-32 由来のクマモリシンの高解像度結晶構造が解明されている。ヒト遺伝子の変異は、致命的な神経変性疾患を引き起こす。[5]
このドメインを含むヒトタンパク質
FURIN ; MBTPS1 ; PCSK1 ; PCSK2 ; PCSK4 ; PCSK5 ; PCSK6 ; PCSK7 ; PCSK9 ; TPP2 ;
参考文献
- ^ Bode W、Papamokos E、Musil D (1987 年 8 月)。「ヒル Hirudo medicinalis 由来のエラスターゼ阻害剤であるエグリン C とサブチリシン カールスバーグの複合体の高解像度 X 線結晶構造。構造解析、サブチリシン構造および界面形状」。Eur . J. Biochem . 166 (3): 673–92. doi : 10.1111/j.1432-1033.1987.tb13566.x . PMID 3301348。
- ^ ab Siezen RJ、Leunissen JA (1997)。「サブチラーゼ：サブチリシン様セリンプロテアーゼのスーパーファミリー」。Protein Sci . 6 (3): 501–523. doi :10.1002/pro.5560060301. PMC 2143677 . PMID 9070434。
- ^ abcdef Rawlings ND、Barrett AJ (1994)。「セリンペプチダーゼのファミリー」。タンパク質分解酵素：セリンおよびシステインペプチダーゼ。酵素学の方法。第244巻。pp. 19–61。doi : 10.1016/0076-6879(94) 44004-2。ISBN 9780121821456. PMC 7133253 . PMID 7845208.
- ^ abcd Rawlings ND 、 Barrett AJ (1993)。「ペプチダーゼの進化ファミリー」。Biochem . J. 290 ( Pt 1) : 205–218。doi :10.1042/bj2900205。PMC 1132403。PMID 8439290。
- ^ Wlodawer A, Oda K, Li M, Gustchina A, Dunn BM, Oyama H (2003). 「セドリシンファミリーのセリンカルボキシルペプチダーゼの構造と酵素特性」. Acta Biochim. Pol . 50 (1): 81–102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349.
外部リンク
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス CLV_PCSK_FUR_1
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス CLV_PCSK_PC1ET2_1
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス CLV_PCSK_PC7_1
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス CLV_PCSK_SKI1_1
