| スフィンゴモナス科 | |
|---|---|
| スフィンゴモナス・フィロスファエラエの培養 | |
| 科学的分類 | |
| ドメイン: | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス: | アルファプロテオバクテリア |
| 注文: | スフィンゴモナダ目 |
| 家族: | スフィンゴモナス 科 Kosako et al. 2000年 |
| タイプ属 | |
| スフィンゴモナス 藪内ら1990
| |
| 属[1] | |
| |
スフィンゴモナダ科は、アルファプロテオバクテリアのグラム陰性細菌科である。重要な特徴は、細胞壁の外膜にスフィンゴ脂質(主に2'-ヒドロキシミリストイルジヒドロスフィンゴシン1-グルクロン酸、「SGL-1」)が存在することである。 [2] [3]細胞は卵形または桿体である。他の細胞は多形性であり、つまり細胞が時間の経過とともに形状を変える。スフィンゴモナダ科のいくつかの種は、バイオフィルムの主要な構成要素である。[4] [5] [6]
エネルギー源
スフィンゴモナス科のほとんどの種は従属栄養性であるが、[7]いくつかは光栄養性である。
関数
スフィンゴモナダ科のいくつかの種は、いくつかの芳香族化合物を分解することが知られており、環境修復において興味深い細菌となっている。[8]
スフィンゴモナダ科に属するスフィンゴビウム、ノボスフィンゴビウム、[a]、スフィンゴピキシスなどの属は多様な代謝能力を持ち、ビスフェノールAの存在下で適応し、増殖することができます。スフィンゴモナダ科の菌が豊富な微生物群は、一定の速度でビスフェノールAを分解することができます。[9]
スフィンゴモナス属のいくつかの種は、一定の粘度を持つ細胞外多糖類の一種であるスフィンガンを生産することができる。スフィンガンのこの性質は、食品や医薬品を含む多くの産業で有用である。[10] [7]
分布
スフィンゴモナス科の細菌は、水、 [5]土壌、[11] [12]堆積物[7] [13]など、さまざまな環境に分布しています。
系統発生
現在受け入れられている分類法は、命名法に定められた原核生物名のリスト[1]に基づいており、系統発生は全ゲノム配列に基づいています。[14] [b]
人間と植物との関わり
スフィンゴモナダ科のいくつかの種は、飲料水システム、 [15] [5]病院や家庭の水道水、[16]医療機器など、人間の影響を受ける環境に一般的に存在します。 [17] [18] [19]
スフィンゴモナダ科の種のほとんどは、人間や植物に有害であるとは知られていない。[7]一部の種は、 Thielaviopsis basicolaやRhizoctonia solaniなどの病原菌から植物を保護することができる。[7] [12] [11] [20]
スフィンゴモナス属とスフィンゴビウム属は、スフィンゴモナダ科の他の3つの属(ノボスフィンゴビウム、[a]スフィンゴピキシス、ブラストモナス)と比較して、抗生物質耐性が高い傾向があります。[5]
参照
- ジヒドロスフィンゴシン
- グルクロン酸
- 2-ヒドロキシ酸、2′-ヒドロキシミリストイル
- ミリスチン酸、2′-ヒドロキシミリストイル
注記
- ^ ab LPSNによれば、スフィンゴモナダ科に属していない
- ^ Aestuariisphingobium、Aquisediminimonas、Chakrabartia、Parablastomonas、およびSphingosinithalassobacterはこの系統樹には含まれていません。
参考文献
- ^ ab Euzéby JP, Parte AC. 「Sphingomonadaceae」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2021年6月4日閲覧。
- ^ Garrity GM、Brenner DJ、Krieg NR、Staley JR 編 (2005)。Bergey 's Manual of Systematic Bacteriology。第 2 巻、プロテオバクテリア、パート C: アルファ、ベータ、デルタ、イプシロンプロテオバクテリア。ニューヨーク、ニューヨーク: Springer。ISBN 978-0-387-24145-6。
- ^ Ikushiro H, Islam MM, Tojo H, Hayashi H (2007年8月). 「Sphingobacterium multivorumおよびBdellovibrio stolpii由来の膜関連可溶性セリンパルミトイルトランスフェラーゼの分子特性」. Journal of Bacteriology . 189 (15): 5749–61. doi : 10.1128/JB.00194-07 . PMC 1951810. PMID 17557831.
- ^ de Vries HJ、Beyer F、Jarzembowska M、Lipińska J、van den Brink P、Zwijnenburg A、他。 (2019-01-25)。 「汚れた膜からのスフィンゴモナス科」。npj バイオフィルムとマイクロバイオーム。5 (1): 6.土井:10.1038/s41522-018-0074-1。PMC 6347639。PMID 30701078。
- ^ abcd Vaz-Moreira I、Nunes OC、Manaia CM(2011年8月)。「飲料水由来のSphingomonadaceae分離株の多様性と抗生物質耐性パターン」。応用 環境微生物学。77 (16):5697–706。Bibcode :2011ApEnM..77.5697V。doi :10.1128 /AEM.00579-11。PMC 3165245。PMID 21705522。
- ^ Li L、Jeon Y、Lee SH、Ryu H、Santo Domingo JW、Seo Y(2019年7月)。「藻類有機物と腐植物質の影響下におけるバイオフィルムの生理化学的構造とコミュニティ構造のダイナミクス」。 水研究。158:136–145。Bibcode :2019WatRe.158..136L。doi :10.1016 / j.watres.2019.04.014。PMC 6563348。PMID 31026675。
- ^ abcde Glaeser SP、 Kämpfer P (2014)。「スフィンゴモナダ科」。Rosenberg E、DeLong EF、Lory S、Stackebrandt E (編)。原核生物。ベルリン、ハイデルベルク:Springer。pp. 641–707。doi :10.1007/ 978-3-642-30197-1_302。ISBN 978-3-642-30197-1。
{{cite book}}:|work=無視されました (ヘルプ) - ^ Balkwill DL、Fredrickson JK、 Romine MR (2006 年 10 月 12 日)。「スフィンゴモナス属と関連属」。原核生物、細菌生物学ハンドブック。第 7 巻:プロテオバクテリア: デルタおよびイプシロン サブクラス。Deeply Rooting Bacteria。ISBN 978-0-387-33493-6。
- ^ Oh S 、Choi D(2019年4月)。「微生物コミュニティはスフィンゴモナダ科の選択を通じてビスフェノールAの生分解性を高める」微生物生態学。77 (3):631–639。doi : 10.1007 /s00248-018-1263-4。PMID 30251120。S2CID 52811122 。
- ^ Li H, Jiao X, Sun Y, Sun S, Feng Z, Zhou W, Zhu H (2016年11月). 「海洋Sphingomonas sp. WGからの新規スフィンガンWLの調製と特性評価」. Scientific Reports . 6 (1): 37899. Bibcode :2016NatSR...637899L. doi :10.1038/srep37899. PMC 5121650. PMID 27883073 .
- ^ ab Kyselková M、Almario J、Kopecký J、Ságová-Marečková M、Haurat J、Muller D、他。 (2014年8月)。 「農家の圃場におけるタバコ黒根腐病抑制性の根粒細菌指標の評価」。環境微生物レポート。6 (4): 346-53。土井:10.1111/1758-2229.12131。PMID 24992533。
- ^ ab Gómez Expósito R、de Bruijn I、Postma J、Raaijmakers JM (2017-12-18)。 「病気抑制土壌における根圏細菌の役割に関する最新の洞察」。微生物学のフロンティア。8 : 2529.土井: 10.3389/fmicb.2017.02529。PMC 5741648。PMID 29326674。
- ^ Jin L, Ko SR, Jin CZ, Jin FJ, Li T, Ahn CY, Oh HM, Lee HG (2019-08-01). 「淡水堆積物から分離されたスフィンゴモナダ科の新種 Aquisediminimonas profunda 属新種、新種新種、および新種 Aquisediminimonas sediminicola 属新種の説明」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 69 (8): 2179–2186. doi : 10.1099/ijsem.0.003347 . PMID 31204973.
- ^ Hördt, Anton; López, Marina García; Meier-Kolthoff, Jan P.; Schleuning, Marcel; Weinhold, Lisa-Maria; Tindall, Brian J.; Gronow, Sabine; Kyrpides, Nikos C.; Woyke, Tanja; Göker, Markus (2020年4月7日). 「1,000以上のタイプ株ゲノムの分析により、アルファプロテオバクテリアの分類が大幅に改善」. Frontiers in Microbiology . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689. PMID 32373076.
- ^ Li D, Li Z, Yu J, Cao N, Liu R, Yang M (2010 年 11 月). 「赤水発生時の飲料水配水システムにおける細菌群集構造の特徴」.応用環境微生物学. 76 (21): 7171–80. Bibcode :2010ApEnM..76.7171L. doi : 10.1128/AEM.00832-10. PMC 2976220. PMID 20851995.
- ^ Narciso-da-Rocha C、Vaz-Moreira I、Manaia CM (2014 年 1 月)。「病院の水道水から分離されたスフィンゴモナダ科の遺伝子多様性と抗生物質耐性」。総合環境の科学。466–467: 127–35。Bibcode :2014ScTEn.466..127N。doi :10.1016/ j.scitotenv.2013.06.109。PMID 23892027 。
- ^ Soto-Giron MJ、Rodriguez-R LM、Luo C、Elk M、Ryu H、Hoelle J、他 (2016 年 5 月)。Besser TE (編)。「病院のシャワーホースのバイオフィルム: 特性と院内感染への影響」。応用環境微生物学。82 (9): 2872–2883。Bibcode : 2016ApEnM..82.2872S。doi : 10.1128/AEM.03529-15。PMC 4836434。PMID 26969701。
- ^ Poza M, Gayoso C, Gómez MJ, Rumbo-Feal S, Tomás M, Aranda J, et al. (2012-08-29). 「GS-FLX チタン ピロシークエンスによる病院環境における細菌多様性の調査」. PLOS ONE . 7 (8): e44105. Bibcode :2012PLoSO...744105P. doi : 10.1371/journal.pone.0044105 . PMC 3430676. PMID 22952889 .
- ^ Meric M、Willke A、Kolayli F、Yavuz S、Vahaboglu H (2009 年 3 月)。「集中治療室における水系媒介性スフィンゴモナス・パウシモビリス流行」 。The Journal of Infection。58 (3): 253–5。doi :10.1016/j.jinf.2009.01.007。PMID 19232740 。
- ^ Chapelle E、Mendes R、Bakker PA、Raaijmakers JM (2016 年 1 月)。 「根圏マイクロバイオームへの真菌の侵入」。ISMEジャーナル。10 (1): 265-8.土井:10.1038/ismej.2015.82。PMC 4681858。PMID 26023875。
