| SYT13 |
|---|
 |
| 利用可能な構造物 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| 別名 | SYT13、シナプトタグミン13 |
|---|
| 外部ID | オミム: 607716 ; MGI : 1933945 ;ホモロジーン: 10823 ;ジーンカード: SYT13 ; OMA : SYT13 - オルソログ |
|---|
|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
|---|
| トップは | - 中側頭回
- ブロードマン地区23
- 内皮細胞
- 視床外側核群
- ランゲルハンス島
- ポンス
- コンパクト部
- 上前頭回
- 中心後回
- 内嗅皮質
|
| | トップは | - ランゲルハンス島
- 内側背側核
- 手綱
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 視覚野
- 視床下部背内側核
- 一次視覚野
- 中脳の中心灰白質
- 内側膝状体
- 腹側被蓋野
|
| | より多くの参照発現データ |
|
|---|
| バイオGPS |  | | より多くの参照発現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | - カルシウム依存性リン脂質結合
- クラスリン結合
- カルシウムイオン結合
- シンタクシン結合
- SNARE結合
- ホスファチジルセリン結合
| | 細胞成分 | - 膜の不可欠な構成要素
- プラズマ膜の構成要素
- 輸送小胞
- 細胞内膜で囲まれたオルガネラ
- 膜
- 細胞膜
- シナプス前部
- シナプス
- 細胞外分泌小胞
| | 生物学的プロセス | - 小胞を介した輸送
- 小胞融合
- カルシウムイオン依存性エキソサイトーシスの調節
- カルシウムイオンによって調節される神経伝達物質のエキソサイトーシス
- ドーパミン分泌の調節
- シナプス小胞のエキソサイトーシス
- カルシウムイオン調節性エキソサイトーシス
- カルシウムイオンに対する細胞応答
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
シナプトタグミン-13は、ヒトではSYT13遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]
関数
SYT13は、大きなシナプトタグミンタンパク質ファミリーに属します。すべてのシナプトタグミンは、細胞外N末端、単一の膜貫通領域、およびタンデムC2ドメインを含む細胞質C末端を持つI型膜トポロジーを示します。シナプトタグミンの主な機能には、小胞輸送、エキソサイトーシス、および分泌が含まれます。[OMIM提供] [ 6 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000019505 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027220 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑福田正、三子柴和也(2001年3月)「KIAA1427タンパク質の非典型的シナプトタグミン(Syt XIII)としての特性解析」 . The Biochemical Journal . 354(Pt 2):249–57 . doi: 10.1042 / 0264-6021:3540249 . PMC 1221650. PMID 11171101 .
- 1 2 "Entrez Gene: SYT13 synaptotagmin XIII"。
さらに読む
- 長瀬 哲也、菊野 亮、石川 紀之、広沢 雅彦、大原 修(2000年2月)「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVI. 試験管内で大型タンパク質をコードする脳由来の新規cDNAクローン150個の完全配列」 . DNA Research . 7 (1): 65–73 . doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA(2000年11月)。「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」。Genome Research。10(11 ):1788–95。doi:10.1101/ gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422–35 .土井: 10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、Pepperkok R、Wiemann S (2000年9月) 「大規模cDNAシーケンスによって同定された新規タンパク質の系統的な細胞内局在」 EMBO Reports 1 ( 3): 287–92 . doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
- Craxton M (2001年9月) 「シナプトタグミン遺伝子のゲノム解析」Genomics.77 ( 1–2 ): 43–9.doi : 10.1006 / geno.2001.6619.PMID 11543631 .
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44 .土井: 10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336。
- Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S (2006 年 1 月)。「2006年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Research。34 (データベース特集号): D415-8。doi : 10.1093 /nar/ gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。