ホモサピエンスのタンパク質コード遺伝子
| STRBP |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | STRBP、HEL162、ILF3L、SPNR、p74、精子細胞核周RNA結合タンパク質 |
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| 外部ID | オミム:611138; MGI : 104626;ホモロジーン: 7548;ジーンカード:STRBP; OMA :STRBP - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2|2 B | 始める | 37,373,240 bp [2] |
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| 終わり | 37,593,871 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 一次視覚野
- 視床の外側核群
- ブロードマン領域23
- 精子
- 神経節隆起
- 内皮細胞
- 頭頂葉
- 中心後回
- 鼻咽頭上皮
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 涙腺
- 性器結節
- 受精卵
- 内側背核
- 嗅上皮
- 吻側回遊流
- 内側膝状体
- 精母細胞
- 二次卵母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- 二本鎖RNA結合
- タンパク質結合
- 一本鎖RNA結合
- RNA結合
- 微小管結合
- チューブリン結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 機械感覚行動
- 細胞分化
- 精子形成
- 精子細胞の発達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001171137 NM_018387 NM_001376106 NM_001376107 NM_001376109 |
| NM_009261 NM_176932 NM_001355259 NM_001379314 NM_001379315
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NM_001379316 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001164608 NP_060857 NP_001363035 NP_001363036 NP_001363038 |
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NP_033287 NP_001342188 NP_001366243 NP_001366244 NP_001366245 |
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| 場所 (UCSC) | 9 章: 123.11 – 123.27 Mb | 2 章: 37.37 – 37.59 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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精子細胞核周RNA結合タンパク質は、ヒトではSTRBP遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000165209 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026915 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: STRBP 精子細胞核周縁 RNA 結合タンパク質」。
さらに読む
- Schumacher JM、Lee K、Edelhoff S、 Braun RE (1995年5 月)。「細胞質微小管に局在するマウス RNA 結合タンパク質 Spnr」。The Journal of Cell Biology。129 ( 4 ): 1023–32。doi :10.1083/jcb.129.4.1023。PMC 2120489。PMID 7744952。
- Schumacher JM、Artzt K、Braun RE (1998 年 7 月)。 「マウスの精子細胞核周縁リボ核酸結合タンパク質は、in vitro で微小管に結合し、in vivo で異常なマンシェットと結合する」。 生殖生物学。59 (1): 69–76。doi : 10.1095/biolreprod59.1.69。PMID 9674995。
- Coolidge CJ、 Patton JG (2000 年 3 月)。 「 PKR と相互作用する新しい二本鎖 RNA 結合タンパク質」。核酸研究。28 (6): 1407–17。doi :10.1093/ nar /28.6.1407。PMC 111047。PMID 10684936。
- Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422-35。土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R 、 Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614。
- Pires-daSilva A、Nayernia K、Engel W、Torres M、Stoykova A、Chowdhury K、Gruss P (2001 年 5 月)。「精子細胞核周縁 RNA 結合タンパク質を欠損したマウスは、神経学的、精子形成的、および精子形態学的異常を示す」( PDF )。発達生物学。233 (2): 319–28。doi :10.1006/dbio.2001.0169。hdl : 11858 / 00-001M -0000-0012-F717-7。PMID 11336498。
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44。土井:10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、 Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S (2006 年 1 月)。 「2006 年の LIFEdb データベース」。核酸研究。34 (データベースの問題): D415–8。土井:10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。