ＳＰＳＢ１

ＳＰＳＢ１
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2JK9、3F2O
識別子
エイリアス	SPSB1、SSB-1、SSB1、splA/リアノジン受容体ドメインおよび1を含むSOCSボックス
外部ID	オミム：611657; MGI : 1921896;ホモロジーン: 11832;ジーンカード：SPSB1; OMA :SPSB1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	9,369,532 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体4（マウス）
終わり	150,039,500 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	脱落膜; ; 胸部大動脈下行; ; 上行大動脈; ; 脛骨動脈; ; 胃粘膜; ; 伏在静脈; ; 胆嚢; ; 大静脈; ; 右冠動脈; ; 左冠動脈;
	トップの表現
	脱落膜; ; 積雲細胞; ; 原腸胚; ; 左心室の心筋組織; ; 臼歯; ; 上行大動脈; ; 水晶体上皮; ; 大動脈弁; ; 大動脈領域の中膜; ; 足首;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; ユビキチンタンパク質転移酵素活性; ユビキチンリガーゼ基質アダプター活性;
細胞成分	細胞質; 細胞質; SCFユビキチンリガーゼ複合体;
生物学的プロセス	タンパク質のユビキチン化; タンパク質ポリユビキチン化; 翻訳後タンパク質修飾; ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス; プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	80176
	74646
	ENSG00000171621
	ENSMUSG00000039911
	Q96BD6
	翻訳
	NM_025106
	NM_029035
	NP_079382
	NP_083311
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

SPRYドメインを含むSOCSボックスタンパク質1は、ヒトではSPSB1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000171621 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039911 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (2005年4月). 「SPRYドメイン含有SOCSボックスタンパク質1（SSB-1）はMETと相互作用し、肝細胞増殖因子誘導性Erk-Elk-1-血清応答エレメント経路を強化する」J Biol Chem . 280 (16): 16393–401. doi : 10.1074/jbc.M413897200 . PMID 15713673.
^ Kile BT、Schulman BA、Alexander WS、Nicola NA、Martin HM、Hilton DJ (2002 年 6 月)。「SOCS ボックス: 破壊と劣化の物語」。Trends Biochem Sci . 27 (5): 235–41。doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6。PMID 12076535 。
^ 「Entrez Gene: SPSB1 splA/リアノジン受容体ドメインおよびSOCSボックスを含む1」。

さらに読む

Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、他 (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
Yu W、Andersson B、Worley KC、et al. (1997)。「大規模連結cDNAシークエンシング」。Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 。
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Woo JS、Imm JH、Min CK、et al. (2006)。「B30.2/SPRYドメインの構造的および機能的洞察」。EMBO J. 25 ( 6): 1353–63. doi :10.1038/sj.emboj.7600994. PMC 1422157. PMID 16498413 。
Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000171621 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039911 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid15713673-5] Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (2005年4月). 「SPRYドメイン含有SOCSボックスタンパク質1（SSB-1）はMETと相互作用し、肝細胞増殖因子誘導性Erk-Elk-1-血清応答エレメント経路を強化する」J Biol Chem . 280 (16): 16393–401. doi : 10.1074/jbc.M413897200 . PMID 15713673.

[pmid12076535-6] ^ Kile BT、Schulman BA、Alexander WS、Nicola NA、Martin HM、Hilton DJ (2002 年 6 月)。「SOCS ボックス: 破壊と劣化の物語」。Trends Biochem Sci . 27 (5): 235–41。doi :10.1016/S0968-0004(02)02085-6。PMID 12076535 。

[entrez-7] 「Entrez Gene: SPSB1 splA/リアノジン受容体ドメインおよびSOCSボックスを含む1」。