臨床的意義
ヒトでは、冠動脈疾患に関するゲノムワイド関連研究(GWAS)において、150個のSNPに基づく特定のゲノム領域が特定された。そこで、ロッテルダム研究の724人の白人被験者において、最近の喫煙とこれらの冠動脈疾患関連遺伝子内およびその近傍のCpG部位との関連性が調査された。特定されたメチル化部位はSMG6と他の遺伝子に見られ、これらの部位のいくつかは、喫煙経験のない被験者と比較して、現在喫煙している被験者でメチル化レベルが低いことが示された。[ 22 ]
臨床マーカー
SMG6遺伝子を含む27の遺伝子座の組み合わせに基づく多遺伝子座遺伝的リスクスコア研究では、新規発症および再発性冠動脈疾患イベントのリスクが高い個人と、スタチン療法による臨床的利益が増加する個人が特定されました。この研究は、コミュニティコホート研究(マルメ食生活とがん研究)と、一次予防コホート(JUPITERおよびASCOT)および二次予防コホート(CAREおよびPROVE IT-TIMI 22)の4つの追加のランダム化比較試験に基づいています。[ 12 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000070366 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038290 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- 1 2 Reichenbach P、Höss M 、Azzalin CM、Nabholz M、Bucher P、Lingner J (2003 年 4 月)。「酵母 Est1 のヒト相同体はテロメラーゼと結合し、過剰発現時に染色体末端を脱キャップする」。Current Biology。13 ( 7 ) : 568–74。doi : 10.1016 / S0960-9822(03 ) 00173-8。PMID 12676087。S2CID 14423276。
- 1 2 Snow BE、Erdmann N、Cruickshank J、Goldman H、Gill RM、Robinson MO、Harrington L (2003 年 4 月)。「ヒトにおけるテロメラーゼタンパク質 Est1p の機能的保存」。Current Biology。13 (8): 698–704。doi : 10.1016 / S0960-9822(03 ) 00210-0。PMID 12699629。S2CID 6685276。
- ↑ "Entrez Gene: SMG6 Smg-6ホモログ、ナンセンス媒介mRNA分解因子(C. elegans)" .
- ↑ 「BioGPS - あなたの遺伝子ポータルシステム」 . biogps.org . 2016年10月12日取得。
- ↑ Takeshita D, Zenno S, Lee WC, Saigo K, Tanokura M (2006年7月). "ヒトEST1AのPINドメインの結晶化と予備的なX線解析" . Acta Crystallographica Section F. 62 ( Pt 7): 656–8 . doi : 10.1107/S1744309106020057 . PMC 2242961. PMID 16820686 .
- ↑ Snow BE、Erdmann N、Cruickshank J、Goldman H、Gill RM、Robinson MO、Harrington L (2003 年 4 月)。「ヒトにおけるテロメラーゼタンパク質Est1p の機能的保存」。Current Biology。13 (8): 698–704。doi : 10.1016/s0960-9822(03 ) 00210-0。PMID 12699629。S2CID 6685276。
- ↑ Huntzinger E、Kashima I、Fauser M、Saulière J、Izaurralde E (2008 年 12 月)。「 SMG6は、後生動物のナンセンス コドンを含む mRNAを切断する触媒エンドヌクレアーゼである」。RNA。14 ( 12): 2609–17。doi : 10.1261/ rna.1386208。PMC 2590965。PMID 18974281。
- 1 2 Mega JL、Stitziel NO、Smith JG、Chasman DI、Caulfield MJ、Devlin JJ、Nordio F、Hyde CL、Cannon CP、Sacks FM、Poulter NR、Sever PS、Ridker PM、Braunwald E、Melander O、Kathiresan S、Sabatine MS (2015 年 6 月)。 「遺伝的リスク、冠動脈疾患イベント、およびスタチン療法の臨床的利益:一次および二次予防試験の分析」。Lancet。385 (9984): 2264–71。doi : 10.1016 / S0140-6736(14)61730 - X。PMC 4608367。PMID 25748612。
- ↑ "SMG6 SMG6、ナンセンス媒介mRNA分解因子[ Homo sapiens(ヒト)] - 遺伝子 - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . 2016年10月12日取得.
- ↑ "SMG6 - テロメラーゼ結合タンパク質 EST1A - Homo sapiens (ヒト) - SMG6 遺伝子およびタンパク質" . www.uniprot.org . 2016-10-12に取得.
- ↑ Glavan F、Behm-Ansmant I、Izaurralde E、Conti E (2006年11月)。 「SMG6およびSMG5のPINドメインの構造は、mRNA監視複合体内のヌクレアーゼを明らかにする」。The EMBO Journal。25 ( 21 ) : 5117–25。doi : 10.1038 / sj.emboj.7601377。PMC 1630413。PMID 17053788。
- ↑ Takeshita D, Zenno S, Lee WC, Saigo K, Tanokura M (2007年9月). "ヒトテロメラーゼ関連タンパク質EST1AのPINドメインの結晶構造". Proteins . 68 ( 4): 980–9 . doi : 10.1002/prot.21351 . PMID 17557331. S2CID 43477604 .
- ↑ Huntzinger E、Kashima I、Fauser M、Saulière J、Izaurralde E (2008 年 12 月)。「 SMG6は、後生動物のナンセンス コドンを含む mRNAを切断する触媒エンドヌクレアーゼである」。RNA。14 ( 12): 2609–17。doi : 10.1261/ rna.1386208。PMC 2590965。PMID 18974281。
- ↑ Chakrabarti S、Bonneau F、Schüssler S、Eppinger E、Conti E (2014 年 8 月)。「ヘリカーゼ UPF1 と NMD 因子 SMG5-SMG7 および SMG6 のリン酸化依存性およびリン酸化非依存性相互作用」。Nucleic Acids Research。42 ( 14 ) : 9447–60。doi : 10.1093 / nar / gku578。PMC 4132714。PMID 25013172。
- ↑ Karlseder J、 Broccoli D、 Dai Y、 Hardy S、 de Lange T (1999 年 2 月)。「TRF2 を欠損したテロメアによって誘導される p53 および ATM 依存性アポトーシス」。Science。283 (5406): 1321– 5. doi : 10.1126/science.283.5406.1321。PMID 10037601。
- ↑ Huntzinger E、Kashima I、Fauser M、Saulière J、Izaurralde E (2008 年 12 月)。「 SMG6は、後生動物のナンセンス コドンを含む mRNAを切断する触媒エンドヌクレアーゼである」。RNA。14 ( 12): 2609–17。doi : 10.1261/ rna.1386208。PMC 2590965。PMID 18974281。
- ↑ Nicholson P、Josi C、Kurosawa H、Yamashita A、Mühlemann O (2014年8月)。 「SMG6とUPF1間の新規リン酸化非依存性相互作用はヒトNMDに不可欠である」。Nucleic Acids Research。42 ( 14 ): 9217–35。doi : 10.1093/ nar / gku645。PMC 4132754。PMID 25053839。
- ↑ Steenaard RV、Ligthart S、Stolk L、Peters MJ、van Meurs JB、Uitterlinden AG、Hofman A、Franco OH、Dehghan A (2015-01-01)。「喫煙は冠動脈疾患に関連する遺伝子のメチル化と関連している」。Clinical Epigenetics。7 ( 1 ): 54。doi : 10.1186 /s13148-015-0088- y。PMC 4443552。PMID 26015811。
さらに読む
- 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA 研究。9 (3): 99–106。CiteSeerX 10.1.1.500.923。土井:10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- 長瀬 哲也、石川 健、須山 誠、菊野 亮、宮島 直樹、田中 昭、小谷 浩、野村 直樹、大原 修(1998 年 10 月)。 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測。XI. 試験管内で大型タンパク質をコードする脳由来の新規 cDNA クローン 100 個の完全配列」。DNA Research。5 ( 5):277–86。doi: 10.1093/dnares / 5.5.277。PMID 9872452。
- Hoff C、Seranski P、Mollenhauer J 、Korn B、Detzel T、Reinhardt R、Ramser J、Poustka A (2000年11月)「ヒト癌で頻繁に欠失する17p13.3領域の物理的および転写マッピング」Genomics.70 ( 1 ) : 26–33.doi : 10.1006 / geno.2000.6353.PMID 11087658 .
- Chiu SY、Serin G、Ohara O、Maquat LE (2003 年 1 月) 「ヒト Smg5/7a の特性解析: 線虫 Caenorhabditis elegans SMG5 および SMG7 に類似したタンパク質で、Upf1 の脱リン酸化に関与する」 . RNA . 9 (1): 77– 87. doi : 10.1261/rna.2137903 . PMC 1370372 . PMID 12554878 .
- 大西 哲也、山下 昭、鹿島 功、シェル 哲也、アンダース KR、グリムソン A、蜂谷 哲也、ヘンツェ MW、アンダーソン P、大野 聡 (2003 年 11 月) 「hUPF1 のリン酸化は、hSMG-5 および hSMG-7 を含む mRNA 監視複合体の形成を誘導する」 . Molecular Cell . 12 (5): 1187– 200. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00443-X . PMID 14636577 .
- Fukuhara N, Ebert J, Unterholzner L, Lindner D, Izaurralde E, Conti E (2005年2月). "SMG7はナンセンス変異依存性mRNA分解経路における14-3-3様アダプターである" . Molecular Cell . 17 (4): 537–47 . doi : 10.1016/j.molcel.2005.01.010 . PMID 15721257 .
- Azzalin CM、Lingner J(2006年2月)。「ヒトRNA監視因子UPF1はS期進行とゲノム安定性に必要である」。Current Biology。16 (4): 433–9。doi : 10.1016 / j.cub.2006.01.018。PMID 16488880。S2CID 17197870。
- Takeshita D, Zenno S, Lee WC, Saigo K, Tanokura M (2006年7月). "ヒトEST1AのPINドメインの結晶化と予備的なX線解析" . Acta Crystallographica Section F. 62 ( Pt 7): 656–8 . doi : 10.1107/S1744309106020057 . PMC 2242961. PMID 16820686 .
- Glavan F、Behm-Ansmant I、Izaurralde E、Conti E(2006年11月)。 「SMG6およびSMG5のPINドメインの構造は、mRNA監視複合体内のヌクレアーゼを明らかにする」。The EMBO Journal。25 ( 21 ):5117–25。doi:10.1038 / sj.emboj.7601377。PMC 1630413。PMID 17053788。
- Takeshita D, Zenno S, Lee WC, Saigo K, Tanokura M (2007年9月). "ヒトテロメラーゼ関連タンパク質EST1AのPINドメインの結晶構造". Proteins . 68 ( 4): 980–9 . doi : 10.1002/prot.21351 . PMID 17557331. S2CID 43477604 .