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| PINドメイン | |||||||||||
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 アーキオグロバス・フルギドゥス由来の PIN (PilT N 末端) ドメイン (AF0591) の 1.90 オングストロームの解像度での結晶構造。1o4w | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | ピン | ||||||||||
| パム | PF01850 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| 頭いい | CBS | ||||||||||
| SCOP2 | 3dbo / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| 医療機器 | cd09852 | ||||||||||
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分子生物学において、PINドメインは長さが約130アミノ酸のタンパク質ドメインです。PINドメインは、配列または構造依存的に一本鎖RNAを切断するヌクレアーゼ酵素として機能します。 [1] [2]
PINドメインには、ほぼ不変の酸性残基が4つ含まれています。[2]結晶構造では、これらの残基が推定活性部位に集まっていることが示されています。真核生物では、PINドメインは、ナンセンス仲介mRNA分解に関与するタンパク質、 SMG5やSMG6などのタンパク質、および18SリボソームRNAの処理に見られます。原核生物で見られるPINドメインタンパク質の大部分は、毒素-抗毒素オペロンの毒性成分です。[2]これらの遺伝子座は、自由生活性の原核生物が栄養ストレスに対処するのに役立つ制御メカニズムを提供します。[3]
参考文献
- ^ Arcus VL、McKenzie JL 、 Robson J、Cook GM (2011 年 1 月)。「PIN ドメインリボヌクレアーゼと原核生物の VapBC 毒素-抗毒素アレイ」。タンパク質工学、設計、選択。24 (1–2): 33–40。doi : 10.1093/protein/gzq081。PMID 21036780 。
- ^ abc Matelska D、Steczkiewicz K、Ginalski K (2017年7月)。「PINドメイン様スーパーファミリーの包括的分類」。核酸研究。45 (12 ) : 6995–7020。doi :10.1093/ nar /gkx494。PMC 5499597。PMID 28575517。
- ^ Gerdes K、Christensen SK、Løbner-Olesen A (2005 年 5 月)。「原核生物毒素-抗毒素ストレス応答遺伝子座」。Nature Reviews。微生物学。3 (5): 371–82。doi : 10.1038 /nrmicro1147。PMID 15864262。S2CID 13417307。