ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
セマ6A 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3AFC、3AL8、3OKW、3OKY
識別子 エイリアス SEMA6A 、HT018、SEMA、SEMA6A1、SEMAQ、VIA、セマフォリン 6A 外部ID オミム ：605885; MGI : 1203727; ホモロジーン : 32426; ジーンカード ：SEMA6A; OMA :SEMA6A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 18番染色体（マウス） [2] バンド 18|18 世紀 始める 47,368,665 bp [2] 終わり 47,501,937 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 迷走神経下神経節 外淡蒼球 視床下核 脳梁 小腸粘膜 視床の外側核群 網状部 腹側被蓋野 上前庭核 ポンス
トップの表現 胎児の尾 性器結節 脊髄の腰椎部分 卵黄嚢 皮膚頭蓋 膜状骨 上皮層 下顎 鼻中隔軟骨 内側膝状体
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 セマフォリン受容体結合 化学忌避活性 細胞成分
膜の不可欠な構成要素 軸索 細胞膜 膜 細胞膜の不可欠な構成要素 細胞外空間 生物学的プロセス
動物の器官の形態形成 多細胞生物の発達 細胞表面受容体シグナル伝達経路 細胞分化 細胞骨格の構成 神経系の発達 アポトーシスの過程 軸索誘導 ニューロン移動の正の調節 血管新生の抑制 血管新生の抑制 血管新生の芽生えに関与する細胞接着の負の調節 血管内皮増殖因子刺激に対する細胞反応 ERK1およびERK2カスケードの負の制御 血管内皮増殖因子シグナル伝達経路の負の調節 神経堤細胞の移動 細胞移動の正の調節 軸索誘導に関与する軸索伸長の負の調節 負の走化性 セマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001300780 NM_020681 NM_020796
RefSeq (タンパク質) 場所 (UCSC) 5 章: 116.44 – 116.57 Mb 18章: 47.37 – 47.5 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
セマフォリン6A は、ヒトでは SEMA6A 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
メラノサイト細胞ではSEMA6A遺伝子の発現は MITF によって制御されている可能性がある。 [8]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000092421 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000019647 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Zhou L、White FA、Lentz SI、Wright DE、Fisher DA、Snider WD (1997 年 9 月)。「昆虫セマフォリン I と構造類似性を持つ新規マウスセマフォリンのクローニングと発現」。Mol Cell Neurosci . 9 (1): 26–41. doi :10.1006/mcne.1997.0607. PMID 9204478. S2CID 38730386。 ^ Klostermann A、Lutz B、Gertler F、Behl C (2001 年 1 月)。「ヒトおよびマウスの相同セマフォリン 6A-1 タンパク質 (SEMA6A-1/Sema6A-1) は、新規カルボキシル末端ジキシン様ドメインを介して、有効化/血管拡張刺激リン酸化タンパク質様タンパク質 (EVL) に結合する」。J Biol Chem . 275 (50): 39647–53。doi : 10.1074/ jbc.M006316200。PMID 10993894 。 ^ 「Entrez Gene: SEMA6A セマドメイン、膜貫通ドメイン (TM)、および細胞質ドメイン、(セマフォリン) 6A」。 ^ Hoek KS、Schlegel NC、Eichhoff OM、他 (2008)。「2段階DNAマイクロアレイ戦略を用いて同定された新たなMITF標的」。Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373.
さらに読む
プリズレイ S、モゼッティ S、フィリッペッティ F 他（2008年）。 「細胞膜から細胞骨格へ: セマフォリン 6A の新しい機能」。 モル。がんサー 。 7 (1): 233–41。 土井 : 10.1158/1535-7163.MCT-07-0390 。 PMID 18187809。 Katoh M, Katoh M (2007). 「非標準 WNT または平面細胞極性シグナル伝達分子の比較インテグロミクス: 大腸がんにおける PTK7 の転写メカニズムと未分化 ES 細胞における SEMA6A の転写メカニズム」 Int. J. Mol. Med . 20 (3): 405–9. doi : 10.3892/ijmm.20.3.405 . PMID 17671748. Gautier G、de Saint-Vis B、Sénéchal B、et al. (2006)。「クラス 6 セマフォリン SEMA6A はインターフェロン γ によって誘導され、病理学的状況で観察されるランゲルハンス細胞の活性化状態を定義します」。Am . J. Pathol . 168 (2): 453–65. doi :10.2353/ajpath.2006.050288. PMC 1606484. PMID 16436660 。 Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用：長いcDNAからなる機能的に分類されたライブラリーを用いた2ハイブリッドスクリーニング」 Genome Res . 12 (11): 1773–84. doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765 . 永瀬 剛、菊野 亮、石川 KI、他 (2000)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVI。in vitro で巨大タンパク質をコードする脳由来の 150 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198。
