ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
セマ3F 識別子 エイリアス SEMA3F 、SEMA-IV、SEMA4、SEMAK、セマフォリン3F 外部ID オミム ：601124; MGI : 1096347; ホモロジーン : 20885; ジーンカード ：SEMA3F; OMA :SEMA3F - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 9番染色体（マウス） [2] バンド 9|9 F1 始める 107,558,699 bp [2] 終わり 107,587,674 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 歯肉上皮 膵管細胞 ヒップの皮膚 咽頭粘膜 人間のペニス 太ももの皮 毛包 ベータ細胞 腹部の皮膚 鼻上皮
トップの表現 網膜の神経層 リップ 食道 性器結節 右肺 心室帯 角膜実質 左肺 気管支上皮 レンズ
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
化学忌避活性 ニューロピリン結合 セマフォリン受容体結合 細胞成分
細胞外領域 細胞外空間 グルタミン酸シナプス 細胞膜の不可欠な構成要素 生物学的プロセス
交感神経節の発達 腹側体幹神経堤細胞の移動 ニューロン投射誘導に関与するセマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路 負の走化性 軸索誘導に関与するセマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路 軸索誘導 交感神経投射誘導 自律神経系の発達に関わる神経堤細胞の移動 鰓運動ニューロン軸索誘導 顔面神経の構造組織 神経の発達 交感神経投射の延長 三叉神経の構造組織 軸索誘導に関与する軸索伸展 神経堤細胞の移動 軸索誘導に関与する軸索伸長の負の調節 シナプス後組織の制御 細胞移動の正の調節 セマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_004186 NM_001318798 NM_001318800
NM_011349 NM_001311151 NM_001379496
RefSeq (タンパク質) NP_001305727 NP_001305729 NP_004177
NP_001298080 NP_035479 NP_001366425 NP_001391952 NP_001391953 NP_001391954
場所 (UCSC) 3 章: 50.16 – 50.19 Mb 9 章: 107.56 – 107.59 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
セマフォリン3F は、ヒトでは SEMA3F 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
セマフォ リンは シグナル伝達に関与するタンパク質のファミリーです。ファミリーのメンバーはすべて、分泌シグナル、500 アミノ酸のセマドメイン、および 16 個の保存されたシステイン残基を持っています (Kolodkin ら、1993)。配列比較により、分泌セマフォリンは 3 つの一般的なクラス (クラス 2、3、および V) に分類され、すべて免疫グロブリン ドメインも持っています。セマフォリン 3 ファミリーは、ヒト セマフォリン 3A-G (SEMA3A; MIM 603961)、ニワトリ コラプシン、およびマウス セマフォリン 3A-G で構成され、すべて C 末端に基本ドメインを持っています。ニワトリのコラプシンは、相対分子量62Kのコラプシン応答メディエータータンパク質（CRMP62）（Goshima et al., 1995）との相互作用を通じて成長円錐の伸長を阻害することで、発達中の軸索による経路探索に寄与します（Luo et al., 1993）。これは、軸索誘導に関連するUNC33遺伝子産物（MIM 601168）の推定相同体です。SEMA3Fは、セマフォリンIIIファミリーの分泌メンバーです。[OMIM提供] [7]
参考文献
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さらに読む
Goshima Y, Nakamura F, Strittmatter P, Strittmatter SM (1995). 「UNC-33 に関連する細胞内タンパク質によって媒介されるコラプシン誘導性成長円錐崩壊」。Nature . 376 ( 6540): 509–14. Bibcode :1995Natur.376..509G. doi :10.1038/376509a0. PMID 7637782. S2CID 4309140. Kolodkin AL、Matthes DJ、 Goodman CS (1994)。「セマフォリン遺伝子は膜貫通型および分泌型成長円錐誘導分子のファミリーをコード化する」。Cell . 75 (7): 1389–99. doi :10.1016/0092-8674(93)90625-Z. PMID 8269517. S2CID 21047504. Luo Y、Raible D、Raper JA (1993)。「コラプシン：神経成長円錐の崩壊と麻痺を引き起こす脳内のタンパク質」。Cell . 75 ( 2): 217–27. doi : 10.1016/0092-8674(93)80064-L . PMID 8402908. S2CID 46120825. Sekido Y, Bader S, Latif F, et al. (1996). 「ヒトセマフォリン A(V) および IV は 3p21.3 小細胞肺癌欠失領域に存在し、異なる発現パターンを示す」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (9): 4120–5. Bibcode :1996PNAS...93.4120S. doi : 10.1073/pnas.93.9.4120 . PMC 39497 . PMID 8633026. Chen H, He Z, Bagri A, Tessier - Lavigne M (1999). 「クラス III セマフォリンに対する交感神経軸索反応の基礎となるセマフォリン-ニューロピリン相互作用」。 ニューロン 。21 ( 6): 1283–90。doi : 10.1016 /S0896-6273(00)80648-0。PMID 9883722 。 Hirsch E, Hu LJ, Prigent A, et al. (1999). 「成人の脳におけるセマフォリンIVの分布」. Brain Res . 823 (1–2): 67–79. doi :10.1016/S0006-8993(99)01103-8. PMID 10095013. S2CID 46511802. Brambilla E、Constantin B、Drabkin H、Roche J (2000)。「悪性ヒト肺および細胞株におけるセマフォリン SEMA3F の局在：細胞接着および細胞移動における示唆される役割」。Am . J. Pathol . 156 (3): 939–50. doi :10.1016/S0002-9440(10)64962-0. PMC 1876858. PMID 10702410 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Nasarre P、Constantin B、Rouhaud L、et al. (2003)。「セマフォリン SEMA3F と VEGF は細胞接着と拡散に相反する効果をもたらす」。Neoplasia . 5 ( 1): 83–92. doi :10.1016/s1476-5586(03)80020-9. PMC 1502125. PMID 12659673 。 Lantuéjoul S、Constantin B、Drabkin H、他 (2003)。「前浸潤性気管支病変、肺腫瘍、細胞株における VEGF、セマフォリン SEMA3F、およびそれらの共通受容体ニューロピリン NP1 と NP2 の発現」 ( PDF ) 。J . Pathol。200 ( 3): 336–47。doi :10.1002/path.1367。PMID 12845630。S2CID 1283756 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Bielenberg DR、Hida Y、Shimizu A、et al. (2004)。「内皮細胞に対する化学療法抑制剤であるセマフォリン 3F は、血管新生が乏しく、被包された非転移性の腫瘍表現型を誘導する」。J . Clin. Invest . 114 (9): 1260–71. doi :10.1172/JCI21378. PMC 524226. PMID 15520858 。 Gu C, Yoshida Y, Livet J, et al. (2005). 「セマフォリン 3E とプレキシン D1 はニューロピリンとは独立して血管パターンを制御する」. Science . 307 (5707): 265–8. Bibcode :2005Sci...307..265G. doi : 10.1126/science.1105416. PMID 15550623. S2CID 36470855 . Pope SN、Lee IR (2005)。「ヒト性ホルモン結合グロブリンと相互作用する前立腺タンパク質の酵母ツーハイブリッド同定」。J . Steroid Biochem. Mol. Biol . 94 (1–3): 203–8. doi :10.1016/j.jsbmb.2005.01.007. PMID 15862967. S2CID 9746088. Kusy S、Nasarre P、 Chan D、et al. (2005)。「肺癌細胞におけるセマフォリン SEMA3F による生体内腫瘍形成の選択的抑制」。Neoplasia . 7 (5): 457–65. doi :10.1593/neo.04721. PMC 1501157. PMID 15967098 。 Futamura M, Kamino H, Miyamoto Y, et al. (2007). 「3p21.3 の候補腫瘍抑制遺伝子であるセマフォリン 3F の、p53 制御腫瘍血管新生抑制における可能性のある役割」。Cancer Res . 67 (4): 1451–60. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-2485 . PMID 17308083。 Guttmann-Raviv N、Shraga-Heled N、Varshavsky A、et al. (2007)。「セマフォリン-3A とセマフォリン-3F は、協力して内皮細胞を撃退し、アポトーシスを誘導してその生存を阻害する」。J . Biol. Chem . 282 (36): 26294–305. doi : 10.1074/jbc.M609711200 . PMID 17569671。 Menon L、Mihailescu MR (2007)。「セマフォリン3F RNAを形成 するGカルテットと脆弱Xタンパク質ファミリーのRGGボックスドメインとの相互作用」。Nucleic Acids Res。35 （ 16）：5379–92。doi ： 10.1093/nar / gkm581。PMC 2018618。PMID 17693432 。
