| ロバートムラヤ | |
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| 属: | ロバートムラヤ ・グプタら。 2020年
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LPSN 2021に基づく情報 | |
ロバートムラヤ(Robertmurraya)は、バチルス目バチルス科に属する、主にグラム陽性桿菌の属である。[1] [2]この属のタイプ種はRobertmurraya siralisである。[3]
Robertmurraya属は、以前はBacillus属に属する種であり、この属は、その属内で広範な多系統性と系統発生的異質性を示すことが認識されている。 [4] [5] Bacillus属の種間の進化的関係を明らかにするために複数の研究が発表されており、その結果、 Alkalihalobacillus、Brevibacillus、Solibacillus、Alicyclobacillus、 Virgibacillus、Evansellaなど、多数の新しい属が確立されている。[6] [7] [8] [9] [10] [1]さらに、Bacillus属は、 Bacillus subtilisおよびBacillus cereusに近縁の種のみを含むように修正されている。[6] [1]
ロバート・マレーという名前は、細菌分類学の分野における貢献とリーダーシップにより、西オンタリオ大学のカナダ人微生物学者ロバート・GE・マレー博士にちなんで名付けられました。 [1]
生化学的特性と分子シグネチャー
この属の菌は好気性で、砂地や人間の糞便などの場所で見つかる。すべての菌は胞子を形成し、オキシダーゼ陽性およびカタラーゼ陽性である(Robertmurraya massiliosenegalensis を除く)。Robertmurrayaの最適生育温度は30~37°C の範囲である。Robertmurraya種のゲノム配列の解析により、以下のタンパク質に保存されたシグネチャインデル( CSI)が 3 つ特定されている:仮説タンパク質、糖結合転写調節因子、およびアスパラギン合成酵素(グルタミン加水分解)。ほとんどの場合、これらの CSI は、この属のすべてまたはほとんどの菌で排他的に共有されている。[1]これらの分子シグネチャは、この属の菌を他のバチルス科の属や細菌と区別するための信頼性の高い分子的手段となる。 [1]
分類
ロバートムラヤ属には、2021年5月現在、有効な名前が公表されている種が合計10種含まれています。[3]この属は、バチルス属内の分類学的関係を調べた研究において、単系統群であり、系統学的に他のバチルス属とは無関係であると特定されました。[1]この分岐パターンは、ゲノム分類データベース(GTDB)でも観察されています。 [11]
有効に公表されていない3つの種、「Bacillus coreaensis」、「Bacillus dakarensis」、および「Bacillus yapensis」も、系統樹ではRobertmurrayaの他のメンバーとグループ化されており、保存されたシグネチャインデル(CSI)の形で同じ分子マーカーを共有していることが判明しています。 [1]しかし、追加のゲノムと新しい種が発見され割り当てられるにつれて、この属の将来の改訂が必要であることを示す培養株情報が不足しているため、これらの種の移行は正式に提案されていません。
参考文献
- ^ abcdefgh Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip; Saini, Navneet; Chen, Shu (2020-11-01). 「系統ゲノム学と比較ゲノム解析による、バチルス科の新属として提案された17の異なるバチルス種クレードの確固たる区分:Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. の説明、およびバチルス属をSubtilisおよびCereusクレード種のメンバーのみに限定する修正属バチルスの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5753–5798. doi : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026. PMID 33112222.
- ^ ブレンナー、ドン J.; クリーグ、ノエル R.; ステイリー、ジェームズ T.; ギャリティ、ジョージ M.; ブーン、デビッド R.; デ・ヴォス、ポール; グッドフェロー、マイケル; レイニー、フレッド A.; シュライファー、カール ハインツ、編 (2005)。Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology。doi :10.1007 / 0-387-28022-7。ISBN 978-0-387-24144-9。
- ^ ab “Genus: Robertmurraya”. lpsn.dsmz.de . 2021年5月30日閲覧。
- ^ Ash, Carol; Farrow, JAE; Wallbanks, Sally; Collins, MD (2008-06-28). 「小サブユニットリボソームRNA配列の比較分析によって明らかになったバチルス属の系統発生的異質性」. Letters in Applied Microbiology . 13 (4): 202–206. doi :10.1111/j.1472-765x.1991.tb00608.x. ISSN 0266-8254. S2CID 82988953.
- ^ Logan, NA; Berge, O.; Bishop, AH; Busse, H.-J.; De Vos, P.; Fritze, D.; Heyndrickx, M.; Kampfer, P.; Rabinovitch, L.; Salkinoja-Salonen, MS; Seldin, L. (2009-06-30). 「好気性胞子形成細菌の新分類群を記述するための最小基準の提案」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 59 (8): 2114–2121. doi : 10.1099/ijs.0.013649-0 . ISSN 1466-5026. PMID 19567583.
- ^ ab Patel, Sudip; Gupta, Radhey S. (2020-01-01). 「バチルス属の多系統を解決するための系統ゲノムと比較ゲノムの枠組み:バチルス属の6つの新属、Peribacillus gen. nov.、Cytobacillus gen. nov.、Mesobacillus gen. nov.、Neobacillus gen. nov.、Metabacillus gen. nov.、およびAlkalihalobacillus gen. novの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。70 (1): 406–438。doi : 10.1099/ ijsem.0.003775。ISSN 1466-5026。PMID 31617837 。
- ^ 志田央;高木博司門脇 和也;駒形和也 (1996-10-01) 「2 つの新しい属、Brevibacillus gen. nov. および Aneurinibacillus gen. nov の提案」。系統的細菌学の国際ジャーナル。46 (4): 939–946。土井:10.1099/00207713-46-4-939。ISSN 0020-7713。PMID 8863420。
- ^ Wisotzkey, JD; Jurtshuk, P.; Fox, GE; Deinhard, G.; Poralla, K. (1992-04-01). 「Bacillus acidocaldarius、Bacillus acidoterrestris、およびBacillus cycloheptanicusの16S rRNA(rDNA)の比較配列分析と新属Alicyclobacillus gen. novの創設の提案」。International Journal of Systematic Bacteriology。42(2):263–269。doi :10.1099 / 00207713-42-2-263。ISSN 0020-7713。PMID 1374624 。
- ^ Mual, Poonam; Singh, Nitin Kumar; Verma, Ashish; Schumann, Peter; Krishnamurthi, Srinivasan; Dastager, Syed; Mayilraj, Shanmugam (2016-05-01). 「Bacillus isronensis Shivaji et al. 2009 の Solibacillus isronensis comb. nov. への再分類および Solibacillus 属の記述の修正 Krishnamurthi et al. 2009」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 66 (5): 2113–2120. doi : 10.1099/ijsem.0.000982 . ISSN 1466-5026. PMID 26907585.
- ^ Heyndrickx, M.; Lebbe, L.; Kersters, K.; Hoste, B.; De Wachter, R.; De Vos, P.; Forsyth, G.; Logan, NA (1999-07-01). 「Virgibacillus proomii sp. nov. の提案と Virgibacillus pantothenticus (Proom and Knight 1950) の修正された説明 Heyndrickx et al. 1998」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 49 (3): 1083–1090. doi : 10.1099/00207713-49-3-1083 . ISSN 1466-5026. PMID 10425765.
- ^ 「GTDB - ツリー」. gtdb.ecogenomic.org . 2021年5月28日閲覧。
