Loading article…
| ロドバクテリア科 | |
|---|---|
| |
科学的分類 
| |
| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス： | アルファプロテオバクテリア |
| 注文： | ロドバクテリア |
| 家族： | ロドバクテリウム科 Garrity et al . 2006 |
| 属 | |
|
テキストを参照 | |
| 同義語[要出典] | |
| |
ロドバクテリア科は、ロドバクテリア目アルファサブグループのシュードモナス亜門に属する科である。[ 1 ]すべてのシュードモナス亜門と同様に、グラム陰性である。化学有機栄養体と光従属栄養体を含む 。多くは水生生息地に生息する。
属
受け入れられた属
以下の属が有効かつ有効に出版されている：[2] [3]
- アシディマングロビモナス ・レンら。 2019年
- アクチバクテリウム ・ルセナら2012
- Aestuariibius Park et al . 2018年
- Aestuariicoccus Feng et al . 2018年
- エストゥアリハビタンス ・ユンら。 2014年
- Aestuariivita Park et al . 2014年
- アエスチュアリウム ユウ他2019
- アガリシコラ チュウ他2010
- アルビバチルス ・ヘルトら2020
- Albidovulum Albuquerque et al . 2003年
- アルビモナス ・リム他2008
- Albirhodobacter Nupur et al . 2015年
- Aliiroseovarius Park et al . 2015年
- アリシミア ・キム他2019
- アルカリラカス トリス チャン他2019
- Allgaiera Hördt他2020
- Allosediminivita Hördt et al . 2020年
- Amaricoccus Maszenan et al . 1997年
- アミリバクター 寺本と西島 2014
- アンタークティシマイクロビ ウム チャン他2020
- アンタークト バクター・ラブレンツら。 1998年
- アキコッカス ・フェン他2018
- アクミクスティコーラ・ パークら。 2015年
- アレニバチルス キム他2019
- アレニバクテリ ウム・ベック他2020
- ホヤハビタンス キムら。 2014年
- ポソンギコーラ ・パークら2014年
- ブレビハブダス ・ウー他2015
- Carideicomes Wang et al . 2020年
- セレリバクター イワノバ他2010
- セライバクター スレシュ他2015
- チャチェザニア ・ユアンら2020年
- シトレイモナス・ チョイとチョー 2006
- コグニティシミア ・ヴィルトとホイットマン 2018
- コグナティヨニア ・ワースとホイットマン 2018
- Cribrihavetans Chen et al . 2014年
- Cypionkella Hördtら。 2020年
- デフルビイモナス ・フォーセル他2013
- ディノロゼオ バクター ビーブルら2005
- ドンギコラ ・ユン他2007
- エピバクテリ ウム・ペネシアンら2013
- ファルシルホドバクター スバッシュ他2013
- フェルトエイバクター・ シュロツキ他2021
- フラビマリコラ ・ワースとホイットマン 2018
- Fluviibacterium Sun et al . 2020年
- フリジディバクター・ リーとゾウ 2015
- ゲモバクター ・ローテら1988
- ヘマトバクター ・ヘルセルら。 2007年
- ハヒョンチレラ キム アンド リー 2020
- ハロシンシバクター キム他2014
- ハロデュランティバクテリ ウム Lv他2015
- ハロヴルム ・サン他2015
- ハスリバクター キム他2012
- ヒスチディニバクテリ ウム ワン他2019
- ファンハイコラ・キム他2010年
- Jannaschia Wagner- Döblerら2003年
- ジャオリヘラ ・レカら。 2011年
- Kandeliimicrobium Wang et al . 2018年
- Kangsaoukela Lee et al . 2020年
- ラシモナス ・ゾン他2015
- Leisingera Schaefer et al . 2002年
- レンチバクター ・リーら2012
- リミバキュラム シン他2017
- リミマリコラ ・ワースとホイットマン 2018
- リトレイバクター ・ロマネンコら。 2011年
- Litorisediminicola Yoon et al . 2013年
- Litorisediminivivens Park et al . 2016年
- Litorivita Hetharua et al . 2018年
- ロクタネラ・ ヴァン・トラッペンら2004年
- ルティマリバクター ユン他2009
- マリポニア ・ユング他2016
- マメリエラ ・チェン他2010
- Mangrovicoccus Yu et al . 2018年
- マリビウス ・チョイ他2007
- マリモナス・ トンプロムら。 2017年
- マリニバクテリ ウム・リー他2015
- マリノヴム ・マルテンスら。 2006年
- マリチミバクター ・リー他2007
- マリヴィタ ・ファン他2009
- マリヴィベンス ・パーク他2016
- マインハルディモニア ・ヘルトら。 2020年
- Meridianimarinicoccus Ren et al . 2019年
- メチルアル キュラ ドロニナ他2000
- モナイバクテリウム ・チェルニコワら。 2017年
- Neptunicoccus Zhang et al . 2018年
- ネレイダ ・プジャルテ他2005
- Nioella Rajasabapathy et al . 2015年
- オセアニビウム チャン他2019
- オセアニセラ アルバカーキet al . 2012年
- オセアニコラ チョーとジョバンノーニ 2004
- オセアニグロ バス・リー他2017
- オクタデカバクター ゴシンクら1998
- パシフィシバクター ・ロマネンコら。 2011年
- Pacificitalea Hördtら。 2020年
- Paenimaribius Park et al . 2019年
- パエニロドバクター・ ワン他2014
- パレロニア・ マルティネス・チェカら2005年
- パラコッカス デイビス 1969 (承認リスト 1980)
- パラドンヒコラ ・リーら。 2019年
- パラフェオバクター ・カイら2017
- パラロド バクター・フォーセルら2013
- Parasedimentitalea Ding et al . 2020年
- パロセアニセラ・ コルリグ。劉ら。 2020年
- ペラギコラ・ キム他2008
- ペラギモナス ・ハーンケ他2013
- ペラギビルガ ・ジ他2018
- ペラゴヴム ・レン他2020
- Phaeobacter Martensら。 2006年
- フィココメス 朱他2019
- プランクトマリーナ ・ギーベルら。 2013年
- Planktotalea Hahnke et al . 2012年
- ポンティバカ ・キム他2010
- ポンティコッカス ・ファンとチョー 2008
- ポンティヴィ ベンス・パーク他2015
- ポセイドノセラ ・ロマネンコら。 2012年
- プリモルスキバクター ・ロマネンコら2011
- Profundibacter Le Moine Bauer et al . 2019年
- Profundibacterium Lai et al . 2013年
- 偽エスチュアリ ヴィタ・ヴィルトとホイットマン 2018
- シュードドンギコ ラ・ハミード他2014
- シュードゲモバクター スマン他2019
- シュードハロシンシバクター ・ウォン他2015
- Pseudomaribius Park et al . 2018年
- Pseudooceanicola Lai et al . 2015年
- シュードオクタデカバクター Billerbeck et al . 2015年
- Pseudophaeobacter Breider et al . 2014年
- 擬似原始細菌 Hördt et al . 2020
- シュードプニセイバクテリ ウムチャン 他2019
- シュードロドバクター ウチノ他2003
- 擬似ロゼイシクルス パーク他2016
- Pseudoruegeria Yoon他2007
- シュードセオハエイコラ ・パーク他2015
- プセウドチオ クラバ キムとリー 2020
- サイクロマリニバクター Qiao et al . 2017
- プキョンギエラ・ キム他2020
- Puniceibacterium Liu et al . 2014年
- Qingshengfaniella Wang他2021
- ロドバカ・ ミルフォード他2001
- ロドバクター ・イムホフら。 1984年
- ロドバキュラム・ ブライアンツエバ他2015
- Rhodophyticola Jung et al . 2019年
- ロドサリヌス ・グオ他2017
- Rhodovulum 平石、上田 1994
- ロセイバカ・ ラブレンツら。 2009年
- ロゼイバクテリ ウム鈴木ら2006
- ロゼイシトリウム ・ユウ他2011
- Roseicyclus Rathgeber et al . 2005
- ロゼイナトロノバクター ソロキンら2000
- Roseisalinus Labrenz et al . 2005年
- Ｒｏｓｅｉｖｉｖａｘ 鈴木ら。 1999年
- ロゼオバクター ・シバ 1991
- ロゼオヴァリウス ・ラブレンツら。 1999年
- Rubellimicrobium Denner et al . 2006年
- ルブリバクテリ ウムボルダレバ他2010
- ルブリセラ ・ヤン他2017
- ルブリモナス 鈴木ら。 1999年
- ルエゲリア ・ウチノ他1999
- サジツラ ・ゴンザレスら。 1997年
- サリニハビタンス ユン他2009
- サリノヴム ・ク他2017
- サリピガー ・マルティネス・カノバスら。 2004年
- Sedimentitalea Breider et al . 2014年
- Sediminimonas Wang et al . 2009年
- Seohaeicola Yoon他2009
- シミア ・チェとチョー 2006
- シリシモナス ・クレンら。 2016年
- シニルロドバクター ・コリグ。ヤンら。 2018年
- ソリロドバクター ・チュウ他2020
- サルフィトバクター・ ソロキン 1996
- Tabrizicola Tarhriz et al . 2014年
- タテヤマリア 倉橋・横田 2008
- タラソビウス ・アラハルら。 2005年
- タラソコッカス ・リー他2007
- チオクラバ・ ソロキン他2005
- Tranquillimonas Harwati et al . 2008年
- トリトニバクター クロッツら2018
- トロピシバクター ・ハルワティら2009
- トロピシモナス ハルワティ他2009
- ヴァニエリア ・ヘルト他2020
- ウェンキニア ・イン他2007
- Xinfangfangia Hu et al . 2018
- ユニア ・ワースとホイットマン 2018
- ヨンギモナス・ ハメードら。 2014年
暫定属
以下の属は公表されているが、細菌学規約に従って検証されていない：[3]
- 「Aliisedimentitalea」Kim et al . 2015年
- 「アルテリニオエラ」コングら。 2021年
- 「ファルシゲムモバクター」Li et al . 2020年
- 「ジンドニア」パークら。 2017年
- 「ケトグロニシゲニウム」コリッグ。アーバンスら。 2001年
- 「ニトロペラギ」ジョン＆リー 2016
- 「オセアニオヴァリブス」Liu et al . 2012年
- 「オセアノミクロビウム」Dai et al . 2021年
- 「ピエゾバクター」Takai et al . 2009年
- 「ピケイヌエラ」パーク他2021
- 「プラストルホドバクター」Xie et al . 2015年
- 「ポリモルファム」蔡他2011
- 「擬似ポンティヴィヴェンス」パーク他2018
- 「ロセイバキュラ」ヌヤンジーナ＝ボルダレワとゴレンコ 2014
- 「Zongyanglinia」Xu et al . 2021年
カンディダトゥス属
これまでに公表されているカンジダトゥス属は以下のとおりである: [3]
- 「カンジダトゥス・ハリコンドリイバクター」コリッグ。ノブロックら。 2019年
- 「Candidatus Kopriimonas」Quinn et al . 2012年
系統発生
現在受け入れられている分類法は、命名法に定められた原核生物名のリスト[3]に基づいており、系統発生は全ゲノム配列に基づいています。[4] [a]
参照
注記
- ^ アシディマングロビモナス、エストゥアリビウス、エストゥアリイコッカス、エストゥアリハビタンス、エスツアリウム、アガリシコラ、アルビルホドバクター、アリシミア、アルカリラクストリス、アルガイラ、アマリコッカス、アンタークチミクロビウム、アキコッカス、 アレニバチルス 、アレニバクテリウム、カリディカムス、チャチェザニア、ファルシロドバクター、フェルトイバクター、フルビバクテリウム、ハヒョンチレラ、ハロデュランティバクテリウム、ハロブルム、ヒスチジニバクテリウム、カンサウケラ、ラシモナス、リミバクルム、リトリセディミニニコラ、リトリセディミニビベンス、リトリビタ、マリモナス、メリディアンマリニコッカス、メチルアーキュラ、ニオエラ、オセアニビウム、パエニマリビウス、パラドンギコラ、パラフェオバクター、パラセディメンタレア、パロシアニセラ、ペラギビルガ、ペラゴブム、フィコカムス、プロフンディバクター、プロフンディバクテリウム、シュードゲモバクター、シュードハロシンチバクター、シュードマリビウス、シュードプニシバクテリウム、シュードセオヘイコラ、シュードチオクラバ、サイクロマリンバクター、プキョンギエラ、チンシェンファニエラ、ロドバキュラム、ロドフィティコラ、ロセイバカ、ロゼイバクテリウム、ロセイシクルス、ルブリバクテリウム、ルブリセラ、サリノヴム、セオヘイコラ、Sinirhodobacter、Solirhodobacter、Tateyamaria、Xinfangfangia、Youngimonas はこの系統樹には含まれていません。
参考文献
- ^ Rhodobacteraceae に関する NCBIウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。
- ^ パーカー、チャールズ・トーマス; ウィグリー、サラ; ギャリティ、ジョージ・M (2003 年 1 月 1 日)。パーカー、チャールズ・トーマス; ギャリティ、ジョージ・M (編)。「科の分類学的概要」。The NamesforLife Abstracts。doi : 10.1601/tx.1037。
- ^ abcd Euzéby JP, Parte AC. 「Rhodobacteraceae」。命名法で定められた原核生物名の一覧(LPSN) 。 2021年6月2日閲覧。
- ^ Hördt A, López MG, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, et al. (2020). 「1,000以上のタイプ株ゲノムの分析により、アルファプロテオバクテリアの分類が大幅に改善」. Frontiers in Microbiology . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689. PMID 32373076.
さらに読む
- Garrity GM、Holt JG (2001)。「古細菌と細菌の分類学的概要」。DR Boone、RW Castenholz (編)。Bergeyの系統的細菌学マニュアル第 1 巻: 古細菌と深く分岐した光合成細菌(第 2 版)。ニューヨーク: Springer Verlag。pp. 155–166。ISBN 978-0-387-98771-2。