ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| RN220 型番 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RNF220、C1orf164、リングフィンガータンパク質220、HLD23 |
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| 外部ID | オミム:616136; MGI : 1913993;ホモロジーン: 10036;ジーンカード:RNF220; OMA :RNF220 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 D1 | 始める | 117,128,660 bp [2] |
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| 終わり | 117,354,249 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - C1セグメント
- 前頭前皮質
- 右前頭葉
- 前帯状皮質
- 脳梁
- 小脳の右半球
- ブロードマン領域9
- 顆粒球
- 側坐核
- 扁桃体
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 受精卵
- 性器結節
- 精子細胞
- CA3フィールド
- 上前頭回
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 嗅周囲皮質
- 網膜の神経層
- 嗅内皮質
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
- ユビキチンタンパク質転移酵素活性
- トランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- タンパク質の自己ユビキチン化
- タンパク質のユビキチン化
- 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_018150 NM_001319956 NM_001319957 NM_001376486 NM_001376487
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NM_001376488 NM_001376489 NM_016501 |
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NM_025739 NM_001310729 NM_001310730 NM_001310731 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001306885 NP_001306886 NP_060620 NP_001363415 NP_001363416
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NP_001363417 NP_001363418 |
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NP_001297658 NP_001297659 NP_001297660 NP_080015 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 44.41 – 44.65 Mb | 4 章: 117.13 – 117.35 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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リングフィンガータンパク質220は、ヒトではRNF220遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000187147 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028677 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Zhang QH、Ye M、Wu XY、Ren SX、Zhao M、Zhao CJ、Fu G、Shen Y、Fan HY、Lu G、Zhong M、Xu XR、Han ZG、Zhang JW、Tao J、Huang QH、Zhou J、Hu GX、Gu J、Chen SJ、Chen Z (2000 年 11 月)。「CD34+ 造血幹細胞/前駆細胞で発現する 300 個の未定義遺伝子のオープンリーディングフレームを持つ cDNA のクローニングと機能解析」。Genome Res . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152。
- ^ 「Entrez Gene: C1orf164 染色体 1 オープンリーディングフレーム 164」。
さらに読む
- Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
- Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315– 21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」.遺伝子. 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.