ピロコッカス

ピロコッカス
	ピロコッカス・フリオサス
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	ユーリアキオータ
門:	ユーリアキオータ
クラス：	サーモコッカス
注文：	サーモコッカス
家族：	サーモコッカス科
属:	ピロコッカス; フィアラとステッター 1986
タイプ種
	ピロコッカス・フリオサス; フィアラとステッター 1986
種
	「P.アビッシ」; 「P. キトノファガス」; 「P.エンデアボリ」; P. フリオサス; P.グリコボランス; ホリコシイ; P. ククルカニ; P. ウォエセイ; P. ヤヤノシイ;

ピロコッカスは古細菌サーモコッカス亜科に。^[1]

説明と意義

ピロコッカスは、アーキオグロバスやメタノコッカスなどの他の熱独立栄養古細菌と、好熱性かつ嫌気性であるという点で類似した特徴を持っています。しかし、ピロコッカスは、最適成長温度が約 100 °C であり、他の古細菌よりも深い海に生息する点で異なります。ピロコッカスを研究することで、高温や高圧などの極端な環境条件に耐えるために使用されている可能性のあるメカニズムについての洞察が得られます。

系統発生

ゲノム構造

Pyrococcus属の 3 種の配列が決定されている。P . furiosusは 1.9 Mb で最大であり、P. abyssiが 1.8 Mb、P. horikoshiiが 1.7 Mb である。^[要出典]ゲノムは多くの異なる代謝酵素をコード化しており、幅広い有機物質を輸送および代謝できるため、より広範囲の生活条件に対応できる。種間でも変異が検出されている。

細胞構造と代謝

Pyrococcusの細胞は約 0.8～2 μm で、やや不規則な形状の球菌です。極性のある鞭毛の集まりを示し、細胞膜の周囲をペリプラズム空間で囲む S 層で包まれています。Pyrococcus属は嫌気性ですが、代謝に関しては若干異なります。ペプチド発酵が主な代謝経路ですが、 P. furiosusとP. abyssiはデンプン、麦芽糖、ピルビン酸で増殖が観察されていますが、 P. horikoshiiでは観察されていません。成長には元素硫黄の存在は必要ありませんが、S ^oを添加すると成長が促進されます。^[^{出典が必要}^]

エコロジー

パイロコッカス属の種は、熱水噴出孔のような非常に高温の環境に生息しています。最適な生育条件は、pH レベル約 7、塩分濃度約 2.5%、温度約 98 °C です。この高温で生育すると、沸点では酸素がほとんど利用できなくなるため、嫌気性になるのは当然です。P . abyssi が発見された熱水噴出孔の例では、太陽光はなく、圧力は約 200 気圧で、温度も非常に高いです。

参照

古細菌の属の一覧

参考文献

^ Pyrococcus に関する NCBIウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。
^ 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

さらに読む

Elshawadfy, Ashraf M.; Keith, Brian J.; Ooi, H'Ng Ee; Kinsman, Thomas; et al. (2014 年 5 月 27 日)。「Pyrococcus furiosus および Thermococcus kodakarensis のファミリー B 酵素由来の DNA ポリメラーゼハイブリッド: ポリメラーゼ連鎖反応のパフォーマンス向上」。Frontiers in Microbiology。5 : 224 –。doi : 10.3389 / fmicb.2014.00224。PMC 4034419。PMID 24904539。
Fiala G; Stetter KO (1986)。「Pyrococcus furiosus sp. nov. は、100 °C で最適に成長する海洋従属栄養古細菌の新しい属です」。Arch . Microbiol . 145 : 56–61. doi :10.1007/BF00413027. S2CID 41589578。
Zillig W; Holz I; Klenk HP; Trent J; et al. (1987). 「Pyrococcus woesei, sp. nov.、新種の超好熱性海洋古細菌、Thermococcales 目を代表する」Syst. Appl. Microbiol . 9 (1–2): 62–70. doi :10.1016/S0723-2020(87)80057-7.

[1] ^ Pyrococcus に関する NCBIウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。

[2] 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。

[3] 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。

[4] 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。

[about-5] 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

[tree-6] "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。

[taxon_history-7] 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。