ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PPEF2 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | PPEF2、PPP7CB、EFハンドドメイン2を持つタンパク質ホスファターゼ |
|---|
| 外部ID | オミム:602256; MGI : 1342304;ホモロジーン: 55959;ジーンカード:PPEF2; OMA :PPEF2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 5|5 E2 | 始める | 92,374,538 bp [2] |
|---|
| 終わり | 92,404,137 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 睾丸
- 腓腹筋
- 右子宮管
- 小脳の右半球
- 横行結腸粘膜
- 左子宮管
- 胸部大動脈下行
- 左卵巣
- 子宮体部
- 単球
|
| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 網膜色素上皮
- 水晶体上皮
- 松果体
- 胚
- 桑実胚
- 胚
- 胎児の尾
- 脊髄の腰椎部分
- 受精卵
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS | |
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- 鉄イオン結合
- Hsp90タンパク質結合
- カルシウムイオン結合
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性
- マンガンイオン結合
- マイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼ結合
- タンパク質セリン/スレオニンホスファターゼ活性
- 金属イオン結合
- Hsp70タンパク質結合
- 加水分解酵素活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞投影
- 光受容体内節
- 光受容体外節
- 繊毛
- 細胞質
- 核
| | 生物学的プロセス |
- 感覚知覚に関わる刺激の検出
- 刺激に対する反応
- ペプチジルスレオニンリン酸化の負の制御
- タンパク質の脱リン酸化
- MAPKカスケードの負の制御
- MAPキナーゼ活性の調節
- 視覚
- JUNキナーゼ活性の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_006239 NM_152933 NM_152934 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | | |
|---|
| 場所 (UCSC) | 4 章: 75.86 – 75.9 Mb | 5 章: 92.37 – 92.4 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
EFハンドドメイン2を持つタンパク質ホスファターゼは、ヒトではPPEF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。
[5]
関数
この遺伝子は、EF ハンド モチーフ ファミリーを持つセリン/スレオニン タンパク質ホスファターゼのメンバーをコードします。このタンパク質には、タンパク質ホスファターゼ触媒ドメインと、その C 末端に少なくとも 2 つの EF ハンド カルシウム結合モチーフが含まれます。その基質は不明ですが、コードされているタンパク質は、光受容体と松果体で特異的に発現し、視覚系で役割を果たしていると示唆されています。この遺伝子は、ショウジョウバエ網膜変性 C (rdgC) 遺伝子と高い配列類似性を共有しています。[RefSeq 提供、2008 年 7 月]。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000156194 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029410 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: EFハンドドメイン2を持つタンパク質ホスファターゼ」。2018年2月8日閲覧。
さらに読む
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。