フィトバクター

フィトバクター
MacConkey 寒天培地上のP. diazotrophicusのコロニー。
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	ガンマプロテオバクテリア
注文：	腸内細菌
家族：	腸内細菌科
属:	フィトバクター 張ら2008​
タイプ種
フィトバクター・ジアゾトロフィカス
種
P. ジアゾトロフィカス P. ウルシンギ P. パルマエ P. マシリエンシス

フィトバクターは、以前は腸内細菌科のさまざまな属に割り当てられていた分離株のグループから生まれたグラム陰性 細菌の属です、中国の野生イネからの窒素固定分離株に基づいて最初に確立されました^{が、 [1]} 2013年にブラジルの複数州で発生した敗血症の発生時に得られた多くの分離株も含まれており^{[2] [3]}、遡及的に、米国で1970年代に分離されたいくつかの臨床株は、現在でも培養コレクションで利用可能であり、もともとはエルウィニア・ヘルビコラ-エンテロバクター・アグロメランス複合体 (EEC) のブレンナーバイオタイプXIIに分類されていました。 ^{[4] [5]標準的な生化学評価パネルのデータベースには}フィトバクター属が含まれていないため、他の腸内細菌科の種、特にパントエア・アグロメランスと誤認されることがよくあります。 ^[2]この種の臨床分離株は、通常遺伝的可動性要素によって媒介される、広域スペクトルβ-ラクタマーゼおよびカルバペネム耐性遺伝子の重要な発生源であることが確認されている。同時感染する感受性細菌に対する強力な防御も報告されている。 ^[6]この属に属する細菌は色素を持たず、化学有機栄養性で、窒素固定が可能である。乳糖発酵性で、シトクロム酸化酵素陰性、カタラーゼ陽性である。グルコースは発酵してガスを生成する。マッコンキー寒天培地（MAC）上で生育するコロニーは円形で凸型かつ滑らかで、縁は完全ではなく、中央が隆起しているのが普通である。現在3種がPhytobacter属に有効に含まれており、^{[2] [7]}最近再検討された腸内細菌科のKosakoniaクレードに依然として含まれている^{。 [8]最近、} Metakosakonia属とPhytobacter属を統合し、 4番目の種であるPhytobacter massiliensisを追加すること。 ^[9]

EECは、1888年にMW Beijerinck ^{[10]によって}Bacillus agglomeransとして初めて記載され、後に Ewing と Fife によってEnterobacter agglomerans [ ^11]に再分類されましたが、分類ツールの進化に伴い、多くの名前の変更と分類の更新が行われてきました。1984年に、Brenner と同僚は、DNA-DNA ハイブリダイゼーション テストを使用して、EEC を 13 の DNA 関連性グループ (バイオタイプ) に分割し、I から XIII まで番号を付けました。^{[12] 1989年に、Françoise Gavini と同僚は、} Enterobacter agglomerans (以前はバイオタイプ I と XIII に含まれていました) をPantoea agglomeransに改名することを提案しました。 ^[11]一方、バイオタイプ XII の特性評価からPhytobacter属が生まれました。 ^[2]

• フィトバクター・ディアゾトロフィカスは、環境やヒトから回収される最も一般的なフィトバクター種であり、汚染されたカテーテルや完全静脈栄養法の使用に関連する日和見病原体である。^{[2] [4]}
• Phytobacter ursingiiは、 D-セリンとL-ソルボースを代謝する能力に基づいて、生化学的にPhytobacter diazotrophicusと区別することができます。窒素固定遺伝子の存在は環境起源を示唆していますが、これまでのところこの種の臨床分離株のみが報告されています。^[2]
• フィトバクター・パルマエは窒素固定能力の高い菌種で、シンガポールで初めてアブラヤシ（Elaeis guineensis）の葉組織から特定された。^[7]
• Phytobacter massiliensisは、そのタイプ株JC163 ^Tが健康なセネガル人の患者の糞便細菌叢から分離され、窒素固定遺伝子を持っていない。^{[9] [13]}